生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 9 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Construction of Multiple Logic Circuits Based on Allosteric DNAzymes
2022-03-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040495
PMID:35454084
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研究论文 | 本文提出了一种基于别构DNAzymes构建多逻辑电路的策略，通过控制DNAzymes保守域的二级结构来调节其活性，实现了基本逻辑门及其级联电路，并引入了一种具有一票否决功能的三输入DNA投票器。 | 本文通过控制DNAzymes的二级结构，避免了四通结的产生，并实现了基本逻辑门及其级联电路，同时通过别构二级结构实现了三输入DNA投票器的一票否决功能，提高了系统的可扩展性。 | NA | 开发一个基于简单机制的具有复杂逻辑功能的系统，并在同一系统中实现基本逻辑门及其级联电路。 | DNA计算中的复杂和稳定逻辑操作的实现。 | DNA计算 | NA | DNAzymes | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-08-07 |
An entropy-driven signal-off DNA circuit for label-free, visual detection of small molecules with enhanced accuracy
2022-03-17, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d1ay01939b
PMID:35224592
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研究论文 | 本文开发了一种基于适配体的熵驱动信号关闭DNA电路，用于小分子的比色检测 | 该方法通过熵驱动的循环杂交显著放大了目标小分子的输入信号，并能区分由侵入性催化剂产生的假阳性信号 | NA | 开发一种新型的高灵敏度和准确性的小分子检测方法 | 小分子，如三磷酸腺苷和氧四环素 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | 比色法 | 检测浓度低至0.5 μM的三磷酸腺苷和1 μM的氧四环素 |
| 3 | 2024-08-07 |
High-scale random access on DNA storage systems
2022-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab126
PMID:35156022
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研究论文 | 本文提出了一种在DNA存储系统中实现大规模随机访问的方法 | 利用喷泉码、复杂的探针设计和微阵列技术，以及局部敏感哈希技术，实现了在同一DNA池中直接访问成千上万至数百万不同数据对象 | 现有的DNA存储系统中，引物数量有限，通常非常少（例如≈10） | 克服DNA存储系统中引物数量有限的限制，实现大规模随机访问 | DNA存储系统中的大规模随机访问技术 | 生物信息学 | NA | 喷泉码、局部敏感哈希 | NA | DNA | 成千上万至数百万不同数据对象 |
| 4 | 2024-08-07 |
Biological computation: hearts and flytraps
2022-03, Journal of biological physics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s10867-021-09590-9
PMID:35089468
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research paper | 本文定义并探讨了一种新型计算方式——生物计算，这是一种更适合生物系统的机械物理计算的自然适应 | 提出生物计算的概念，并将其应用于心脏和捕蝇草等生物系统，展示了经典可计算性理论可能忽略的生物复杂性 | NA | 通过重新定义计算，解决人类学习与机器学习之间的脱节问题 | 心脏和捕蝇草 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Sensitive Logic Nanodevices with Strong Response for Weak Inputs
2022-03-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202115561
PMID:34989066
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research paper | 本文提出了一种“弱输入强输出”策略，通过结合输入诱导的可逆DNA计算平台与基于杂交链反应的信号放大器，构建了敏感逻辑纳米器件 | 通过合理设计计算元件序列，避免输入信号与信号放大器之间的串扰，新形成的逻辑纳米器件对弱输入信号具有良好的敏感性，即使在计算元件浓度较低的情况下也能执行多种逻辑操作 | NA | 开发对弱输入信号具有强响应的敏感逻辑纳米器件 | 逻辑纳米器件的敏感性和计算能力 | NA | NA | DNA计算平台，杂交链反应 | NA | DNA序列 | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
NoAS-DS: Neural optimal architecture search for detection of diverse DNA signals
2022-Mar, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2021.12.009
PMID:34979461
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研究论文 | 本文提出了一种名为NoAS-DS的神经网络架构搜索方法，专门用于序列分类任务的架构搜索，并应用于预测结合位点的任务 | NoAS-DS结合了卷积层和LSTM层，实现了自动架构构建，提高了TFBS和RBP数据集上的准确性 | NA | 开发一种适用于序列分类任务的神经网络架构搜索方法，并应用于DNA结合位点预测 | DNA序列分类任务和结合位点预测 | 机器学习 | NA | 神经架构搜索（NAS） | CNN和LSTM | 序列数据 | TFBS和RBP数据集 |
| 7 | 2024-08-07 |
Fractal construction of constrained code words for DNA storage systems
2022-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1209
PMID:34908135
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研究论文 | 本文提出了一种基于混沌游戏表示法的新方法，用于生成符合用户定义约束（如GC含量、同聚物和不良基序）的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | 本文的创新点在于采用混沌游戏表示法生成满足特定约束的DNA编码词，以提高DNA存储系统的可靠性。 | NA | 研究如何利用DNA作为存储介质，生成满足特定约束的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | DNA编码词及其在DNA存储系统中的应用。 | 计算机科学 | NA | 混沌游戏表示法 | NA | DNA序列 | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
A Hierarchical Error Correction Strategy for Text DNA Storage
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00476-x
PMID:34463928
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研究论文 | 本文提出了一种用于文本DNA存储的分层错误纠正策略 | 该策略通过设计针对常见字符的鲁棒代码，逐步纠正DNA读取中的错误，并能处理多个插入或删除错误 | NA | 旨在解决DNA序列中的错误复杂性，以促进其在大量数据存储中的应用 | DNA存储中的错误纠正方法 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Designing Uncorrelated Address Constrain for DNA Storage by DMVO Algorithm
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3011582
PMID:32750895
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研究论文 | 本文提出了一种新的非相关地址约束和阻尼多宇宙优化（DMVO）算法，用于构建DNA存储编码集，以减少DNA测序和合成过程中的错误率 | 提出的DMVO算法通过黑/白洞交换对象以达到稳定状态，并添加阻尼因子作为干扰，相较于以往工作，获得的编码集更大且质量更高 | NA | 研究旨在提高DNA存储技术的错误率降低和编码集质量 | DNA存储编码集 | 生物信息学 | NA | 阻尼多宇宙优化（DMVO）算法 | NA | DNA序列 | NA |