生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 75 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-09-05 |
Monitoring and modulating a catalytic hybridization circuit for self-adaptive bioorthogonal DNA assembly
2022-Sep-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d2sc03757b
PMID:36277649
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研究论文 | 本文开发了一种自适应的局部催化电路（LCC），用于在拥挤的细胞内环境中实现DNA纳米海绵的自持续生物正交组装 | 提出了一种新型的自适应局部催化电路，通过利用LCC生成的DNA支架作为多功能模板，实现了LCC反应物的近距离限制，从而加速了反应速率和效率 | NA | 构建人工多米诺纳米结构，特别是与活细胞内生物功能激活相关的动态DNA电路，以调节各种生物实体的行为和命运 | DNA纳米海绵的生物正交组装 | 生物技术 | NA | 荧光相关光谱（FCS） | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-09-04 |
Design of DNA Storage Coding with Enhanced Constraints
2022-Aug-19, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24081151
PMID:36010815
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研究论文 | 本文提出了一种增强DNA存储编码鲁棒性的方法，通过引入重复串联序列约束和改进的DTW距离约束，以及结合随机对立学习与涡流跳跃策略的ROEAO算法，来提高编码质量并降低错误率。 | 本文创新性地引入了重复串联序列约束和改进的DTW距离约束，以及结合随机对立学习与涡流跳跃策略的ROEAO算法，以提高DNA存储编码的鲁棒性和质量。 | NA | 旨在解决传统存储介质无法满足全球数据存储需求的问题，特别是通过增强DNA存储编码的鲁棒性来降低错误率。 | DNA存储编码的鲁棒性和质量。 | 生物信息学 | NA | DNA存储编码 | ROEAO算法 | DNA序列 | NA |
| 3 | 2024-08-31 |
Evolution of Brains and Computers: The Roads Not Taken
2022-May-09, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24050665
PMID:35626550
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研究论文 | 本文探讨了大脑和计算机发展过程中的相似性和差异性，以及这些相似性和差异性如何影响人工智能的设计和发展 | 提出了大脑和计算机在进化过程中的相似性和差异性，并讨论了这些因素如何影响人工智能的设计 | 文章主要集中在理论探讨，缺乏具体的实验数据或实际应用案例 | 探讨大脑和计算机在进化过程中的相似性和差异性，以及这些因素如何影响人工智能的设计和发展 | 大脑和计算机的发展历程及其对人工智能设计的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 人工神经网络 | NA | NA |
| 4 | 2024-08-11 |
Preservation and Encryption in DNA Digital Data Storage
2022-Jul-04, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202200183
PMID:35856827
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综述 | 本文综述了DNA数字数据存储的工作流程，并重点介绍了DNA数字数据存储的存储步骤，以及根据不同信息存储形式的DNA信息加密方法 | 介绍了DNA数字数据存储的新一代高密度数字数据存储技术，并强调了其在信息加密方面的创新 | 未明确指出具体的技术限制 | 探讨DNA数字数据存储及其信息加密方法的发展和优化 | DNA数字数据存储及其信息加密技术 | NA | NA | DNA合成与测序技术 | NA | DNA数据 | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
The yin-yang codec for archival DNA storage
2022-Apr, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00235-y
PMID:38177541
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Embodiment in distributed information processing: "Solid" plants versus "liquid" ant colonies
2022, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2022.22
PMID:37077985
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研究论文 | 本文比较了植物和蚂蚁群体在分布式信息处理中的表现，强调了实体化对生物计算的影响 | 提出了“固体”植物与“液体”蚂蚁群体的计算模式，并探讨了实体化视角对植物认知辩论的启示 | NA | 探讨实体化在生物分布式信息处理中的作用 | 植物和蚂蚁群体的信息处理机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
An enhanced whale optimization algorithm for DNA storage encoding
2022-09-26, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022659
PMID:36654084
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研究论文 | 本文提出了一种改进的选择性对立鲸鱼优化算法（ISOWOA），用于克服传统鲸鱼优化算法的缺点，并应用于DNA存储编码 | 引入了增强的准对立学习（EQOBL）和改进的时间变化惯性权重更新策略，提高了算法的性能和适用性 | NA | 实现对DNA文件的访问并设计高质量的DNA代码集 | 鲸鱼优化算法在DNA存储编码中的应用 | 生物计算 | NA | 鲸鱼优化算法 | ISOWOA | DNA存储代码 | 23个CEC 2005基准函数和15个CEC 2015基准函数 |
| 8 | 2024-08-07 |
An allosteric DNA switch-mediated catalytic DNA circuit for ratiometric and sensitive nucleic acid detection
2022-12-22, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d2ay01751b
PMID:36504112
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研究论文 | 本文提出了一种基于配体调控DNA开关的催化DNA电路反应策略，用于比率式和敏感的核酸检测 | 该研究创新性地利用了配体调控DNA开关和脚趾介导的链置换反应（TSDR），形成了一个互惠的链置换网络，实现了信号放大和比率式信号响应 | NA | 开发一种新的核酸检测方法，实现高灵敏度和选择性的检测 | 核酸检测 | 生物传感器 | NA | 脚趾介导的链置换反应（TSDR） | DNA电路 | 核酸 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
DNA computing for gastric cancer analysis and functional classification
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1064715
PMID:36506309
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研究论文 | 本文利用DNA链置换机制（DSD）构建了用于癌症分析的DNA计算系统，并通过基因芯片和加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别了关键的微小RNA生物标志物。 | 本文创新地使用了DNA链置换机制构建计算系统，实现了无实验室环境的临床意义重大的癌症分析。 | NA | 旨在通过DNA计算系统实现快速准确的癌症诊断。 | 胃癌分析和功能分类的关键生物标志物。 | 数字病理学 | 胃癌 | DNA链置换机制（DSD） | 加权基因共表达网络（WGCNA） | 微小RNA数据和临床特征 | 数据来自癌症基因组图谱（TCGA）数据库 |
| 10 | 2024-08-07 |
Neuronal cultures playing Pong: First steps toward advanced screening and biological computing
2022-12-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.11.010
PMID:36480938
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研究论文 | 本文通过在培养的神经元中实现学习-在-盘，向器官智能迈出了重要一步 | 该系统可能补充对认知的分子和细胞机制的研究，并允许在神经发育或神经退行性疾病以及生物计算方面的创新 | NA | 探索神经元培养系统在认知机制研究和生物计算中的应用 | 神经元培养系统 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
An automated DNA computing platform for rapid etiological diagnostics
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade0453
PMID:36427311
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研究论文 | 开发了一种基于自动化DNA计算的平台，用于快速准确地诊断急性呼吸道感染的病因 | 该平台能够在分子水平上实施经过计算机训练的分类模型，通过七种不同的mRNA表达模式在4小时内准确诊断ARI病因 | NA | 开发一种快速、准确、低成本且自动化的诊断平台，用于急诊部门或即时护理诊所的疾病病因诊断 | 急性呼吸道感染的病因分类 | 数字病理学 | 急性呼吸道感染 | DNA计算 | 分类模型 | mRNA表达模式 | 80个临床样本 |
| 12 | 2024-08-07 |
A functional RNA/DNA circuit for one-pot detection of SARS-CoV-2 RNA
2022-Dec-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d2cc05251b
PMID:36383079
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研究论文 | 本文提出了一种基于功能性RNA/DNA电路的简单方法，用于检测SARS-CoV-2 RNA | 该方法巧妙地整合了核酸电路技术和CRISPR/cas12a系统，能够在一步骤中实现对目标RNA的飞摩尔级检测 | NA | 开发一种简单有效的方法用于检测SARS-CoV-2 RNA | SARS-CoV-2 RNA | NA | COVID-19 | CRISPR/cas12a系统 | NA | RNA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Neuromorphic quantum computing
2022-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.045311
PMID:36397478
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研究论文 | 本文展示了神经形态计算可以执行量子操作，通过将尖峰神经元的状态与Ising自旋的两个状态相连接，并从Ising自旋的期望值和相关性构建量子密度矩阵。 | 本文提出了一种超越马尔可夫链的概率计算方法，不基于转换概率，而是通过约束经典概率分布来模拟量子系统的纠缠特性。 | NA | 探索神经形态计算在量子操作中的应用 | 神经形态计算与量子计算的结合 | 量子计算 | NA | 量子计算 | 神经网络 | 量子系统 | 两量子比特系统 |
| 14 | 2024-08-07 |
Levy Equilibrium Optimizer algorithm for the DNA storage code set
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277139
PMID:36395269
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研究论文 | 本文提出了一种Levy均衡优化器（LEO）算法，用于构建满足组合约束的DNA存储代码集 | 提出的LEO算法在13个基准函数上测试，获得了4个新的全局最优解，并改进了DNA存储代码集的下限 | NA | 研究如何通过优化算法提高DNA存储代码集的性能 | DNA存储代码集及其优化算法 | 生物信息学 | NA | Levy Equilibrium Optimizer (LEO)算法 | NA | DNA序列 | 13个基准函数 |
| 15 | 2024-08-07 |
FMG: An observable DNA storage coding method based on frequency matrix game graphs
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106269
PMID:36356390
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研究论文 | 提出了一种基于频率矩阵游戏图（FMG）的DNA存储编码方法，用于生成满足组合约束的DNA存储编码 | 该方法具有确定性，能清晰解释编码过程，并且编码结果具有可观测特性，优于先前发表的结果 | NA | 开发一种高效且合理的DNA存储编码方法 | DNA存储编码方法及其性能 | 生物信息学 | NA | 频率矩阵游戏图（FMG） | NA | DNA序列 | 当编码长度n=10，汉明距离d=4时，编码集大小比先前结果提高24% |
| 16 | 2024-08-07 |
Microneedle Array Encapsulated with Programmed DNA Hydrogels for Rapidly Sampling and Sensitively Sensing of Specific MicroRNA in Dermal Interstitial Fluid
2022-11-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.2c06261
PMID:36326107
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研究论文 | 本文报道了一种封装有编程DNA水凝胶的微针阵列，用于快速富集和敏感检测皮肤间质液中的特定microRNA | 该技术利用甲基丙烯酸透明质酸（MeHA）与智能DNA电路水凝胶系统（MeHA/DNA），通过级联脚趾介导的DNA位移反应触发荧光放大，实现对低丰度microRNA的敏感检测 | NA | 开发一种用于快速且敏感检测皮肤间质液中microRNA的新技术 | microRNA在皮肤间质液中的检测 | 生物技术 | NA | DNA位移反应 | NA | 荧光信号 | 在5分钟内提取0.97 ± 0.2 mg的皮肤间质液 |
| 17 | 2024-08-07 |
Modularized Enzymatic Tandem Reaction for tsRNA Detection
2022-11-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c04010
PMID:36325814
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RT-NExT的模块化酶级联反应，用于检测tRNA衍生的小RNA（tsRNA），作为乳腺癌早期诊断和预后预测的新生物标志物。 | RT-NExT反应通过模块化设计，能够独立工作或组装，提高了设计的灵活性和检测的准确性。 | NA | 开发一种新的检测方法，用于乳腺癌的早期诊断和预后评估。 | tRNA衍生的小RNA（tsRNA） | NA | 乳腺癌 | NA | NA | RNA | 10 M ts-66或ts-86 |
| 18 | 2024-08-07 |
ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit
2022-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210150119
PMID:36282916
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研究论文 | 研究ADAR通过抑制MDA5激活在生物电路中调控APOL1的机制 | 发现ADAR通过A-to-I RNA编辑调控APOL1表达，影响APOL1相关肾脏疾病的渗透率和严重程度 | NA | 探讨ADAR对APOL1表达的调控机制及其在肾脏疾病中的作用 | ADAR、APOL1、MDA5以及它们在肾脏疾病中的相互作用 | NA | 肾脏疾病 | A-to-I RNA编辑 | NA | RNA | 人类肾组织、足细胞、转基因APOL1小鼠模型 |
| 19 | 2024-08-07 |
Stochastic dynamics of Type-I interferon responses
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010623
PMID:36269758
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研究论文 | 研究了JAK-STAT信号通路中干扰素α反应诱导的变异性的来源 | 整合时间分辨流式细胞仪数据和JAK-STAT信号通路的随机建模，量化了通路不同步骤的内在变异性 | NA | 探究干扰素α反应诱导的变异性的来源及其对JAK-STAT信号通路的影响 | 干扰素α反应的变异性及其在JAK-STAT信号通路中的作用 | NA | NA | 流式细胞术 | 随机模型 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 20 | 2024-08-07 |
Provenance of life: Chemical autonomous agents surviving through associative learning
2022-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.034401
PMID:36266823
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研究论文 | 本文展示了一种自主化学代理通过关联学习适应环境特征的基准研究 | 首次证明简单的非生物耗散结构也能展示关联学习能力 | NA | 探索简单的非生物耗散结构是否能展示关联学习 | 自主化学代理的关联学习能力 | 系统化学 | NA | 反应扩散模型 | Gray-Scott模型 | 化学物种 | NA |