生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 86 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Designing and computational analyzing of chimeric long-lasting GLP-1 receptor agonists for type 2 diabetes
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45185-1
PMID:37853095
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研究论文 | 本研究设计并计算分析了与DARPin融合的新型耐蛋白酶GLP-1突变体，旨在开发用于治疗2型糖尿病的长效GLP-1受体激动剂 | 本研究通过将GLP-1突变体与DARPin融合，提高了融合蛋白的稳定性和溶解性，并通过分子动力学模拟和分子对接分析验证了其结构和结合亲和力 | NA | 设计稳定且功能性的融合蛋白，以开发长效GLP-1受体激动剂，用于治疗2型糖尿病 | GLP-1突变体与DARPin融合蛋白的稳定性、溶解性及其与GLP-1受体和人血清白蛋白的结合亲和力 | 生物工程 | 2型糖尿病 | 分子动力学模拟，分子对接分析 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Advanced design and applications of digital microfluidics in biomedical fields: An update of recent progress
2023-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2023.115723
PMID:37832347
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综述 | 本文综述了数字微流控（DMF）技术在生物医学领域的最新进展，重点介绍了DMF系统的集成设计和应用 | 探讨了DMF技术在酶活性评估和DNA存储等新兴应用中的创新策略 | 文章未明确提及具体的技术局限性 | 总结DMF技术在生物医学领域的最新进展，并探讨其设计、应用及未来趋势 | 数字微流控技术及其在生物医学领域的应用 | 生物医学工程 | NA | 数字微流控（DMF） | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Scaling logical density of DNA storage with enzymatically-ligated composite motifs
2023-09-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43172-0
PMID:37749195
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研究论文 | 本文提出了一种使用复合模体作为构建块来降低合成成本并提高逻辑密度的DNA存储框架 | 引入了桥接寡核苷酸组装技术进行酶促连接合成寡核苷酸，以及直接寡核苷酸测序技术和Motif-Search共识调用器进行数据解码 | NA | 旨在解决DNA存储中的合成成本问题 | DNA存储技术 | 生物信息学 | NA | 酶促连接技术，纳米孔测序技术 | NA | DNA序列 | 存储了文本“HelloWorld”，逻辑密度达到84比特/周期 |
| 24 | 2024-08-07 |
A highly sensitive self-powered sensing method designed on DNA circuit strategy and MoS2 hollow nanorods for detection of thalassemia
2023-Oct-16, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2023.341713
PMID:37709456
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研究论文 | 本文开发了一种高灵敏度、特异性的自供电便携式设备，用于高效筛查低水平的地中海贫血 | 采用AuNPs/MoS@C空心纳米棒和三重核酸扩增技术，提高了平台的稳定性和输出信号，同时使用高效的四面体DNA作为探针，通过催化发夹组装反应实现CD122基因的循环，提高了检测的准确性和灵敏度 | NA | 开发一种新的方法用于快速、准确筛查地中海贫血 | 地中海贫血相关的CD122基因 | 生物技术 | 地中海贫血 | AuNPs/MoS@C空心纳米棒，三重核酸扩增技术，催化发夹组装反应 | NA | 基因检测 | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
FrameD: framework for DNA-based data storage design, verification, and validation
2023-Oct-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad572
PMID:37713474
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研究论文 | 本文介绍了FrameD，一个用于DNA存储系统设计和验证的模拟基础设施 | FrameD利用DNA存储系统设计的底层模块化，提供了一个框架来表达不同的设计，同时能够重用通用组件 | NA | 解决目前缺乏通用模拟平台来比较不同DNA存储系统设计的问题 | DNA存储系统的设计和验证 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | 模拟框架 | DNA序列 | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
DNA-based programmable gate arrays for general-purpose DNA computing
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06484-9
PMID:37704731
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研究论文 | 本文展示了一种基于DNA的多层可编程门阵列（DPGA）系统，用于开发通用目的的DNA集成电路（DIC） | 首次开发了通用目的的DNA集成电路，并展示了其在大规模并行计算和疾病相关microRNAs分类中的应用 | NA | 探索和开发通用目的的DNA集成电路 | DNA集成电路及其在计算和疾病分类中的应用 | 生物技术 | NA | DNA折纸技术 | DNA集成电路（DIC） | DNA | 30个逻辑门，约500条DNA链 |
| 27 | 2024-08-07 |
Three-input logic gate based on DNA strand displacement reaction
2023-09-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42383-9
PMID:37709846
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研究论文 | 本文基于DNA链置换反应设计了三种三输入逻辑门，包括三输入OR逻辑门、三输入AND逻辑门和三输入MAJORITY逻辑门 | 利用DNA链置换技术设计并验证了三输入逻辑门，展示了其在DNA计算中的重要应用价值 | NA | 设计并验证基于DNA链置换反应的三输入逻辑门 | 三输入逻辑门的设计与实现 | NA | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA链 | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Weakly mutually uncorrelated codes with maximum run length constraint for DNA storage
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107439
PMID:37678135
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研究论文 | 本文提出了一种结合弱互不相关码与最大游程长度约束的编码设计，用于DNA存储系统中的引物设计 | 首次将弱互不相关码与最大游程长度约束结合，并探索了满足多种约束条件的编码设计 | 未提及 | 解决DNA存储系统中随机访问的引物设计问题 | DNA存储系统中的编码设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Parallel molecular computation on digital data stored in DNA
2023-09-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217330120
PMID:37669382
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研究论文 | 本文通过利用DNA链置换反应，在DNA存储的数据上实现并行的分子计算 | 提出了一种新的方法，通过DNA链置换反应在DNA存储的数据上进行并行分子计算，展示了二进制计数和图灵通用细胞自动机规则110的程序 | NA | 探索在DNA存储的数据上进行并行分子计算的可能性 | DNA存储的数据及其并行分子计算 | 生物信息学 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | 使用了来自M13噬菌体的天然DNA序列，进行了244次不同的链交换 |
| 30 | 2024-08-07 |
Reducing cost in DNA-based data storage by sequence analysis-aided soft information decoding of variable-length reads
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad548
PMID:37669160
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研究论文 | 本文提出了一种通过序列分析辅助的软信息解码方法，用于降低基于DNA的数据存储的成本，并实现了编码和解码过程。 | 引入了新的聚类和比对方法，以及在序列分析辅助解码过程中使用编辑距离和质量分数，有效提高了解码性能并减少了异常读取。 | NA | 旨在降低基于DNA的数据存储的写入和读取成本。 | 基于DNA的数据存储技术。 | 生物信息学 | NA | 低密度奇偶校验码（LDPC） | NA | DNA序列 | 存储了548.83 KB的图像文件 |
| 31 | 2024-08-07 |
Accelerating DNA computing via freeze-thaw cycling
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aax7983
PMID:37624882
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研究论文 | 本文提出了一种通过冷冻-解冻循环加速DNA计算的方法 | 利用冷冻-解冻循环和共晶冰相作为介质，显著提高了DNA计算的速度 | NA | 提高DNA计算的速度 | DNA计算的速度提升 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Material-level countermeasures for securing microfluidic biochips
2023-09-26, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00335c
PMID:37605818
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研究论文 | 本文提出了一种针对基于聚二甲基硅氧烷（PDMS）的微流控生物芯片的动态材料级水印方案，并使用机器学习模型检测制造过程中的异常 | 引入了一种新的动态材料级水印技术，以及使用机器学习模型来检测PDMS固化比率异常 | NA | 开发针对微流控生物芯片的材料级防护措施 | 微流控生物芯片及其在生物计算、临床诊断和即时检测中的应用 | NA | NA | 机器学习 | NA | 荧光数据 | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Integration of DNA-RNA-triplex-based regulation of transcription into molecular logic gates
2023-10, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14721
PMID:37591635
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研究论文 | 本文通过利用DNA-RNA三链体对转录的增强和抑制作用，在体外构建了基于三链体的分子门：'异或'（XOR）、'异或非'（XNOR）和一个阈值门 | 首次使用DNA-RNA三链体纳米结构开发分子门 | NA | 探索和工程化生物计算组件 | DNA-RNA三链体在基因调控中的作用 | 分子生物学 | NA | NA | NA | RNA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
DUHI: Dynamically updated hash index clustering method for DNA storage
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107244
PMID:37453377
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研究论文 | 本文提出了一种动态更新哈希索引（DUHI）聚类方法，用于解决DNA存储过程中的高冗余问题 | DUHI聚类方法通过构建动态核心索引集和使用哈希查找，能够减少序列簇内的冗余并提高序列的重建率 | NA | 解决DNA序列聚类后的高冗余问题，提高数据读取的准确性 | DNA存储过程中的数据冗余和读取准确性 | 生物信息学 | NA | 哈希索引 | 聚类方法 | DNA序列 | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Magnetic Bead Spherical Nucleic Acid Microstructure for Reliable DNA Preservation and Repeated DNA Reading
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00221
PMID:37470286
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研究论文 | 本文报道了一种磁珠球形核酸（MB-SNA）复合微结构的构建及其作为成本效益高的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | MB-SNA具有高密度双链DNA外壳，实现了高容量存储，并通过加速老化测试证明了其在极端条件下的长期保存能力 | NA | 开发一种新的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | 磁珠球形核酸复合微结构 | 生物技术 | NA | PCR-磁分离 | NA | DNA | 每个MB-SNA存储一条双链DNA数据片段 |
| 36 | 2024-08-07 |
An Aptamer-Functionalized DNA Circuit to Establish an Artificial Interaction between T Cells and Cancer Cells
2023-09-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307656
PMID:37423897
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research paper | 本研究开发了一种适体功能化的DNA电路，用于调节T细胞与癌细胞之间的相互作用 | 该DNA电路由识别-触发和聚集-激活模块组成，能够在识别目标癌细胞后，释放触发链诱导T细胞表面免疫受体的聚集，从而增强T细胞活性，有效消除癌细胞 | NA | 探索非遗传策略以控制细胞间相互作用网络，特别是在基于T细胞的癌症免疫治疗中 | T细胞与癌细胞的相互作用 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Programmable Molecular Signal Transmission Architecture and Reactant Regeneration Strategy Driven by EXO λ for DNA Circuits
2023-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00168
PMID:37405388
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研究论文 | 本文展示了一种新型可编程的核酸外切酶辅助信号传输架构，并提出了一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，用于构建DNA电路，以减少信号在级联和分流过程中的衰减。 | 本文提出了一种新型的可编程核酸外切酶辅助信号传输架构和一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，这些方法能够减少DNA电路中信号的衰减，提高分子计算系统的可靠性。 | NA | 提高分子计算系统的可靠性和扩展DNA电路的规模。 | DNA电路中的信号传输和反应物再生策略。 | 分子计算 | NA | 核酸外切酶辅助信号传输 | NA | DNA序列 | 四节点DNA电路 |
| 38 | 2024-08-07 |
A Smart Deoxyribozyme-Programmable Catalytic DNA Circuit for High-Contrast MicroRNA Imaging
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307418
PMID:37379042
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研究论文 | 本文介绍了一种智能脱氧核酶可编程催化DNA电路，用于高对比度microRNA成像 | 提出了一种内源性激活的DNAzyme策略，与催化DNA电路结合，实现了在活细胞中选择性和高效的microRNA成像 | NA | 实现活细胞中microRNA的选择性成像 | microRNA成像 | 生物技术 | NA | 催化DNA电路 | DNAzyme | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
A Cationic Copolymer Enhances Responsiveness and Robustness of DNA Circuits
2023-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202304091
PMID:37340578
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研究论文 | 本研究探讨了一系列阳离子共聚物对DNA催化发夹组装（一种代表性的脚跟介导的DNA电路）的影响 | 使用聚（赖氨酸）-接枝-葡聚糖共聚物显著提高了反应速率，并通过静电相互作用增强了DNA电路的鲁棒性 | NA | 研究阳离子共聚物对脚跟介导的DNA电路操作速率和鲁棒性的影响 | 阳离子共聚物对DNA催化发夹组装的影响 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 一系列阳离子共聚物 |
| 40 | 2024-08-07 |
Entropy-driven DNA circuit with two-stage strand displacement for elegant and robust detection of miRNA let-7a
2023-Aug-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2023.341392
PMID:37290851
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研究论文 | 本研究设计了一种基于外切酶Ⅲ辅助的两阶段链置换反应（SDR）的稳定miRNA-let-7a荧光生物传感器 | 采用了一种熵驱动的SDR，包含三链结构的底物，减少了目标循环过程的可逆性，并设计了两阶段链置换系统，提高了检测灵敏度和范围 | NA | 推动miRNA在癌症诊断传感系统中的研究 | miRNA-let-7a | 生物传感器 | 癌症 | 外切酶Ⅲ辅助链置换反应 | NA | 荧光信号 | NA |