生物计算机与DNA存储相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-07	An automated DNA computing platform for rapid etiological diagnostics 2022-11-25, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ade0453 PMID:36427311	研究论文	开发了一种基于自动化DNA计算的平台，用于快速准确地诊断急性呼吸道感染的病因	该平台能够在分子水平上实施经过计算机训练的分类模型，通过七种不同的mRNA表达模式在4小时内准确诊断ARI病因	NA	开发一种快速、准确、低成本且自动化的诊断平台，用于急诊部门或即时护理诊所的疾病病因诊断	急性呼吸道感染的病因分类	数字病理学	急性呼吸道感染	DNA计算	分类模型	mRNA表达模式	80个临床样本
2	2024-08-07	Microneedle Array Encapsulated with Programmed DNA Hydrogels for Rapidly Sampling and Sensitively Sensing of Specific MicroRNA in Dermal Interstitial Fluid 2022-11-22, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.2c06261 PMID:36326107	研究论文	本文报道了一种封装有编程DNA水凝胶的微针阵列，用于快速富集和敏感检测皮肤间质液中的特定microRNA	该技术利用甲基丙烯酸透明质酸（MeHA）与智能DNA电路水凝胶系统（MeHA/DNA），通过级联脚趾介导的DNA位移反应触发荧光放大，实现对低丰度microRNA的敏感检测	NA	开发一种用于快速且敏感检测皮肤间质液中microRNA的新技术	microRNA在皮肤间质液中的检测	生物技术	NA	DNA位移反应	NA	荧光信号	在5分钟内提取0.97 ± 0.2 mg的皮肤间质液
3	2024-08-07	Modularized Enzymatic Tandem Reaction for tsRNA Detection 2022-11-15, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.2c04010 PMID:36325814	研究论文	本文介绍了一种名为RT-NExT的模块化酶级联反应，用于检测tRNA衍生的小RNA（tsRNA），作为乳腺癌早期诊断和预后预测的新生物标志物。	RT-NExT反应通过模块化设计，能够独立工作或组装，提高了设计的灵活性和检测的准确性。	NA	开发一种新的检测方法，用于乳腺癌的早期诊断和预后评估。	tRNA衍生的小RNA（tsRNA）	NA	乳腺癌	NA	NA	RNA	10 M ts-66或ts-86
4	2024-08-07	ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit 2022-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2210150119 PMID:36282916	研究论文	研究ADAR通过抑制MDA5激活在生物电路中调控APOL1的机制	发现ADAR通过A-to-I RNA编辑调控APOL1表达，影响APOL1相关肾脏疾病的渗透率和严重程度	NA	探讨ADAR对APOL1表达的调控机制及其在肾脏疾病中的作用	ADAR、APOL1、MDA5以及它们在肾脏疾病中的相互作用	NA	肾脏疾病	A-to-I RNA编辑	NA	RNA	人类肾组织、足细胞、转基因APOL1小鼠模型
5	2024-08-07	Sensitive fluorescence biosensor for SARS-CoV-2 nucleocapsid protein detection in cold-chain food products based on DNA circuit and g-CNQDs@Zn-MOF 2022-Nov-01, Lebensmittel-Wissenschaft + [i.e. und] Technologie. Food science + technology. Science + technologie alimentaire DOI:10.1016/j.lwt.2022.114032 PMID:36186577	研究论文	本文报道了一种基于DNA电路和g-CNQDs@Zn-MOF的荧光生物传感器，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白	该荧光生物传感器具有极高的灵敏度，检测限为1.0 pg/mL，且不与其他N蛋白发生显著交叉反应	NA	开发一种快速且灵敏的检测方法，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白	SARS-CoV-2核衣壳蛋白	生物传感器	COVID-19	荧光检测	NA	蛋白质	实际冷链食品样本
6	2024-08-07	Identification of DNA-binding proteins via Multi-view LSSVM with independence criterion 2022-11, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2022.08.015 PMID:36087888	研究论文	本文提出了一种基于序列信息的机器学习算法，用于识别DNA结合蛋白，该方法结合了多视角最小二乘支持向量机与希尔伯特-施密特独立性准则	该方法采用六种特征集作为多视角输入，并通过引入希尔伯特-施密特独立性准则作为正则项，减少了视角间的依赖性，探索了多视角的互补信息	NA	设计一种高效准确的工具来识别DNA结合蛋白	DNA结合蛋白	机器学习	NA	NA	LSSVM	序列信息	训练集PDB1075，独立测试集PDB186和PDB2272
7	2024-08-07	On-Site Non-enzymatic Orthogonal Activation of a Catalytic DNA Circuit for Self-Reinforced In Vivo MicroRNA Imaging 2022-11-07, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202206529 PMID:35775154	research paper	本文开发了一种高效的非酶促电路激活策略，用于实现正交控制的催化DNA电路，以实现高保真的体内微RNA成像	提出了一种非酶促的正交激活方法，用于在活细胞内现场激活催化DNA电路，实现高保真的微RNA成像	NA	开发一种新的方法用于体内微RNA成像，以提高临床诊断和预后的准确性	微RNA的体内成像	生物技术	NA	催化DNA电路	NA	DNA	NA
8	2024-08-07	Design of Constraint Coding Sets for Archive DNA Storage 2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBB.2021.3127271 PMID:34762590	研究论文	本文提出了一种新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），用于增加约束编码集的下界，以提高DNA存储的准确性	提出了新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），增加了约束编码集的下界，提高了DNA存储的准确性	NA	提高DNA存储的准确性和可靠性	约束编码集的设计和优化	生物信息学	NA	DNA存储技术	海洋捕食者算法（QRSS-MPA）	DNA序列	NA