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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-08-07 |
Promiscuous molecules for smarter file operations in DNA-based data storage
2021-06-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23669-w
PMID:34112775
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研究论文 | 本文利用生物分子相互作用的温度调节,实现了DNA存储中数据访问和组织的有用功能 | 通过调节DNA浓度和温度,实现了从大型背景数据库中可切换访问完整图像文件或低分辨率文件预览版本 | NA | 探讨如何有效组织、访问和操作DNA存储中的数据 | DNA存储中的数据访问和组织功能 | 生物技术 | NA | 生物分子相互作用的温度调节 | NA | 图像 | 四个JPEG图像 |
42 | 2024-08-07 |
Stable DNA Sequence Over Close-Ending and Pairing Sequences Constraint
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644484
PMID:34079580
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研究论文 | 本文提出了一种改进的混沌鲸优化算法,用于设计满足配对序列约束和封闭端约束的稳定DNA序列 | 引入了新的捕食-猎物策略和正弦余弦函数,提高了算法的优化性能 | NA | 优化DNA序列设计,提高DNA计算的准确性 | DNA序列及其稳定性 | 分子生物技术 | NA | 混沌鲸优化算法 | NA | DNA序列 | 23个基准函数 |
43 | 2024-08-07 |
Addition of mirror-image L-DNA elements to DNA amplification circuits to distinguish leakage from target signal
2021-Sep-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2021.113354
PMID:34034212
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研究论文 | 本文提出了一种结合自然存在的右旋D-DNA电路元件和合成左旋L-DNA电路元件的策略,以区分目标信号与电路泄漏 | 引入左旋L-DNA元件作为无目标控制反应,与右旋D-DNA元件在同一管中进行,以区分目标特异性扩增和电路泄漏 | 传统的DNA扩增电路需要单独的“无目标”控制反应来估计非特异性扩增或电路泄漏 | 开发一种适用于生物样本中目标检测的新型DNA扩增电路 | DNA扩增电路的特异性扩增与电路泄漏的区分 | NA | NA | 催化发夹组装(CHA) | NA | DNA | 在不同条件下(包括背景DNA、增加的盐浓度、增加的温度和尿液)进行了广泛的实验验证 |
44 | 2024-08-07 |
Toward living neuroprosthetics: developing a biological brain pacemaker as a living neuromodulatory implant for improving parkinsonian symptoms
2021-06-08, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ac02dd
PMID:34010821
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研究论文 | 本研究旨在开发一种生物脑起搏器,作为活体神经调节植入物,用于改善帕金森病症状 | 提出了一种全新的生物脑起搏器,完全由生物和生物相容性组件构建,旨在解决现有电子神经植入物的硬件问题和生物相容性问题 | 目前研究仍处于初步阶段,需要进一步的实验验证和临床试验 | 开发一种生物脑起搏器,用于治疗帕金森病 | 帕金森病患者 | 生物医学工程 | 帕金森病 | 组织工程 | 3D多细胞电路设计 | 细胞材料 | NA |
45 | 2024-08-07 |
CLGBO: An Algorithm for Constructing Highly Robust Coding Sets for DNA Storage
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644945
PMID:34017354
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研究论文 | 本研究提出了一种基于增强梯度优化器CLGBO的算法,用于构建高度鲁棒的DNA存储编码集 | 引入Cauchy和Levy变异策略的CLGBO算法,提高了DNA存储编码集的下限,增加了4.3-13.5%的鲁棒性 | NA | 开发新的算法以提高DNA存储的鲁棒性和容量 | DNA存储编码集 | 生物信息学 | NA | CLGBO算法 | 梯度优化器 | DNA序列 | NA |
46 | 2024-08-07 |
[The current status and future prospects of DNA computing]
2021-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.200408
PMID:33973429
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综述 | 本文综述了DNA计算的基本原理及其最新研究进展,并讨论了其面临的挑战 | DNA计算因其低能耗和并行性而受到关注 | 文章讨论了DNA计算面临的挑战 | 探讨DNA计算的现状与未来前景 | DNA计算及其在分子信息调控和处理中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
47 | 2024-08-07 |
A hairpin probe-mediated DNA circuit for the detection of the mecA gene of Staphylococcus aureus based on exonuclease III and DNAzyme-mediated signal amplification
2021-Jun-07, The Analyst
DOI:10.1039/d1an00028d
PMID:33954316
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研究论文 | 本文报道了一种基于发夹探针介导的DNA电路,用于检测金黄色葡萄球菌的mecA基因,该电路结合了外切酶III辅助的循环信号放大和DNA酶介导的切割反应 | 该生物传感器通过发夹探针与mecA基因的识别和杂交,触发了外切酶III和DNA酶介导的信号放大,从而增强了荧光响应,实现了对mecA基因的灵敏和特异性检测 | NA | 开发一种简单、高度敏感的生物传感器,用于检测金黄色葡萄球菌,以保障人类健康和安全 | 金黄色葡萄球菌的mecA基因 | 生物传感器 | 细菌感染 | 外切酶III和DNA酶 | NA | 荧光信号 | 检测范围从1 fM到1 nM,检测限为0.5 fM,并应用于临床样本分析 |
48 | 2024-08-07 |
Cooperative sequence clustering and decoding for DNA storage system with fountain codes
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab246
PMID:33904574
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研究论文 | 本文针对使用喷泉码和里德-所罗门码的DNA存储系统,提出了一系列提高解码性能的技术 | 通过协同序列聚类、异常序列读取的丢弃、里德-所罗门错误校正以及基于质量分数的序列排序,提高了DNA存储系统的解码性能 | NA | 旨在减少DNA存储系统中由读写成本权衡引起的读取成本,同时不增加写入成本 | DNA存储系统中的序列聚类和解码过程 | NA | NA | 喷泉码,里德-所罗门码 | NA | DNA序列 | 513.6 KB数据被合成到DNA寡核苷酸池中,并使用Illumina MiSeq仪器成功测序 |
49 | 2024-08-07 |
Nanopore decoding for a Hamiltonian path problem
2021-Mar-28, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d0nr09031j
PMID:33885605
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研究论文 | 本文描述了一种使用纳米孔技术快速解码DNA计算输出结果的方法,用于解决有向哈密顿路径问题(HPP) | 提出了一种基于纳米孔技术的快速且无标记的解码方法,用于数学DNA计算中的并行自组装 | 仅证明了小图的HPP解码可行性,尚未验证更大规模问题的解码能力 | 开发一种快速解码DNA计算输出结果的方法 | 有向哈密顿路径问题(HPP) | 生物计算 | NA | 纳米孔技术 | NA | DNA | 小图的HPP |
50 | 2024-08-07 |
Biocomputing Based on DNA Strand Displacement Reactions
2021-06-16, Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/cphc.202100140
PMID:33871136
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综述 | 本文综述了基于DNA链置换反应(SDR)的生物计算设计原理及其应用 | 介绍了DNA-only、酶辅助、其他分子参与和外部刺激控制等多种SDR设计策略 | 讨论了基于SDR计算的优势与挑战 | 探讨DNA在生物计算领域的应用及其设计原理 | DNA链置换反应及其在生物计算中的应用 | 生物计算 | NA | DNA链置换反应 | NA | NA | NA |
51 | 2024-08-07 |
Dynamically elongated associative toehold for tuning DNA circuit kinetics and thermodynamics
2021-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab212
PMID:33849054
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研究论文 | 本文通过使用发夹锁设计动态延长有效关联脚长度,解决了DNA电路中关联脚长度与泄漏率之间的权衡问题 | 提出了一种发夹锁设计,动态延长有效关联脚长度,以提高电路性能 | 未提及具体限制 | 优化DNA电路的反应动力学和平衡信号 | DNA电路中的关联脚长度 | 生物技术 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | 三种不同组合的发夹引发剂(4 → 6 nt, 5 → 8 nt 和 6 → 9 nt) |
52 | 2024-08-07 |
Intracellular enzyme-powered DNA circuit with a tunable amplifier for miRNA imaging
2021-Apr-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d1cc00536g
PMID:33876121
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research paper | 本文描述了一种基于细胞内酶驱动的DNA电路探针,具有可调节放大器,用于miRNA的灵敏和选择性检测 | 该方法成功应用于活细胞内miRNA-21的荧光原位成像,并通过使用化学物质提高APE1表达水平,实现了放大强度的可调节,增强了成像应用的灵活性 | NA | 开发一种新型的DNA电路探针,用于细胞内miRNA的灵敏和选择性检测 | miRNA-21的荧光成像 | NA | NA | NA | NA | image | 活细胞 |
53 | 2024-08-07 |
A crosslinked submicro-hydrogel formed by DNA circuit-driven protein aggregation amplified fluorescence anisotropy for biomolecules detection
2021-Apr-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2021.338319
PMID:33736800
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA电路驱动的蛋白质聚集放大荧光各向异性(FA)的交联亚微米水凝胶,用于生物分子的高灵敏度检测 | 通过催化发夹组装(CHA)辅助的蛋白质聚集形成的新型FA放大器,提高了FA测定的灵敏度和准确性 | NA | 开发一种新的荧光各向异性测定方法,用于生物分子的高灵敏度检测 | miRNA-145、葡萄球菌肠毒素B(SEB)和ATP的检测 | 生物技术 | NA | 荧光各向异性(FA)测定 | NA | 生物分子 | 检测限分别为2.5 nM、92 pg/mL和3.6 μM |
54 | 2024-08-07 |
Nanoscale programming of cellular and physiological phenotypes: inorganic meets organic programming
2021-03-11, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-021-00176-8
PMID:33707429
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研究论文 | 本文介绍了纳米尺度编程语言的概念,其中分子作为操作数,构象状态作为逻辑门,通过纳米尺度计算代理(NCAs)执行功能程序,以响应输入并返回输出信号。 | 文章提出了一种新的生物计算领域,利用自然进化过程使代码在计算过程中“进化”,从而实现全新的算法发展。 | 文章提到了NCAs面临的挑战,但未具体说明这些挑战的具体内容。 | 研究旨在革新生物系统的研究,深化对人类生物学和疾病的理解,并促进原位精准治疗的发展。 | 研究对象包括纳米尺度计算代理(NCAs)及其在生物系统中的应用。 | 生物技术 | NA | 纳米尺度计算代理(NCAs) | NA | NA | NA |
55 | 2024-08-07 |
Droplet-Based Membranous Soft Materials
2021-03-23, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.0c03289
PMID:33686860
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研究论文 | 本文探讨了基于液滴界面双层(DIB)的软材料在构建、操作和功能化方面的最新进展 | DIB材料结合了模型膜组装技术和液滴微流控技术,具有广泛的应用前景 | 文章讨论了DIB材料面临的一些限制及其可能的解决方案 | 探索DIB网络的构建、操作和功能化,并讨论其独特的力学特性 | 基于液滴界面双层的软材料 | NA | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA |
56 | 2024-08-07 |
Engineering Alternate Ligand Recognition in the PurR Topology: A System of Novel Caffeine Biosensing Transcriptional Antirepressors
2021-03-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00582
PMID:33689294
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研究论文 | 本研究通过工程化改造PurR拓扑结构,设计了一种新型咖啡因生物传感转录抗抑制因子系统 | 首次成功同时工程化改造了转录因子的配体结合位点和DNA结合功能 | NA | 提高生物计算能力,构建更复杂的遗传程序 | PurR拓扑结构及其对咖啡因的响应性 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 创建了38种新的转录因子 |
57 | 2024-08-07 |
Synthetic biological circuit tested in spaceflight
2021-Feb, Life sciences in space research
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.lssr.2020.09.002
PMID:33612180
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研究论文 | 本研究测试了一种合成生物电路在太空飞行中的功能,该电路用于在拟南芥中生产蛋白质 | 首次尝试将地球上的合成生物学工具转化为太空飞行应用 | NA | 探索合成生物学在太空飞行中的应用潜力 | 拟南芥中的合成生物电路pX7-AtPDSi | 合成生物学 | NA | Cre/LoxP重组系统 | NA | 图像 | 拟南芥幼苗 |
58 | 2024-08-07 |
An efficient medical image encryption using hybrid DNA computing and chaos in transform domain
2021-Mar, Medical & biological engineering & computing
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11517-021-02328-8
PMID:33559087
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研究论文 | 本文提出了一种基于整数小波变换(IWT)结合脱氧核糖核酸(DNA)和混沌的加密算法,用于保护数字医疗图像 | 该算法包括两阶段洗牌和扩散阶段,通过初始块混淆、行列像素洗牌以及DNA编码和DNA XOR操作,增强了系统对差分攻击的安全性 | NA | 解决电子健康记录(EHRs)在开放网络传输中面临的安全威胁 | 数字医疗图像的安全加密 | 数字病理学 | NA | 整数小波变换(IWT)、DNA计算、混沌理论 | NA | 图像 | 100张16位深度的DICOM测试图像 |
59 | 2024-08-07 |
A CRISPR/Cas13a-powered catalytic electrochemical biosensor for successive and highly sensitive RNA diagnostics
2021-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2021.113027
PMID:33529861
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas13a系统和催化发夹DNA电路(CHDC)的双信号放大策略,集成于可重复使用的电化学生物传感器上,用于快速准确地检测RNA | 该研究通过独特的CRISPR/Cas13a系统与CHDC的结合,实现了50 aM的检测限,并在6分钟内完成读出,总体过程时间为36分钟 | NA | 开发一种快速、低成本且高度准确的工具,用于早期癌症诊断 | 非小细胞肺癌(NSCLC)早期患者的低表达RNA目标 | 生物传感器 | 肺癌 | CRISPR/Cas13a | 电化学生物传感器 | RNA | 20名非小细胞肺癌早期患者,30名健康受试者,12名良性肺疾病患者 |
60 | 2024-08-07 |
Minimum Free Energy Coding for DNA Storage
2021-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3056351
PMID:33534710
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研究论文 | 本文探讨了如何通过最小自由能约束和布朗多宇宙优化算法来提高DNA存储系统的编码效率和稳定性 | 提出了基于最小自由能约束的DNA存储编码方法,并使用布朗多宇宙优化算法设计了更优的DNA存储编码集 | NA | 提高DNA存储系统的数据存储效率和降低错误率 | DNA存储系统的编码方法和编码集设计 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | 布朗多宇宙优化算法 | DNA序列 | NA |