生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 86 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
High Net Information Density DNA Data Storage by the MOPE Encoding Algorithm
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3263521
PMID:37015121
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研究论文 | 本文提出了一种名为MOPE的高效、可行且高度鲁棒的DNA数据存储编码算法 | MOPE算法通过改进的Barnacles Mating Optimizer和Payload Encoding算法，提高了非负载编码集的下限，并实现了接近理想信息容量的净信息密度 | NA | 提高DNA数据存储的效率和可靠性 | DNA数据存储编码算法 | 生物信息学 | NA | DNA数据存储 | MOPE算法 | DNA序列 | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
A Novel Image Encryption Scheme for DNA Storage Systems Based on DNA Hybridization and Gene Mutation
2023-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00565-z
PMID:37016040
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA杂交和基因突变的DNA存储系统图像加密算法 | 利用分子生物学的信息处理机制，通过基因杂交进行像素替换，并通过像素扩散和基因突变实现双重扩散 | NA | 解决DNA存储系统中的信息安全问题 | DNA存储系统中的图像加密 | 生物信息学 | NA | DNA杂交，基因突变 | NA | 图像 | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Construction of a self-sufficient DNA circuit for amplified detection of kanamycin
2023-Aug-30, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2023.136048
PMID:36996659
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研究论文 | 本文介绍了一种无需酶的自驱动杂交链反应（SHCR）放大器，用于高灵敏度检测动物源性食品中的卡那霉素残留 | 提出了一种简单而稳健的非酶自驱动杂交链反应（SHCR）放大器，其灵敏度比传统HCR电路高5800倍 | NA | 开发一种高灵敏度和可靠性的方法，用于检测食品中的卡那霉素残留 | 卡那霉素在缓冲液、牛奶和蜂蜜样品中的检测 | 生物技术 | NA | 杂交链反应（SHCR） | NA | DNA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Multifunctional Exo III-assisted scalability strategy for constructing DNA molecular logic circuits
2023-May-02, The Analyst
DOI:10.1039/d3an00086a
PMID:36994799
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研究论文 | 本文提出了一种双链分离（DSS）策略，结合toehold介导的链置换和多功能核酸酶Exo III，用于构建DNA分子逻辑电路 | 该策略利用Exo III的核酸酶功能，通过链置换反应产生的双链废物进一步水解，生成额外的输出信号，实现了分子逻辑电路的有效可扩展性 | NA | 开发简单有效的可扩展方法，用于构建复杂的DNA逻辑电路 | DNA分子逻辑电路的构建 | 生物技术 | NA | toehold介导的链置换反应，Exo III核酸酶 | NA | DNA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Organoid intelligence (OI) - The ultimate functionality of a brain microphysiological system
2023, ALTEX
DOI:10.14573/altex.2303261
PMID:37009773
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研究论文 | 本文探讨了通过结合尖端人工智能与脑微生理系统（MPS）研究，实现器官智能（OI）作为合成生物智能的可能性 | 提出将人工智能与脑微生理系统结合，实现认知功能和长期记忆能力，并用于神经发育和神经功能的研究以及药物和化学测试 | 文章提出了伦理问题，如感知和意识的起点以及干细胞捐赠者与OI系统之间的关系，这些需要在社会可接受的范围内进行讨论 | 旨在通过生物计算的前沿进展，创建智能盘模型以研究人类认知功能的基础，并提供模型以推进对神经疾病有毒物质的研究和识别治疗神经疾病的补救措施 | 研究对象包括人类认知功能、神经疾病的有毒物质以及生物计算能力 | 生物工程 | NA | 脑微生理系统（MPS） | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Programmable DNA Circuit-Facilitated Determination of Circulating Extracellular Vesicle PD-L1 for Lung Cancer Diagnosis and Immunotherapy Response Prediction
2023-Apr-12, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c01607
PMID:36978260
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research paper | 本文提出了一种基于可编程DNA电路的荧光生物传感方法，用于敏感且准确地检测循环外泌体PD-L1，以辅助肺癌诊断和免疫治疗反应预测。 | 利用磷脂酰丝氨酸靶向肽辅助磁性富集和可编程DNA电路，将PD-L1的存在转化为循环外泌体表面的双链DNA探针的形成，并通过CRISPR/Cas12a系统的反式切割活性产生显著的荧光信号。 | NA | 开发一种新的生物传感方法，用于检测循环外泌体PD-L1，以辅助肺癌的诊断和免疫治疗反应的预测。 | 循环外泌体PD-L1 | digital pathology | lung cancer | CRISPR/Cas12a | NA | fluorescence signal | 检测限为67颗粒/mL |
| 67 | 2024-08-07 |
The emerging landscape of microfluidic applications in DNA data storage
2023-04-12, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00972b
PMID:36946437
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综述 | 本文综述了微流控技术在DNA数据存储领域的应用进展 | 微流控技术能够以大规模并行和高度集成的方式处理和加工微尺度流体样本，被认为是解决DNA数据存储中高材料成本和数据读写时间消耗等问题的有前景的候选技术 | 目前DNA存储技术仍未达到实际应用水平，主要受限于高材料成本、数据读写时间消耗以及缺乏全面、自动化和集成系统 | 探讨微流控技术在推进DNA数据存储发展中的应用，并展望未来如何将微流控技术与DNA数据存储进一步融合，实现真正集成系统并达到实际应用 | 微流控技术在DNA数据存储中的应用 | NA | NA | 微流控技术 | NA | DNA数据 | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Controllable DNA nanodevices regulated by logic gates for multi-stimulus recognition
2023-Mar-14, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d3ra00295k
PMID:36950078
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研究论文 | 本文开发了一种可控的DNA纳米装置，通过逻辑门调控，实现对多种刺激的识别 | 提出了一种结构切换的生物传感器策略，该策略能够同时响应外部刺激并保持传感能力 | NA | 构建具有传感与响应外部刺激能力的可控纳米装置 | DNA纳米装置及其在环境监测和医学诊断中的应用 | NA | NA | DNA纳米技术 | 逻辑门 | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
DNA Sequence Optimization Design of Arithmetic Optimization Algorithm Based on Billiard Hitting Strategy
2023-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00559-x
PMID:36922455
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研究论文 | 本文提出了一种基于台球碰撞策略的改进算术优化算法，用于优化DNA序列设计 | 引入了优质点集初始化、台球碰撞策略、随机透镜对立学习机制和和谐搜索算法，以提高优化效率和全局搜索范围，并增强算法摆脱局部最优的能力 | NA | 优化DNA序列设计，以满足DNA计算的需求 | DNA序列 | 生物信息学 | NA | 算术优化算法 | 台球算法 | DNA序列 | 12个基准函数和六种其他算法用于比较和消融实验 |
| 70 | 2024-08-07 |
DNA strand displacement based computational systems and their applications
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1120791
PMID:36911397
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综述 | 本文综述了基于DNA链置换（DSD）的计算系统的最新发展和应用 | DSD是构建DNA计算系统最简单但最有效的方法，可用于构建逻辑门、集成电路和人工神经网络等 | NA | 探讨基于DNA链置换的计算系统的最新进展及其应用 | DNA计算系统及其在逻辑门、集成电路和人工神经网络中的应用 | 生物计算 | NA | DNA链置换（DSD） | NA | DNA序列 | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
A DNA Finite-State Machine Based on the Programmable Allosteric Strategy of DNAzyme
2023-Feb-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24043588
PMID:36834996
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research paper | 本文提出了一种基于DNAzyme可编程变构策略的DNA有限状态机，能够动态响应顺序刺激信号 | 开发了一种可编程变构DNAzyme策略，通过可重构的DNA发夹实现DNAzyme构象的可编程控制，并基于此策略实现了具有两种状态的有限状态机，进一步通过模块化设计实现了五种状态的有限状态机 | NA | 开发和设计能够处理时间相关信息的纳米器件，促进分子信息处理系统的发展 | DNA有限状态机及其在分子信息系统和纳米技术中的应用 | NA | NA | DNAzyme | 有限状态机 | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
DNA storage-from natural biology to synthetic biology
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.01.045
PMID:36817961
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研究论文 | 本文讨论了DNA存储的基本方面及其在自然生物学和合成生物学中的最新进展，特别强调了可以利用的自然过程和解决方案 | 提出了受自然启发的DNA和核苷酸存储的新方法，以及基于DNA的信息存储可能成为当前电子数据存储系统的自然补充 | NA | 探讨DNA存储在生物技术和人类遗传学中的应用，以及作为合成生物学方法的可能性 | DNA存储的自然过程和合成生物学应用 | 生物技术 | NA | DNA存储技术 | NA | DNA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
A universal and specific RNA biosensor via DNA circuit-mediated PAM-independent CRISPR/Cas12a and PolyA-rolling circle amplification
2023-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2023.115139
PMID:36774734
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA电路介导的PAM非依赖型CRISPR/Cas12a与PolyA滚环扩增的通用且特异的RNA生物传感器，即DCPRBiosensor | DCPRBiosensor去除了CRISPR/Cas12a的PAM限制，实现了RNA检测的简单、廉价、高灵敏度，并具有创新性的特异性和通用性 | NA | 开发一种易于使用、成本低廉、特异且通用的基于CRISPR/Cas12a的RNA检测系统，以促进其在分子诊断中的应用 | RNA检测技术及其在分子诊断中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas12a, PolyA滚环扩增 | DNA电路 | RNA | 检测了四种piRNAs，并在DLD-1和HCT-116细胞及尿液混合样本中进行了验证 |
| 74 | 2024-08-07 |
Tailoring a Minimal Self-Replicate DNA Circuit for Highly Efficient Intracellular Imaging of microRNA
2023-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202207961
PMID:36717281
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研究论文 | 本文提出了一种最小化的非酶自复制DNA电路系统（SDC），用于在活细胞中高效生物传感 | 通过单一的基本级联杂交反应（CHR）的自堆叠，设计了一种具有高信号增益和经济有效的放大途径的SDC系统 | NA | 开发一种简单而健壮的自足分子电路，用于复杂细胞内环境中痕量分析物的检测 | 微小RNA（miRNA）的检测 | 分子生物学 | NA | DNA电路技术 | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Metal-Organic Frameworks in Microfluidics Enable Fast Encapsulation/Extraction of DNA for Automated and Integrated Data Storage
2023-02-14, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.2c11241
PMID:36728704
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research paper | 本文报道了一种利用金属有机框架（MOFs）在微流控芯片中快速封装和提取DNA的微型文库，用于自动化和集成的DNA数据存储。 | 该方法能够在10分钟内封装DNA，并在5分钟内提取，增强了数据编码DNA在恶劣环境下的稳定性，且无需特殊设备。 | NA | 开发一种快速、稳定且无需特殊设备的DNA数据存储方法。 | DNA数据存储的稳定性和提取速度。 | NA | NA | 微流控技术 | NA | DNA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
An Algorithm-optimized Scheme for In situ Synthesis of DNA Microarrays
2023, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本文提出了一种基于算法优化的DNA微阵列原位合成方案，旨在降低DNA合成的成本 | 通过数据分级和并行合成策略，减少了合成周期，提高了合成效率 | NA | 寻找一种算法优化的方案，用于DNA微阵列的原位合成，以降低DNA合成的成本 | DNA微阵列的原位合成 | 合成生物学 | NA | NA | 优化算法 | 序列数据 | 12,000个序列 |
| 77 | 2024-08-07 |
A versatile and convenient tool for regulation of DNA strand displacement and post-modification on pre-fabricated DNA nanodevices
2023-01-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1193
PMID:36537218
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cap的新型调控工具，用于DNA链置换反应的微调及预制DNA纳米器件的后修饰 | Cap工具能够在不改变原始反应序列的情况下，实现对DNA链置换反应速率的微调及可擦除性，并进一步开发了三种高级功能，实现了对预制DNA电路的个性化定制后修饰 | NA | 开发一种新型调控工具，以实现对DNA纳米技术的标准化、包装化设备的个性化后修饰 | DNA链置换反应及预制DNA纳米器件 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Construction of a scalable DNA computing nano-system for large-scale and complex logical operations
2023-01-30, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d2nh00525e
PMID:36524605
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研究论文 | 本研究设计了一种基于多功能DNA纳米结构的反应平台，实现了大规模和复杂逻辑运算的可扩展DNA计算系统 | 首次成功进行了连续整数的平方根和立方根计算，并保留了小数点后两位数字 | NA | 解决DNA计算中逻辑电路操作范围的扩展和电路集成与可扩展性的关键问题 | DNA计算系统的可扩展性和复杂逻辑运算能力 | 生物计算 | NA | DNA纳米技术 | NA | 荧光信号 | NA |
| 79 | 2024-08-07 |
Colorimetric aptasensor for the sensitive detection of ochratoxin A based on a triple cascade amplification strategy
2023-Jan-02, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2022.340616
PMID:36442942
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research paper | 本文介绍了一种基于三重级联放大策略的比色适体传感器，用于高灵敏度检测赭曲霉素A。 | 该研究采用了熵驱动DNA电路、催化发夹组装和Mg辅助DNA酶催化三重级联放大策略，显著提高了检测灵敏度和选择性。 | NA | 开发一种灵敏、准确、简单且成本效益高的检测方法，以保障食品安全和质量控制。 | 赭曲霉素A的检测。 | NA | NA | 比色法 | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
Multiple errors correction for position-limited DNA sequences with GC balance and no homopolymer for DNA-based data storage
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac484
PMID:36410731
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研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-LC的新型编码方案，用于在DNA数据存储中减少和纠正插入、删除和替换错误，该方案能将二进制序列转换为满足GC平衡和游程限制的DNA碱基序列 | DNA-LC编码模式能够检测并纠正多重错误，其错误纠正能力高于针对单链中单个错误纠正的其他方法 | NA | 旨在减少和纠正DNA数据存储中的错误 | DNA序列中的插入、删除和替换错误 | NA | NA | NA | NA | DNA序列 | NA |