生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 86 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
N/S-Co-doped carbon dot-based FRET ratiometric fluorescence aptasensing platform modulated with entropy-driven DNA amplifier for ochratoxin A detection
2023-Aug, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04778-5
PMID:37306781
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研究论文 | 本研究提出了一种基于氮硫共掺杂碳点（N/S-CD）的FRET比率荧光适体传感策略，结合熵驱动的DNA放大器，用于灵敏和准确检测赭曲霉素A（OTA） | 该策略通过熵驱动的DNA电路和Cu放大器的协同放大，显著提高了检测性能 | NA | 开发一种新型的高灵敏度和准确度的赭曲霉素A检测方法 | 赭曲霉素A的检测 | 生物传感技术 | 食品污染 | FRET比率荧光适体传感技术 | NA | 荧光信号 | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
A Robust and Efficient DNA Storage Architecture Based on Modulation Encoding and Decoding
2023-06-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.3c00629
PMID:37289182
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研究论文 | 本文提出了一种基于调制编码和解码的DNA存储架构，以解决合成DNA数据存储中的随机插入-删除-替换（IDS）错误问题 | 利用通信领域的调制技术，将二进制数据调制成具有相同AT/GC模式的DNA序列，便于检测噪声读取中的插入和删除错误 | 该方法的逻辑密度相对较低，为1.0比特/nt | 提高DNA存储的可靠性和效率 | 合成DNA数据存储中的IDS错误 | NA | NA | 调制编码和解码 | NA | DNA序列 | 实验包括模拟数据集和真实数据集 |
| 43 | 2024-08-07 |
Programming DNA Circuits for Controlled Immunostimulation through CpG Oligodeoxynucleotide Delivery
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09359
PMID:37267596
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研究论文 | 本文介绍了一种用于递送具有药理免疫刺激功能的CpG寡脱氧核苷酸（CpG ODNs）的DNA电路 | 通过编程DNA电路控制CpG ODN的释放，实现了急性且强效的免疫刺激，与无控制的CpG ODN释放系统相比，具有更快的响应 | NA | 探索DNA电路在控制DNA链药理活性方面的潜力，用于受控药物递送 | DNA电路的设计、DNA双链浓度、T7核酸外切酶浓度对电路动力学和时间行为的影响 | 生物技术 | NA | CpG寡脱氧核苷酸递送 | NA | DNA | 使用了HEK工程细胞系和J774A.1巨噬细胞进行体外激活实验 |
| 44 | 2024-08-07 |
Accelerating Cell-Free Biosensors by Entropy-Driven Assembly of Transcription Templates
2023-06-13, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c01090
PMID:37261725
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研究论文 | 本文介绍了一种通过熵驱动组装转录模板的方法来加速无细胞转录过程，以提高无细胞生物传感器的效率和选择性。 | 提出了一种新的熵驱动组装转录模板的方法，作为动态放大模块，显著加速了无细胞转录系统，且不受多种酶的干扰。 | NA | 旨在提高无细胞生物传感器的生产效率和应用范围。 | 无细胞转录系统及其在生物生产、环境监测和疾病诊断中的应用。 | 生物技术 | 传染病 | 无细胞生物合成 | NA | RNA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Control of Reversible Formation and Dispersion of the Three Enzyme Networks Integrating DNA Computing
2023-06-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00924
PMID:37253150
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研究论文 | 本研究报告了通过三叉分支DNA结构单元组装的三酶复合网络的形成和分散，并展示了这种网络在控制酶级联反应活性和乳腺癌生物标志物的检测中的应用 | 首次实现了通过单链DNA、RNA和酶实现三酶复合网络的可逆形成和分散，并将其集成到DNA计算中，为生物或环境传感提供了一个新的平台 | NA | 探索通过DNA纳米技术实现酶级联反应的高效控制和生物标志物的检测 | 三酶复合网络的形成和分散机制及其在生物标志物检测中的应用 | 生物技术 | 乳腺癌 | DNA纳米技术 | NA | DNA、RNA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Chemiluminescence resonance energy transfer-based multistage nucleic acid amplification circuits for MiRNA detection with low background
2023-Jun-12, The Analyst
DOI:10.1039/d3an00594a
PMID:37195805
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研究论文 | 本文构建了一种基于化学发光共振能量转移（CRET）的多级核酸扩增电路，用于低背景下的miRNA检测和细胞成像。 | 通过巧妙的可编程催化发夹组装（CHA）、杂交链反应（HCR）和DNAzyme的使用，实现了目标触发下供体和受体之间距离的精确调控，从而增强了化学发光信号。 | NA | 开发一种高灵敏度、低背景的miRNA检测方法，并实现细胞内miRNA的成像。 | miRNA的检测和细胞内成像。 | 生物传感技术 | NA | 化学发光共振能量转移（CRET） | DNA电路 | 化学发光信号 | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Study on DNA Storage Encoding Based IAOA under Innovation Constraints
2023-Apr-18, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45040233
PMID:37185757
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研究论文 | 本文提出了一种基于双匹配和错误配对约束的方法，以提高DNA编码集的质量，从而减少存储过程中DNA序列的不稳定性导致的错误 | 引入了随机扰动基本函数和双重自适应加权策略，改进了算术优化算法（IAOA），并在DNA编码设计中应用了新的约束条件 | NA | 解决传统存储介质无法满足当前数据存储需求的问题，利用DNA的高存储容量和持久性优势 | DNA存储中的编码质量和稳定性 | 生物信息学 | NA | DNA存储技术 | 算术优化算法（IAOA） | DNA序列 | 13个基准函数 |
| 48 | 2024-08-07 |
PRO-Simat: Protein network simulation and design tool
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.04.023
PMID:37181657
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研究论文 | PRO-Simat是一个用于分析蛋白质相互作用网络、动态变化及路径工程的模拟工具 | 集成了Jimena框架进行动态网络模拟，快速有效地模拟布尔遗传调控网络，并提供深入的蛋白质相互作用类型、强度、持续时间和路径的分析 | NA | 开发一个用于蛋白质网络模拟和设计的工具 | 蛋白质相互作用网络及其动态变化和路径工程 | 生物信息学 | NA | 网络模拟 | 布尔遗传调控网络 | 蛋白质相互作用数据 | 超过800万蛋白质相互作用数据，涵盖32种模型生物及人类蛋白质组 |
| 49 | 2024-08-07 |
DNA storage in thermoresponsive microcapsules for repeated random multiplexed data access
2023-08, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-023-01377-4
PMID:37142708
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研究论文 | 本文报道了一种基于热响应性微胶囊的DNA存储系统，该系统能够实现多次随机并行数据访问 | 提出了一种基于热限制的聚合酶链反应技术，使得DNA文件能够在分隔的微胶囊中进行多次随机并行访问 | NA | 开发一种可扩展的DNA存储系统，实现多次随机并行数据访问 | 热响应性微胶囊中的DNA存储技术 | 生物技术 | NA | 聚合酶链反应（PCR） | NA | DNA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
An image cryptography method by highly error-prone DNA storage channel
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1173763
PMID:37152655
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研究论文 | 本文提出了一种基于调制存储架构的图像加密方法，利用不可预测的调制信号在高度错误倾向的DNA存储通道中加密图像 | 本文的创新点在于利用DNA存储通道的不可预测性进行图像加密，提高了数据安全性 | NA | 研究如何在DNA存储系统中实现数据安全 | 图像加密方法 | 计算机视觉 | NA | DNA存储 | NA | 图像 | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
DNA Origami: Recent Progress and Applications
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3028-0_1
PMID:37166708
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review | 本章探讨了DNA折纸的基本概念及其多种类型 | 展示了过去15年中结构DNA纳米技术取得的进展，强调了DNA折纸在构建2D和3D复杂结构方面的能力 | NA | 探讨DNA折纸的进展及其在不同领域的应用潜力 | DNA折纸及其在生物计算、纳米机器人和DNA步行器等领域的应用 | NA | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Rational Design of Cascade DNA System for Signal Amplification
2023-05-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00433
PMID:37129512
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研究论文 | 本文提出了一种基于“分裂-重建”和“保护-释放”策略的级联DNA系统设计方法，用于信号放大 | 本文提出的策略使得级联系统不再依赖于严格的1:1:1摩尔比，从而避免了系统泄漏问题，并增强了信号放大能力 | NA | 开发不依赖于严格摩尔比的级联DNA系统，以实现更有效的信号放大 | 级联DNA系统及其在信号放大中的应用 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA序列 | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Content-based filter queries on DNA data storage systems
2023-04-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-34160-5
PMID:37120614
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research paper | 本文介绍了首个支持在DNA存储上进行内容基于过滤查询的编码方法 | 提出了首个支持在DNA存储上进行内容基于过滤查询的编码方法 | 当前DNA存储系统由于生物化学限制，对DNA存储设备的随机访问支持有限 | 开发一种新的DNA编码方法，以支持在DNA存储系统上的内容基于过滤查询 | DNA数据存储系统的编码和解码方法 | NA | NA | DNA编码 | NA | DNA数据 | 数百万可直接访问的数据对象 |
| 54 | 2024-08-07 |
Optimizing mycobacteria molecular diagnostics: No decontamination! Human DNA depletion? Greener storage at 4 °C!
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1104752
PMID:37113238
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研究论文 | 本文研究了优化分枝杆菌分子诊断的方法，包括不使用去污染、减少人类DNA和在4°C下更环保的存储方法。 | 本文首次展示了在分子诊断中不使用去污染和人类DNA减少的方法，并发现样本可以在4°C下存储而不会显著影响检测结果。 | 本文的实验设置可能不适用于所有类型的样本，特别是那些分枝杆菌载量极低的样本。 | 优化分枝杆菌分子诊断的前处理和提取步骤，以提高检测效率和准确性。 | 分枝杆菌DNA的提取效率和存储方法。 | 分子诊断 | 结核病 | 下一代测序（NGS） | NA | DNA | 五个常用设备从相同样本中提取的DNA |
| 55 | 2024-08-07 |
A Smart Nano-Theranostic Platform Based on Dual-microRNAs Guided Self-Feedback Tetrahedral Entropy-Driven DNA Circuit
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301814
PMID:37085743
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研究论文 | 本文介绍了一种基于双微小RNA引导的自反馈四面体熵驱动DNA电路的智能纳米治疗平台，用于检测低丰度的细胞内致癌微小RNA并实现协同基因治疗。 | 该平台利用DNA四面体框架作为递送载体，通过熵驱动DNA电路实现双微小RNA引导的自反馈，从而在原位放大致癌微小RNA并激活抑制微小RNA的释放。 | NA | 开发一种新型的纳米治疗平台，用于肿瘤的诊断和治疗。 | 致癌微小RNA和肿瘤抑制微小RNA。 | 生物技术 | 肝细胞癌 | DNA电路 | NA | 微小RNA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
A survey on molecular-scale learning systems with relevance to DNA computing
2023-May-04, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d2nr06202j
PMID:37066980
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综述 | 本文综述了与DNA计算相关的分子尺度学习系统的研究进展 | 探讨了将学习和推理嵌入到化学反应系统中的新方法 | NA | 旨在回顾分子尺度学习领域的不同想法、进展和新兴概念 | DNA计算中的分子尺度学习系统 | 生物技术 | NA | DNA计算 | NA | 化学程序 | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Projection Synchronization of Three-Dimensional Chaotic Systems With Active Control Based on DNA Strand Displacement
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3241652
PMID:37022384
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研究论文 | 本文通过基于DNA链置换的主动控制方法实现了基于DNA链置换的混沌系统的投影同步 | 首次使用基于DNA链置换的主动控制方法实现混沌系统的投影同步 | NA | 实现基于DNA链置换的混沌系统的投影同步 | 基于DNA链置换的混沌系统 | 生物计算 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
RBS: A Rotational Coding Based on Blocking Strategy for DNA Storage
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3254514
PMID:37028365
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研究论文 | 本文提出了一种基于阻塞策略的旋转编码（RBS）用于DNA存储中的文本和图像等数字信息的编码 | RBS策略满足了多重约束，并在合成和测序中产生低错误率，相比现有策略在信息存储密度和编码质量上有所提高 | NA | 提高DNA存储的效率、实用性和稳定性 | DNA存储中的文本和图像等数字信息的编码方法 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | NA | 文本, 图像 | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Neural co-processors for restoring brain function: results from a cortical model of grasping
2023-05-09, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/accaa9
PMID:37019099
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研究论文 | 本文探讨了使用神经协处理器进行闭环神经刺激，以恢复大脑功能，特别是在抓握任务中的应用 | 提出了一种新型的神经协处理器，利用人工神经网络和深度学习来学习最优的闭环刺激策略，实现脑-设备协同适应 | 研究目前仅限于计算机模拟，尚未应用于实际临床环境 | 实现目标导向的闭环神经刺激，优化康复目标 | 神经协处理器在抓握任务中的应用 | 神经科学 | NA | 人工神经网络，深度学习 | 神经网络模型 | 模拟数据 | 模拟的多种损伤情况 |
| 60 | 2024-08-07 |
Evolutionary approach to construct robust codes for DNA-based data storage
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1158337
PMID:37021008
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研究论文 | 本文提出了一种基于协同飞蛾火焰优化器和莱维飞行与对立学习变异策略的计算进化方法，用于构建满足反向互补约束的DNA序列，以优化DNA存储中的编码问题 | 提出的方法通过三种不同的生物约束条件，显著提高了DNA编码的下界，并大幅减少了错误 | NA | 优化DNA存储中的编码问题，提高编码的下界和编码率 | DNA序列的构建和优化 | 生物信息学 | NA | 进化算法 | 飞蛾火焰优化器（MFOS） | DNA序列 | 使用了19种最先进的功能进行实验 |