生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 50 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-09-28 |
DNA circuits driven by conformational changes in DNAzyme recognition arms
2020-Feb-18, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra00115e
PMID:35492184
|
研究论文 | 本文提出了一种通过Mg驱动的E6型DNAzyme识别臂构象变化来调节DNA电路的策略 | 该策略改变了DNAzyme信号传输的单一模式，扩展了E6型DNAzyme的功能，并节省了分子尺度上的信号传输时间 | NA | 提高DNAzyme驱动的逻辑单元的效率 | DNAzyme识别臂的构象变化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-08-05 |
Bioinspired bio-voltage memristors
2020-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15759-y
PMID:32313096
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研究论文 | 本研究展示了一种利用来自细菌Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线制造的扩散型忆阻器，其能够在生物电压下工作 | 首次展示了一种能够在40-100 mV生物电压下工作的忆阻器，且其性能接近生物神经元 | 未提及此忆阻器在其他生物系统中的应用效果 | 研究和开发在生物电压下工作的忆阻器，以模仿生物计算 | 探讨以Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线为基础的忆阻器的特性与功能 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 电压信号 | NA |
| 3 | 2024-08-05 |
DNA nanotechnology assisted nanopore-based analysis
2020-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa095
PMID:32083656
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综述 | 本综述总结了DNA纳米技术在纳米孔分析中的应用潜力 | 本文创新点在于将DNA载体和DNA折纸结构结合，以提高纳米孔传感技术的能力和分辨率 | 本文未详细讨论纳米孔技术在实际应用中的所有挑战和局限性 | 探讨DNA纳米技术如何推动纳米孔检测技术的发展 | 相关的最新研究成果及其在纳米孔技术中的应用 | 纳米技术 | NA | 纳米孔技术 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-06 |
Encoding scheme for data storage and retrieval on DNA computers
2020-Sep, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2020.0157
PMID:33010141
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研究论文 | 本文提出了一种用于DNA计算机的数据存储和检索的编码方案 | 提出了一种具有可控冗余和可靠性的DNA数据存储编码方案 | 研究中未提及与现有存储介质的性能比较 | 探索有效的数据存储技术以应对不断增长的数据量 | DNA作为信息存储的介质 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | NA | 实验数据 | 三种不同类型的数据，冗余值为0.75 |
| 5 | 2024-08-06 |
RNA secondary structured logic gates for profiling the microRNA cancer biomarkers
2020-May, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2019.0150
PMID:32338625
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研究论文 | 本研究提出了一种用于检测微RNA癌症生物标志物的RNA二级结构逻辑门 | 创新点在于提出了多输入肝癌生物传感器，并使用RNA二级结构作为计算模块 | 文章中未提及任何具体的局限性 | 研究的目的是早期检测癌症病，特别是肝癌 | 本研究的对象是微RNA和肝癌生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | DNA计算 | 逻辑门 | NA | NA |
| 6 | 2024-08-06 |
Low cost DNA data storage using photolithographic synthesis and advanced information reconstruction and error correction
2020-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19148-3
PMID:33093494
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研究论文 | 本文展示了一种利用光引导合成的低成本DNA数据存储系统 | 创新点在于提出了一种成本更低、潜在速度更快的高误差合成技术，并开发了一套编码和重建信息的算法管道 | 所使用的高误差合成技术在速度优化时会导致较高的序列错误率 | 研究DNA作为一种长期存储介质的潜力，并改善当前DNA数据存储系统的成本和速度问题 | 研究对象为DNA数据存储系统及其信息编码和重建过程 | 数字病理学 | NA | 光引导合成 | NA | 文件数据 | 1个文件（包含莫扎特的乐谱） |
| 7 | 2024-08-06 |
Sequence-to-function deep learning frameworks for engineered riboregulators
2020-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18676-2
PMID:33028819
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研究论文 | 本文介绍了用于优化和重新设计脚趾开关的新型深度学习框架。 | 提出了Sequence-based Toehold Optimization and Redesign Model (STORM)和Nucleic-Acid Speech (NuSpeak)两种独特且协同的深度学习架构，优化脚趾开关的功能。 | 对设计规则的理解仍然有限，可能影响深度学习模型的应用范围。 | 研究新的生物电路组件设计方法，特别是脚趾开关的优化。 | 本文的研究对象是可编程的核酸传感器——脚趾开关。 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 卷积神经网络 | NA | 使用稀疏训练数据进行实验验证 |
| 8 | 2024-08-06 |
Recurrent architecture for adaptive regulation of learning in the insect brain
2020-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0607-9
PMID:32203499
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研究论文 | 本研究提供了果蝇幼虫学习中心的多巴胺能神经元的突触分辨率连通组图 | 探索了多巴胺能神经元活动的调控机制，并发现了与不同记忆系统相关的反馈神经元群体 | 研究主要集中在果蝇幼虫的神经回路，可能无法直接推广到其他物种 | 揭示驱动学习的多巴胺能神经元的上游电路 | 研究果蝇幼虫中多巴胺能神经元的电路连接和功能 | 数字病理学 | NA | 电路建模 | NA | 突触连接组 | 果蝇幼虫的学习中心神经元群体 |
| 9 | 2024-08-06 |
An Intelligent Optimization Algorithm for Constructing a DNA Storage Code: NOL-HHO
2020-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062191
PMID:32235762
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研究论文 | 本文提出了一种改进的哈里斯猎鹰优化算法NOL-HHO，用于构建DNA存储编码 | 引入了非线性控制参数策略和随机反向学习策略以增强算法性能 | 未提及具体的局限性 | 提升DNA存储编码的下界，以促进DNA存储技术的发展 | 23个广泛使用的基准函数 | 计算机视觉 | NA | NA | 哈里斯猎鹰优化算法 | NA | 23个基准函数 |
| 10 | 2024-08-07 |
Site-specific functionalization with amino, guanidinium, and imidazolyl groups enabling the activation of 10-23 DNAzyme
2020-May-14, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra02226h
PMID:35518333
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研究论文 | 本文研究了通过特定位置的功能化修饰，包括氨基、胍基和咪唑基团，来激活10-23 DNAzyme的方法 | 提出了一种基于腺嘌呤碱基的化学激活方法，通过引入氨基、胍基和咪唑基团到催化核心，实现更高效的DNAzyme | NA | 探索10-23 DNAzyme的更高效催化方法 | 10-23 DNAzyme的催化性能 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
DNA storage: research landscape and future prospects
2020-Jun, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa007
PMID:34692128
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综述 | 本文综述了DNA存储的基本理论、研究历史和技术挑战，并从定量角度评估了DNA作为新型数据存储介质的前景 | DNA作为一种稳定、资源和能源高效且可持续的数据存储解决方案 | NA | 探讨DNA存储的研究现状及未来前景 | DNA存储的理论、历史和技术挑战 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Propelling DNA Computing with Materials' Power: Recent Advancements in Innovative DNA Logic Computing Systems and Smart Bio-Applications
2020-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202001766
PMID:33344121
|
综述 | 本文综述了利用多种材料作为构建模块的DNA逻辑计算系统的最新进展及其在智能生物应用中的表现 | 介绍了基于不同“工具箱”材料的先进DNA计算系统，包括典型功能性DNA基序、DNA工具酶、非DNA生物材料、纳米材料或聚合物以及2D/3D DNA纳米结构 | 讨论了当前DNA计算领域的“致命弱点”和挑战，并提出了未来有前景的发展方向 | 总结DNA逻辑计算系统的最新成就，并探讨其在智能生物应用中的潜力 | DNA逻辑计算系统及其在智能分析/诊断、细胞成像/治疗等领域的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
A DNA algorithm for the job shop scheduling problem based on the Adleman-Lipton model
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242083
PMID:33264317
|
研究论文 | 提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决作业车间调度问题 | 开发了一种针对该问题的编码方案，并提出了用于算法的DNA计算操作 | NA | 解决作业车间调度问题 | 作业车间调度问题 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | 58个基准实例 |
| 14 | 2024-08-07 |
Target-directed enzyme-free dual-amplification DNA circuit for rapid signal amplification
2020-12-21, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d0tb02114h
PMID:33185637
|
研究论文 | 本文开发了一种无酶、单步快速信号放大的DNA电路，通过整合目标导向的熵驱动催化（EDC）和杂交链反应（HCR），用于核酸和小分子的分析 | 该电路利用熵驱动，无需酶参与，降低了成本，并通过隐藏的扩增触发器（T）设计避免了副产物的产生，提高了反应速率 | NA | 开发一种新型的无酶DNA电路，用于生物传感和高灵敏度检测 | 核酸和小分子，如血清样本中的ATP | 生物工程 | NA | 杂交链反应（HCR） | NA | DNA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Simple Tripedal DNA Walker Prepared by Target-Triggered Catalytic Hairpin Assembly for Ultrasensitive Electrochemiluminescence Detection of MicroRNA
2020-11-25, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.0c01864
PMID:33170660
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研究论文 | 本文采用无酶目标触发催化发夹组装（CHA）电路合成了一个三足DNA步行器，并通过在DNA轨道功能化电极上行走，构建了一个灵敏的电化学发光DNA纳米机器生物传感器，用于检测miRNA-21。 | 本文创新地使用无酶目标触发催化发夹组装技术，简化了多足DNA步行器的制备过程，并实现了高灵敏度和宽线性范围的miRNA检测。 | NA | 开发一种简单且高效的DNA步行器生物传感器，用于超灵敏检测miRNA。 | miRNA-21的检测 | 生物传感 | NA | 催化发夹组装（CHA） | DNA步行器 | DNA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Superparamagnetic Nanostructures Coupled with an Entropy-Driven DNA Circuit for Elegant and Robust Photoelectrochemical Biosensing
2020-11-17, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03580
PMID:33124411
|
研究论文 | 本文设计了一种基于熵驱动DNA信号放大与光电流表达分离模式的微小RNA-122光电化学生物传感器 | 采用多链复合结构替代DNA发夹结构，减少信号放大系统每一步的可逆性，并通过独特的熵增加机制提高反应效率和增强热稳定性及强特异性识别能力 | NA | 开发一种高性能的微小RNA监测方法 | 微小RNA-122 | 生物传感 | 癌症诊断 | 光电化学 | NA | DNA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Integrating CRISPR-Cas12a with a DNA circuit as a generic sensing platform for amplified detection of microRNA
2020-Jul-28, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d0sc03084h
PMID:33133487
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研究论文 | 本文介绍了一种将CRISPR-Cas12a与DNA电路合理整合的CRISPR-Dx方法，用于敏感且成本效益高的miRNA检测 | 通过设计模块化的催化发夹组装（CHA）电路，将每个目标转换并放大为多个可编程的DNA双链，作为触发器启动CRISPR-Cas12a的切割活性，实现信号的进一步放大 | NA | 开发一种新型的CRISPR-Dx方法，用于提高miRNA生物标志物的检测灵敏度和降低成本 | microRNA（miRNA）生物标志物 | 分子诊断 | NA | CRISPR-Cas12a | DNA电路 | DNA | 不同癌症细胞系和临床血清样本 |
| 18 | 2024-08-07 |
Construction of a simple and intelligent DNA-based computing system for multiplexing logic operations
2020-12, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2020.09.054
PMID:33035692
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研究论文 | 本文利用氧化石墨烯（GO）实现更复杂的大规模逻辑计算，首次通过GO与多种分类的单链DNA的独特相互作用作为反应平台，实现了6位平方根和9位立方根逻辑电路 | 首次利用GO与多种分类的单链DNA的独特相互作用，实现了大规模逻辑数学运算 | NA | 开发一种简单而高效的生物技术方法，用于高级和大规模逻辑数学运算 | 氧化石墨烯（GO）与单链DNA的相互作用 | 生物技术 | NA | DNA计算技术 | NA | DNA序列 | 多种分类的单链DNA |
| 19 | 2024-08-07 |
Parallelizing Assignment Problem with DNA Strands
2020-Jan, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/IJB.2020.195413.2547
PMID:32884959
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研究论文 | 本文提出了一种利用DNA计算解决分配问题的并行DNA算法 | 该算法能够在多项式时间内解决NP难问题，且仅需O(n²)初始DNA序列，相比其他方法的nn初始序列更为高效 | NA | 利用DNA计算解决NP难问题 | 分配问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA序列 | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Aptamer-Mediated Reversible Transactivation of Gene Expression by Light
2020-12-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202009240
PMID:32865316
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研究论文 | 本文介绍了一种基于光敏蛋白PAL与RNA适配体相互作用的CRISPR/dCAS9系统变体，用于光控基因表达激活 | 该平台显著减少了遗传操作所需的编码空间，并提供了一个强大的开启开关，在黑暗中几乎没有残留活性 | NA | 探索和操控具有亚细胞分辨率的细胞过程 | 光控基因表达激活系统 | 生物技术 | NA | CRISPR/dCAS9系统 | NA | NA | NA |