生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 7 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Scaling up DNA digital data storage by efficiently predicting DNA hybridisation using deep learning
2021-10-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97238-y
PMID:34654863
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research paper | 本文通过深度学习方法有效预测DNA杂交过程，以扩大DNA数字数据存储的应用 | 首次全面研究机器学习方法在预测DNA杂交任务中的应用，并引入了一个包含超过250万个数据点的模拟杂交数据集 | NA | 控制和预测DNA杂交过程，以推动混合分子-电子计算的未来发展 | DNA杂交过程及其在DNA数字数据存储和计算中的应用 | machine learning | NA | deep learning | NA | DNA序列数据 | 超过250万个数据点 |
| 2 | 2024-08-07 |
Stochastic Hazard Analysis of Genetic Circuits in iBioSim and STAMINA
2021-10-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00159
PMID:34606710
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研究论文 | 本文通过使用STAMINA工具对三种已知具有故障行为的遗传电路实现进行随机分析，预测故障倾向，并通过与iBioSim中的随机模拟结果对比验证了STAMINA的有效性 | 本文展示了随机验证在遗传设计中的应用，帮助设计者评估设计选择和输入限制，以实现所需的运行可靠性 | NA | 研究如何通过随机分析预测遗传电路中的故障倾向，并提高电路的运行可靠性 | 三种已知具有故障行为的遗传电路实现 | 合成生物学 | NA | 随机验证 | NA | 遗传电路数据 | 三种遗传电路实现 |
| 3 | 2024-08-07 |
Integrated Iontronic Circuits Based on Single Nanochannels
2021-Oct-13, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c12324
PMID:34585930
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研究论文 | 本文介绍了一种基于并行单个聚二甲基硅氧烷（PDMS）纳米通道的离子电子电路的发明，用于实现有效的电子信号操控 | 该电路能够作为双极结型晶体管或离子整流器，通过不对称地装饰带电聚电解质在纳米通道上来调控离子传输 | NA | 开发新型离子电子集成电路，以改进生物计算和传感技术 | 离子电子电路及其在生物计算和传感中的应用 | NA | NA | 离子电子技术 | 离子电子电路 | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Modular DNA Circuits for Point-of-Care Colorimetric Assay of Infectious Pathogens
2021-10-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02597
PMID:34506117
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研究论文 | 本文介绍了一种基于核酸等温扩增技术和DNA酶介导比色读出的模块化DNA电路，用于即时检测多种传染性病原体 | 该研究设计了一种固定模块和灵活模块组成的模块化DNA电路，能够同时检测多种遗传目标，并通过尿素处理和磁分离实现固定模块的重复使用 | NA | 开发一种准确、特异且经济的检测方法，用于同时检测多种传染性病原体，以提高人类健康和安全 | 传染性病原体的检测 | 生物技术 | 传染性疾病 | 核酸等温扩增技术 | DNA电路 | 遗传目标 | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
In Situ Programmable DNA Circuit-Promoted Electrochemical Characterization of Stemlike Phenotype in Breast Cancer
2021-10-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06436
PMID:34495654
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研究论文 | 本文报道了一种电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型，提供了一种低成本且稳健的选择，替代昂贵且依赖经验的流式细胞术。 | 设计了一种原位可编程DNA电路，使用捕获探针引入DNA组装的触发点和效应探针加速背景信号的移除，提高了电化学表型方法的灵敏度和准确性。 | NA | 开发一种新的电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型。 | 乳腺癌干细胞样表型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 电化学表型方法 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和小鼠乳腺癌异种移植瘤模型。 |
| 6 | 2024-08-07 |
HD-Code: End-to-End High Density Code for DNA Storage
2021-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3102122
PMID:34343096
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研究论文 | 本文提出了一种端到端的高密度DNA编码算法（称为HD-code），用于DNA存储 | 该算法通过充分利用原始多媒体数据的统计特性和考虑DNA碱基的生物学约束，实现了更高的逻辑存储密度，并提高了数据存储的灵活性和一致性 | NA | 探索和优化DNA作为信息存储媒介的方法 | DNA存储技术及其编码算法 | 生物信息学 | NA | DNA编码 | NA | 多媒体数据 | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Cooperative sequence clustering and decoding for DNA storage system with fountain codes
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab246
PMID:33904574
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研究论文 | 本文针对使用喷泉码和里德-所罗门码的DNA存储系统，提出了一系列提高解码性能的技术 | 通过协同序列聚类、异常序列读取的丢弃、里德-所罗门错误校正以及基于质量分数的序列排序，提高了DNA存储系统的解码性能 | NA | 旨在减少DNA存储系统中由读写成本权衡引起的读取成本，同时不增加写入成本 | DNA存储系统中的序列聚类和解码过程 | NA | NA | 喷泉码，里德-所罗门码 | NA | DNA序列 | 513.6 KB数据被合成到DNA寡核苷酸池中，并使用Illumina MiSeq仪器成功测序 |