生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 9 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Scaling logical density of DNA storage with enzymatically-ligated composite motifs
2023-09-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43172-0
PMID:37749195
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研究论文 | 本文提出了一种使用复合模体作为构建块来降低合成成本并提高逻辑密度的DNA存储框架 | 引入了桥接寡核苷酸组装技术进行酶促连接合成寡核苷酸，以及直接寡核苷酸测序技术和Motif-Search共识调用器进行数据解码 | NA | 旨在解决DNA存储中的合成成本问题 | DNA存储技术 | 生物信息学 | NA | 酶促连接技术，纳米孔测序技术 | NA | DNA序列 | 存储了文本“HelloWorld”，逻辑密度达到84比特/周期 |
| 2 | 2024-08-07 |
Three-input logic gate based on DNA strand displacement reaction
2023-09-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42383-9
PMID:37709846
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研究论文 | 本文基于DNA链置换反应设计了三种三输入逻辑门，包括三输入OR逻辑门、三输入AND逻辑门和三输入MAJORITY逻辑门 | 利用DNA链置换技术设计并验证了三输入逻辑门，展示了其在DNA计算中的重要应用价值 | NA | 设计并验证基于DNA链置换反应的三输入逻辑门 | 三输入逻辑门的设计与实现 | NA | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA链 | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Parallel molecular computation on digital data stored in DNA
2023-09-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217330120
PMID:37669382
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研究论文 | 本文通过利用DNA链置换反应，在DNA存储的数据上实现并行的分子计算 | 提出了一种新的方法，通过DNA链置换反应在DNA存储的数据上进行并行分子计算，展示了二进制计数和图灵通用细胞自动机规则110的程序 | NA | 探索在DNA存储的数据上进行并行分子计算的可能性 | DNA存储的数据及其并行分子计算 | 生物信息学 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | 使用了来自M13噬菌体的天然DNA序列，进行了244次不同的链交换 |
| 4 | 2024-08-07 |
Reducing cost in DNA-based data storage by sequence analysis-aided soft information decoding of variable-length reads
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad548
PMID:37669160
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研究论文 | 本文提出了一种通过序列分析辅助的软信息解码方法，用于降低基于DNA的数据存储的成本，并实现了编码和解码过程。 | 引入了新的聚类和比对方法，以及在序列分析辅助解码过程中使用编辑距离和质量分数，有效提高了解码性能并减少了异常读取。 | NA | 旨在降低基于DNA的数据存储的写入和读取成本。 | 基于DNA的数据存储技术。 | 生物信息学 | NA | 低密度奇偶校验码（LDPC） | NA | DNA序列 | 存储了548.83 KB的图像文件 |
| 5 | 2024-08-07 |
Material-level countermeasures for securing microfluidic biochips
2023-09-26, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00335c
PMID:37605818
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研究论文 | 本文提出了一种针对基于聚二甲基硅氧烷（PDMS）的微流控生物芯片的动态材料级水印方案，并使用机器学习模型检测制造过程中的异常 | 引入了一种新的动态材料级水印技术，以及使用机器学习模型来检测PDMS固化比率异常 | NA | 开发针对微流控生物芯片的材料级防护措施 | 微流控生物芯片及其在生物计算、临床诊断和即时检测中的应用 | NA | NA | 机器学习 | NA | 荧光数据 | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
DUHI: Dynamically updated hash index clustering method for DNA storage
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107244
PMID:37453377
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研究论文 | 本文提出了一种动态更新哈希索引（DUHI）聚类方法，用于解决DNA存储过程中的高冗余问题 | DUHI聚类方法通过构建动态核心索引集和使用哈希查找，能够减少序列簇内的冗余并提高序列的重建率 | NA | 解决DNA序列聚类后的高冗余问题，提高数据读取的准确性 | DNA存储过程中的数据冗余和读取准确性 | 生物信息学 | NA | 哈希索引 | 聚类方法 | DNA序列 | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
An Aptamer-Functionalized DNA Circuit to Establish an Artificial Interaction between T Cells and Cancer Cells
2023-09-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307656
PMID:37423897
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research paper | 本研究开发了一种适体功能化的DNA电路，用于调节T细胞与癌细胞之间的相互作用 | 该DNA电路由识别-触发和聚集-激活模块组成，能够在识别目标癌细胞后，释放触发链诱导T细胞表面免疫受体的聚集，从而增强T细胞活性，有效消除癌细胞 | NA | 探索非遗传策略以控制细胞间相互作用网络，特别是在基于T细胞的癌症免疫治疗中 | T细胞与癌细胞的相互作用 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
High Net Information Density DNA Data Storage by the MOPE Encoding Algorithm
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3263521
PMID:37015121
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研究论文 | 本文提出了一种名为MOPE的高效、可行且高度鲁棒的DNA数据存储编码算法 | MOPE算法通过改进的Barnacles Mating Optimizer和Payload Encoding算法，提高了非负载编码集的下限，并实现了接近理想信息容量的净信息密度 | NA | 提高DNA数据存储的效率和可靠性 | DNA数据存储编码算法 | 生物信息学 | NA | DNA数据存储 | MOPE算法 | DNA序列 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
A Novel Image Encryption Scheme for DNA Storage Systems Based on DNA Hybridization and Gene Mutation
2023-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00565-z
PMID:37016040
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA杂交和基因突变的DNA存储系统图像加密算法 | 利用分子生物学的信息处理机制，通过基因杂交进行像素替换，并通过像素扩散和基因突变实现双重扩散 | NA | 解决DNA存储系统中的信息安全问题 | DNA存储系统中的图像加密 | 生物信息学 | NA | DNA杂交，基因突变 | NA | 图像 | NA |