生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 41 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
A Characterization of the DNA Data Storage Channel
2019-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45832-6
PMID:31273225
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研究论文 | 本文通过分析实验数据，对DNA数据存储通道中的错误概率和分子丢失进行了定性和定量描述 | 首次对DNA数据存储通道中的错误和分子丢失进行了详细的定性和定量分析 | 仅基于已有实验数据进行分析，未涉及新的实验验证 | 为未来DNA数据存储系统的设计提供定性和定量的理解 | DNA数据存储通道中的错误和分子丢失 | NA | NA | PCR | NA | DNA | 涉及多个实验组的数据 |
| 22 | 2024-08-07 |
DNA assembly for nanopore data storage readout
2019-07-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10978-4
PMID:31270330
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研究论文 | 本文展示了使用便携式纳米孔测序平台成功解码存储在合成DNA短片段中的1.67兆字节信息，并设计验证了一种用于DNA存储的组装策略，显著提高了纳米孔测序的吞吐量 | 本文设计并验证了一种新的DNA存储组装策略，该策略可显著提高纳米孔测序的吞吐量，并可推广到任何需要纳米孔测序的小DNA扩增子的应用 | NA | 实现DNA数据存储的读取 | 合成DNA短片段中的数据存储 | 生物技术 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA | 1.67兆字节信息 |
| 23 | 2024-08-07 |
Controlling Matter at the Molecular Scale with DNA Circuits
2019-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了利用特定序列的DNA链感知环境信息并控制物质组装、解组装和重配置的多种机制 | 介绍了能够响应化学信号、光波长、pH值或电信号释放DNA链的接口，以及指导DNA纳米结构自组装和动态重配置的DNA链，这些接口有望使化学电路对响应性材料施加算法控制 | NA | 探讨DNA电路作为化学信息处理器在化学和材料系统中编程复杂行为的可能性 | DNA电路及其在物质分子尺度控制中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
A Novel Small RNA-Cleaving Deoxyribozyme with a Short Binding Arm
2019-06-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-44750-x
PMID:31160698
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研究论文 | 报道了一种新型的小RNA切割脱氧核酶10-12opt，该脱氧核酶具有较小的催化基序和异常短的结合臂 | 10-12opt脱氧核酶具有独特的催化结构，不同于常见的8-17脱氧核酶，且能切割8-17无法优先切割的某些微小RNA序列 | NA | 探索新型RNA切割脱氧核酶的存在及其催化机制 | 新型RNA切割脱氧核酶10-12opt及其催化特性 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Nucleic Acid Databases and Molecular-Scale Computing
2019-06-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.9b02562
PMID:31117381
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综述 | 本文综述了DNA作为存储介质和分子计算平台的研究进展，包括DNA存储架构和计算技术的最新成就 | 介绍了DNA存储和计算的新技术，如随机访问、纠错和内容可重写性，以及CRISPR逻辑门等 | 讨论了DNA存储和计算面临的工程挑战和潜在问题 | 探讨DNA在信息存储和分子计算领域的应用潜力 | DNA存储系统和分子计算技术 | 生物信息学 | NA | DNA合成与测序技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Driving the Scalability of DNA-Based Information Storage Systems
2019-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00100
PMID:31117362
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研究论文 | 本文利用化学标记从模拟5TB数据的复杂DNA数据库中选择性提取独特文件，并设计实施了一个嵌套文件地址系统，将DNA存储系统的理论最大容量提高了五个数量级 | 设计并实现了一个嵌套文件地址系统，显著提高了DNA存储系统的理论最大容量 | NA | 提高DNA存储系统的容量和文件访问能力 | DNA存储系统的组织和信息访问方法 | NA | NA | 化学标记 | NA | DNA数据 | 模拟5TB数据 |
| 27 | 2024-08-07 |
Cram-JS: reference-based decompression in node and the browser
2019-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz384
PMID:31099383
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cram-JS的JavaScript库，该库能够在Node和浏览器环境中对CRAM格式进行基于参考的实时解压缩 | Cram-JS是首个在JavaScript中实现CRAM格式解压缩的库 | NA | 开发一种能够在JavaScript环境中对CRAM格式进行解压缩的库 | CRAM格式的解压缩技术 | 生物信息学 | NA | CRAM格式解压缩 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Facile Strategy for Visible Disassembly of Spherical Nucleic Acids Programmed by Catalytic DNA Circuits
2019-Jun-05, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b02107
PMID:31083902
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研究论文 | 本文开发了一种简便策略，通过将基于DNA链置换的DNA电路与通用球形核酸聚集系统集成，实现球形核酸的可视化解体 | 该集成系统展示了快速比色响应和高灵敏度，并证明了其在单核苷酸多态性鉴别中的应用能力 | NA | 开发一种新方法用于球形核酸的可视化解体及其在DNA诊断和其他应用中的潜力 | 球形核酸的解体及其在单核苷酸多态性鉴别和复杂DNA网络中的应用 | NA | NA | DNA链置换反应 | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Versatile and Homogeneous DNA Tetraplex Platform for Constructing Label-Free Logic Devices: From Design to Application
2019-May-17, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.201900734
PMID:30933378
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA四链体结构的无需标记的逻辑设备平台，实现了多种高级逻辑功能，并应用于癌症相关micro-RNAs的智能生物传感分析 | 通过整合两种DNA四链体结构（G-四链体和i-motif），建立了一个完全无需标记且具有高度可扩展性的逻辑平台 | NA | 开发一种新型的DNA纳米技术平台，用于实现高级逻辑功能和多参数生物传感 | DNA四链体结构及其在逻辑电路和生物传感中的应用 | DNA纳米技术 | 癌症 | DNA四链体结构 | NA | DNA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
An Artificial Tissue Homeostasis Circuit Designed via Analog Circuit Techniques
2019-06, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2019.2907074
PMID:30908238
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研究论文 | 本文通过模拟电路技术设计了一种人工组织稳态电路，用于控制干细胞的增殖和分化 | 提出了一个结合对称和非对称干细胞分裂的新方案，并利用模拟电路设计中的反馈系统分析技术来优化设计参数 | NA | 设计一种能够可靠控制干细胞增殖和分化的稳态控制电路 | 干细胞的增殖和分化 | 生物工程 | 糖尿病 | 模拟电路设计 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Pattern Generation with Nucleic Acid Chemical Reaction Networks
2019-05-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.8b00625
PMID:30865429
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研究论文 | 本文探讨了利用核酸化学反应网络生成模式的可能性，特别是通过DNA计算和DNA纳米技术的设计工具 | 文章提出了利用DNA的可靠碱基配对和已知动力学特性，设计更复杂的合成化学反应网络，以及利用酶促过程作为生成器和放大器的新方法 | 目前核酸计算工具仍处于发展阶段，尚未完全实现从概念验证到应用驱动的转变 | 研究如何设计自主的核酸化学反应网络以生成模式，并探索其在智能材料开发中的应用潜力 | 主要研究对象为DNA及其在化学反应网络中的应用，以及相关的DNA计算和纳米技术工具 | 生物化学 | NA | DNA计算，DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Dynamically Programmed Switchable DNA Hydrogels Based on a DNA Circuit Mechanism
2019-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.201900490
PMID:30859712
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研究论文 | 本文构建了一种新型生物刺激响应性DNA水凝胶，该水凝胶基于DNA电路系统，通过级联的脚趾介导的DNA置换反应实现动态编程，能够对适当的DNA输入进行催化切割交联点和主链，从而实现从凝胶到溶胶的显著尖锐相变。 | 该研究引入了一种动态编程的DNA系统，通过DNA电路机制实现对DNA水凝胶的催化切割，使其相变更为尖锐，并且可以通过改变交联密度轻松调节溶胶-凝胶相变。 | NA | 开发一种新型的生物刺激响应性DNA水凝胶，用于医疗工程领域。 | DNA水凝胶的动态编程和相变特性。 | 生物医学工程 | NA | DNA电路系统，脚趾介导的DNA置换反应 | NA | DNA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Microcompartments for Protection and Isolation of Nanoscale DNA Computing Elements
2019-Mar-27, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b03143
PMID:30848118
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研究论文 | 本文报道了将类固醇响应性DNA适配体封装在巨型单层脂质体（GUVs）中，这些GUVs对类固醇输入具有渗透性，并展示了在GUVs内特定激活单个适配体的能力。 | 通过使用GUVs，不仅保护了DNA组件免受核酸酶的降解，还防止了互补链之间的非特异性交叉反应，从而实现了分子逻辑组件的并行执行。 | NA | 研究如何通过物理隔离分子计算元素来增加系统复杂性，并保护这些元素免受环境降解。 | 类固醇响应性DNA适配体及其在巨型单层脂质体（GUVs）中的封装和功能。 | 生物技术 | NA | 微流控平台 | NA | DNA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Resettable and enzyme-free molecular logic devices for the intelligent amplification detection of multiple miRNAs via catalyzed hairpin assembly
2019-Mar-14, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c8nr10103e
PMID:30839977
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研究论文 | 开发了一种基于磁珠/DNA系统的多级DNA逻辑门库，用于检测多个目标miRNAs | 成功应用miRNA催化的发夹组装（CHA）构建了两/三输入级联逻辑电路，并设计了一种高度敏感的多重检测系统，该系统具有重置功能 | NA | 简化逻辑分析以实现先进的逻辑诊断 | 多个目标miRNAs的检测 | 生物电子学 | NA | miRNA催化的发夹组装（CHA） | DNA逻辑门 | DNA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
DNA-based communication in populations of synthetic protocells
2019-04, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-019-0399-9
PMID:30833694
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'生物分子实现原细胞通信'（BIO-PC）的平台，用于在非脂质半透膜微胶囊群体间实现多通道分子通信。 | 利用无酶DNA链置换电路的模块化和可扩展性，开发了能够感知、处理和响应DNA基消息的原细胞共生体，并设计了多种生物化学通信设备，如级联放大、双向通信和分布式计算操作。 | NA | 开发基于正交通信通道的分子通信平台，以实现人工多细胞系统的工程化。 | 非脂质半透膜微胶囊群体间的多通道分子通信。 | 生物技术 | NA | DNA链置换电路 | NA | DNA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
In-memory computing on a photonic platform
2019-Feb, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aau5759
PMID:30793028
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研究论文 | 本文展示了如何在光子平台上实现内存计算，通过集成光学与数据存储和处理的结合，实现全光子内存计算。 | 本文采用基于相变材料GeSbTe的非易失性光子元件，实现了直接标量和矩阵向量乘法，具有新颖的单次操作和无漂移过程。 | NA | 探索超越冯·诺依曼架构的新计算范式，特别是在光子平台上实现内存计算。 | 集成光子电路在芯片计算中的应用。 | NA | NA | 集成光学 | NA | 光子元件 | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Mechanisms impairing blood pressure responses to nitrite and nitrate
2019-04-01, Nitric oxide : biology and chemistry
DOI:10.1016/j.niox.2019.01.015
PMID:30716418
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研究论文 | 本文综述了高血压治疗中硝酸盐和亚硝酸盐的生理活性和治疗潜力，以及影响这些化合物降压效果的因素 | 探讨了影响硝酸盐和亚硝酸盐降压效果的多种因素，包括饮食和吸烟来源的硫氰酸盐、抗菌漱口水、质子泵抑制剂等 | NA | 探讨硝酸盐和亚硝酸盐在高血压治疗中的作用机制及其潜在的干扰因素 | 高血压患者 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Electro-Mechanical Conductance Modulation of a Nanopore Using a Removable Gate
2019-02-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.8b09266
PMID:30715850
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研究论文 | 本文通过结合单分子电记录和全原子分子动力学模拟，展示了一种混合纳米孔系统，该系统能够实现其电导的分步变化和非线性电流-电压依赖性 | 开发了一种使用短柔性肽门的新型纳米孔系统，该肽门的两端带有相反的电荷，能够实现电导的步进变化和非线性调节 | NA | 探索人工系统中合成离子通道的开发，以实现对外部操作的电导变化响应 | 混合纳米孔系统及其电导调节机制 | 生物计算 | NA | 单分子电记录，全原子分子动力学模拟 | NA | 电信号 | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Allosteric DNAzyme-based DNA logic circuit: operations and dynamic analysis
2019-02-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1245
PMID:30541100
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研究论文 | 本文提出了一种基于别构DNAzyme的DNA逻辑电路，通过DNA链置换调控DNAzyme结构，实现对其活性的控制 | 引入了一种新的别构策略来调控DNAzyme的活性，无需改变DNA序列 | NA | 探索别构DNAzyme在DNA逻辑电路中的应用及其动态分析 | 别构DNAzyme及其在DNA逻辑电路中的操作 | 生物计算 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Suitability of dried DNA for long-range PCR amplification and HLA typing by next-generation sequencing
2019-Feb, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2018.12.002
PMID:30529364
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研究论文 | 本文比较了两种DNA存储方法（干燥和传统-80°C）的样本特性，评估了DNA的纯度、片段长度以及使用下一代测序进行HLA分型的能力 | 探讨了干燥状态下DNA存储的可行性，为实验室提供了一种新的样本存储和运输方法 | NA | 研究干燥状态下DNA存储的适用性及其对下游应用的影响 | DNA的存储方法及其对样本质量的影响 | 基因组学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA | NA |