生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 68 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-13 |
Cascade Strand Displacement and Bipedal Walking Based DNA Logic System for miRNA Diagnostics
2021-Jun-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c00277
PMID:34235264
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研究论文 | 开发了一种基于双足DNA步行器的放大电化学方法，用于miRNA检测，并构建了多种逻辑电路，实现了多重miRNA的分析 | 整合了DNA逻辑门与丰富的计算功能和信号放大，实现了超高的灵敏度，并成功建立了多种逻辑门 | NA | 开发一种新的DNA逻辑系统，用于miRNA的诊断和多重分析 | miRNA的检测和多重分析 | 生物技术 | NA | DNA逻辑门，双足DNA步行器，电化学方法 | NA | DNA | NA |
| 2 | 2024-08-08 |
DNA stability: a central design consideration for DNA data storage systems
2021-03-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21587-5
PMID:33649304
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研究论文 | 本文分析了影响DNA稳定性的存储条件、分子机制和稳定化策略，并提出了未来DNA存储系统的具体设计配置和场景 | 探讨了DNA存储技术在现代信息存储中的潜在变革性解决方案 | NA | 研究DNA存储系统的稳定性设计 | DNA存储条件、分子机制和稳定化策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-08-05 |
Combinatorial constraint coding based on the EORS algorithm in DNA storage
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255376
PMID:34324571
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研究论文 | 本文提出了一种基于EORS算法的DNA存储编码方法 | 提出的编码方法满足Hamming距离、GC含量和无运行长度约束，能够降低存储中的错误率 | 可能未充分探讨不同类型DNA合成和测序中的具体错误类型 | 解决DNA存储中数据编码的有效性问题 | 研究了使用EORS算法的DNA存储编码 | 数字病理学 | NA | EORS算法 | NA | NA | 通过模拟实验构建的DNA存储编码集 |
| 4 | 2024-08-06 |
DNA Matrix Operation Based on the Mechanism of the DNAzyme Binding to Auxiliary Strands to Cleave the Substrate
2021-11-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom11121797
PMID:34944442
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNAzyme结合辅助链来切割底物的DNA矩阵运算方法 | 创新点在于采用DNAzyme结合机制实现矩阵乘法操作，从而提高计算速度和准确性 | 本文未明确指出具体的应用限制或技术难点 | 研究旨在探索如何提高DNA计算中的矩阵运算的效率和准确性 | 研究对象为基于DNA的矩阵运算及其底物切割机制 | 计算机视觉 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-06 |
Concepts and Application of DNA Origami and DNA Self-Assembly: A Systematic Review
2021, Applied bionics and biomechanics
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/2021/9112407
PMID:34824603
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综述 | 本文简要介绍了DNA折纸及DNA自组装的概念和应用 | 探讨了DNA计算的新兴分支及其在多个领域中的应用 | 没有详细讨论DNA计算模型的具体实现 | 探讨DNA自组装在新计算技术中的应用 | DNA折纸和自组装结构的应用 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-06 |
Endogenous microRNA triggered enzyme-free DNA logic self-assembly for amplified bioimaging and enhanced gene therapy via in situ generation of siRNAs
2021-Sep-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01040-x
PMID:34565382
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研究论文 | 本文开发了一种由特定内源性microRNA触发的无酶DNA扩增策略，以增强宫颈癌的基因治疗效果 | 提出了一种利用内源性miRNA激活的DNA电路进行siRNA的原位生成，为癌症诊断和基因治疗提供了一个通用的平台 | 该研究未提及具体的临床应用和长期效果评估 | 研究旨在提升siRNA的传递效率与基因沉默效果，以改善癌症治疗 | 针对宫颈癌细胞进行miR-21的敏感分析与siRNA的生成 | 数字病理学 | 宫颈癌 | DNA逻辑电路 | NA | 荧光信号 | HeLa细胞 |
| 7 | 2024-08-06 |
A self-contained and self-explanatory DNA storage system
2021-09-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97570-3
PMID:34508146
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研究论文 | 提出了一种自包含和自解释的DNA存储系统 | 创新性地设计了一种DNA文件格式，实现了无需外部工具的数据恢复 | 未提及该系统在实际应用中的具体限制 | 解决传统DNA存储系统在超长期存储和恢复上的不确定性问题 | DNA存储系统及其数据恢复方法 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | NA | 数据文件 | 通过实验数据进行验证 |
| 8 | 2024-08-06 |
High-density information storage and random access scheme using synthetic DNA
2021-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-021-02882-w
PMID:34194912
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成DNA的高密度信息存储和随机访问方案 | 提出了一种基于码本的DNA映射方法和基于编码内容的随机访问方法，该方案提升了信息存储密度 | 合成DNA的高成本和低随机访问效率仍然是主要缺点 | 研究下一代存储技术中的DNA存储方案 | 针对合成DNA的存储密度和随机访问效率进行研究 | 计算机视觉 | NA | NA | 卷积神经网络 | NA | 实验中与现有DNA信息存储方法进行比较 |
| 9 | 2024-08-06 |
DNA nanotechnology provides an avenue for the construction of programmable dynamic molecular systems
2021, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v18.013
PMID:34123692
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综述 | 文章概述了基于DNA的自组装系统的最新研究，并强调其动态特性 | 探讨了利用DNA纳米技术构建可编程动态分子系统的前沿进展 | 未明确指出具体的实验数据和实例 | 研究基于DNA的自组装系统在生物工程中的应用 | 人工设计的DNA自组装系统 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-06 |
CRISPR-Mediated Strand Displacement Logic Circuits with Toehold-Free DNA
2021-May-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00649
PMID:33900064
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研究论文 | 该文章报道了利用CRISPR-Cas系统设计无踏脚位双链DNA的逻辑电路 | 创新点在于实现了无踏脚位的双链DNA逻辑电路，使用了等温链置换的CRISPR-Cas系统 | 该研究未讨论实现的逻辑电路在实际应用中的可扩展性和稳定性 | 研究DNA计算中的逻辑电路设计和功能扩展 | 研究的对象是基于链置换的DNA逻辑电路 | DNA纳米技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-06 |
Highly sensitive and portable mRNA detection platform for early cancer detection
2021-Sep-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01039-4
PMID:34565398
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研究论文 | 本文提出了一种新型的mRNA检测平台，可用于早期胰腺癌检测 | 创新点在于采用目标触发的催化发夹组装策略与金增强点检测技术相结合的两步扩增方法，显著提高了检出灵敏度 | 检测方法对环境条件和样本处理过程有一定要求 | 研究旨在开发一种便携式且灵敏的mRNA检测平台，以实现胰腺癌的早期诊断 | 研究对象为胰腺癌细胞中的GPC1 mRNA及其外泌体 | 数字病理 | 胰腺癌 | 金增强点检测技术 | 催化发夹组装策略 | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Calibration-free counting of low molecular copy numbers in single DNA-PAINT localization clusters
2021-Dec-08, Biophysical reports
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.bpr.2021.100032
PMID:36425461
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研究论文 | 本文介绍了一种名为lbFCS+的扩展概念，能够在单个DNA-PAINT图像中对单个定位簇的分子拷贝数进行绝对计数 | lbFCS+通过精确测量DNA-PAINT成像中荧光标记的寡核苷酸（'成像器'）的局部杂交速率，实现了对单个纳米尺度体积内荧光位点的绝对计数，无需参考校准 | NA | 开发一种无需预先了解染料光物理学或参考校准的分子计数方法 | DNA-PAINT成像中的单个定位簇内的分子拷贝数 | 生物传感 | NA | DNA-PAINT | lbFCS+ | 图像 | 包含多达10个停靠链的定位簇 |
| 13 | 2024-08-07 |
Synthetic Perturbations in IL6 Biological Circuit Induces Dynamical Cellular Response
2021-Dec-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules27010124
PMID:35011356
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计基于肽的免疫调节电路，以靶向SOCS1活性，从而在利什曼原虫感染早期恢复促炎细胞因子表达，改变免疫反应从Th2型向Th1型转变 | 利用合成生物学方法设计新的免疫调节电路，靶向SOCS1活性，以改变利什曼原虫感染早期的免疫反应类型 | NA | 探索合成生物学在利什曼原虫感染早期免疫反应中的应用，特别是通过SOCS1/SOCS3免疫轴改变免疫反应类型 | 利什曼原虫感染中的巨噬细胞和免疫反应 | 生物学 | 利什曼病 | 合成生物学 | 数学模型 | 生物信号 | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Bioorthogonal regulation of DNA circuits for smart intracellular microRNA imaging
2021-Dec-08, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d1sc05214d
PMID:35003602
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研究论文 | 本文介绍了一种基于内源性DNA修复酶的预筛选策略，开发了一种顺序且特定于现场激活的催化DNA电路，用于实现高抗干扰能力的癌细胞选择性microRNA成像。 | 引入了前所未有的内源性DNA修复酶驱动的预筛选策略，提高了催化DNA电路的抗干扰能力。 | NA | 开发一种新的催化DNA电路，用于高可靠性的细胞内生物标志物检测。 | 癌细胞内的microRNA。 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
A Quaternary Code Correcting a Burst of at Most Two Deletion or Insertion Errors in DNA Storage
2021-Nov-27, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e23121592
PMID:34945898
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research paper | 本文提出了一种适用于DNA存储的四进制码设计，用于纠正最多两个连续的删除或插入错误 | 提出了新的四进制码设计，并证明了其能纠正最多两个连续的删除或插入错误 | NA | 解决DNA存储中的错误纠正问题 | DNA存储中的错误纠正码设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Enzyme Method-Based Microfluidic Chip for the Rapid Detection of Copper Ions
2021-Nov-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi12111380
PMID:34832792
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research paper | 本文报道了一种基于酶法的微流控芯片，用于快速检测海水中的铜离子 | 该芯片采用铜离子抑制辣根过氧化物酶（HRP）活性的方法，实现了对铜离子的快速检测，并具有裸眼和分光光度计两种检测模式 | NA | 开发一种快速检测海水铜污染的方法 | 海水中的铜离子 | NA | NA | 微流控技术 | NA | 溶液 | 使用了三个真实海水样本 |
| 17 | 2024-08-07 |
Development of Synthetic DNA Circuit and Networks for Molecular Information Processing
2021-Nov-04, Nanomaterials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/nano11112955
PMID:34835719
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综述 | 本文总结了近年来合成DNA电路及其在分子信息处理中的应用和研究进展 | 合成DNA电路通过其可编程设计和模块化特性，能够放大微弱信号并建立可编程的级联系统，适用于生物传感检测 | NA | 探讨合成DNA电路的机制和应用，为建立更先进的人工基因调控系统和智能分子传感工具提供基础 | 合成DNA电路及其在基因网络调控和分子信息处理中的应用 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Scaling DNA data storage with nanoscale electrode wells
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi6714
PMID:34818035
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research paper | 本文开发了一种纳米级DNA存储写入器，旨在提高DNA数据存储的写入密度 | 首次开发了纳米级DNA存储写入器，预计将DNA写入密度提高到25 × 10序列每平方厘米，比现有DNA合成阵列提高了三个数量级 | NA | 提高DNA数据存储的写入密度和容量 | DNA数据存储技术 | NA | NA | DNA合成技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Real-Time Investigation of Intracellular Polynucleotide Kinase Using a Cascaded Amplification Circuit
2021-11-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04033
PMID:34748706
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研究论文 | 本文开发了一种通过整合催化DNA组装和杂交链反应电路的级联DNA放大电路，实现了通过Förster共振能量转移（FRET）原理准确评估细胞内多核苷酸激酶（PNK）活性 | 提出了一个创新的级联DNA放大电路，通过λ核酸酶特异性消化5'-磷酸DNA和高信号增益的级联电路，实现了对PNK活性的敏感分析 | NA | 开发一种新的方法来实时监测和评估细胞内多核苷酸激酶的活性 | 细胞内多核苷酸激酶的活性 | 生物技术 | NA | Förster共振能量转移（FRET） | NA | DNA | 在HeLa细胞中进行了广泛探索 |
| 20 | 2024-08-07 |
Rational design of allosterically regulated toehold mediated strand displacement circuits for sensitive and on-site detection of small molecule metabolites
2021-Nov-22, The Analyst
DOI:10.1039/d1an01488a
PMID:34734587
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研究论文 | 本文开发了一种基于别构转录因子（aTF）调控的脚手架介导的链置换（TMSD）电路的生物传感器，用于非侵入性唾液样本中尿酸（UA）的检测 | 通过理性设计双通道TMSD电路，克服了天然HucR低配体亲和力的影响，提高了输出信号的富集和生物传感器的灵敏度 | NA | 开发快速、去中心化的小分子检测方法，满足日常健康监测和快速诊断的需求 | 尿酸（UA）的检测 | 生物传感器 | NA | 脚手架介导的链置换（TMSD）电路 | NA | 唾液样本 | NA |