生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-09-02 |
From deep learning to mechanistic understanding in neuroscience: the structure of retinal prediction
2019-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:35283616
|
研究论文 | 本文通过结合降维和现代归因方法，开发了一种系统方法来从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，并应用于视网膜的深度网络模型，揭示了视网膜作为预测特征提取器的工作原理 | 本文提出了一种新的系统方法，通过结合降维和现代归因方法，从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，为深度网络作为神经科学模型提供了更坚实的理论基础 | 本文主要关注于从深度网络模型中提取计算机制，并应用于视网膜模型，但未涉及其他生物神经网络模型 | 研究如何从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，并将其应用于神经科学领域 | 视网膜的深度网络模型 | 神经科学 | NA | 深度学习 | 深度前馈神经网络 | 视觉刺激 | NA |
| 2 | 2024-08-05 |
High capacity DNA data storage with variable-length Oligonucleotides using repeat accumulate code and hybrid mapping
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0211-2
PMID:31832092
|
研究论文 | 本文提出了一种使用变长寡核苷酸的高容量DNA数据存储方案 | 提出了一种新的编码系统，结合混合DNA映射方案和寡核苷酸级的重复累积编码，有效解决数据损失和腐败问题 | 未提及具体的实验范围限制 | 探讨高容量DNA数据存储的实用实施 | 开发一种新的DNA数据存储方案以提高信息容量 | 数字病理学 | NA | DNA映射 | NA | 数字数据 | 379.1 KB的数据 |
| 3 | 2024-08-05 |
A Janus-inspired amphichromatic system that kills two birds with one stone for operating a "DNA Janus Logic Pair" (DJLP) library
2019-Aug-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c9sc01865d
PMID:31588299
|
研究论文 | 本文提出了一种受Janus启发的DNA Janus逻辑对(DJLP)库的双重操作系统 | 首次提出的DJLP概念将相反功能的DNA逻辑门分类为积极和消极，显著提升了操作效率和可视化输出 | 未明确说明系统在极端条件下的表现或局限性 | 研究目的在于改善现有DNA逻辑门的运行效率和可视化能力 | 该研究对象为具有不同功能的DNA逻辑门 | 计算机视觉 | NA | G-quadruplex DNAzyme (G4zyme) 及氧化3,3',5,5'-四甲基苯氨基(TMB) | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-06 |
Image Encryption Based on Pixel-Level Diffusion with Dynamic Filtering and DNA-Level Permutation with 3D Latin Cubes
2019-Mar-24, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e21030319
PMID:33267033
|
研究论文 | 本文提出了一种结合超混沌系统、像素级动态滤波和DNA计算的新型图像加密方法DFDLC | 创新点在于将5D超混沌系统与动态滤波和DNA计算结合到图像加密过程中 | NA | 研究图像安全中的图像加密技术 | 对公共测试图像进行加密实验 | 计算机视觉 | NA | DNA计算 | 超混沌系统 | 图像 | 大量公共测试图像 |
| 5 | 2024-08-07 |
A DNAzyme-amplified DNA circuit for highly accurate microRNA detection and intracellular imaging
2019-Nov-07, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c9sc03552d
PMID:32055333
|
研究论文 | 本文设计了一种等温连接的核酸扩增系统，用于高精度microRNA检测和细胞内成像 | 该系统由引导催化发夹组装（CHA）、中间杂交链反应（HCR）和最终的DNA酶放大单元组成，通过协同信号放大实现对miRNA的放大分析和精确细胞内成像 | NA | 开发一种高灵敏度和准确性的生物传感技术，用于临床研究中的生物标志物分析 | microRNA的检测和细胞内成像 | 生物工程 | NA | DNA酶放大技术 | NA | DNA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Interactions between PHD3-Bromo of MLL1 and H3K4me3 Revealed by Single-Molecule Magnetic Tweezers in a Parallel DNA Circuit
2019-12-18, Bioconjugate chemistry
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acs.bioconjchem.9b00665
PMID:31714753
|
研究论文 | 本文利用单分子磁力钳在并行DNA电路中研究了PHD3-Bromo与H3K4me3之间的蛋白质-蛋白质相互作用 | 提出了一种使用单分子磁力钳和并行DNA电路的新策略，避免了蛋白质聚集问题，并扩展了生物正交偶联的选择 | NA | 揭示PHD3-Bromo与H3K4me3之间的蛋白质-蛋白质相互作用的详细机制 | PHD3-Bromo与H3K4me3之间的相互作用 | 生物技术 | 白血病 | 单分子磁力钳 | NA | 蛋白质相互作用 | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
An Autonomous Nonenzymatic Concatenated DNA Circuit for Amplified Imaging of Intracellular ATP
2019-12-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b04126
PMID:31668059
|
研究论文 | 构建了一种基于自主非酶级联杂交链反应（Ca-HCR）电路的鲁棒ATP适体传感器，用于细胞内成像 | 该适体传感器通过FRET转导机制，利用双层HCR电路实现高信号增益，并可通过MATLAB模拟整个反应过程 | NA | 开发一种高灵敏度和选择性的ATP适体传感器，用于细胞内ATP的检测和成像 | 细胞内ATP的表达 | 生物技术 | NA | 杂交链反应（HCR） | NA | 图像 | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
DNA-strand molecular beacon optical processor
2019-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2019.e02389
PMID:31687539
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA分子的光学处理器模型，该模型能够提高并行性并大幅减少人工干预 | 该模型能够在单一层次上解决包含多种类型门电路的布尔电路，提高了并行性并减少了氮基的使用 | NA | 探索和优化基于DNA计算的并行处理能力 | DNA计算模型及其在布尔电路中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Correlates of longitudinal leukocyte telomere length in the Costa Rican Longevity Study of Healthy Aging (CRELES): On the importance of DNA collection and storage procedures
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0223766
PMID:31603943
|
研究论文 | 研究旨在识别拉丁美洲人群中白细胞端粒长度（LTL）的协变量，特别是LTL与36个社会人口统计学、早期童年和健康特征以及DNA样本收集和存储程序的关联 | 发现样本收集程序和DNA冰箱存储时间与LTL有强烈关联，并提出了在LTL研究中控制这些因素的重要性 | 由于未观察到的测量变异成分，统计控制可能不如标准化数据收集程序有效 | 研究白细胞端粒长度与多种因素的关联，并探讨DNA收集和存储程序对LTL的影响 | 来自哥斯达黎加长寿与健康衰老研究（CRELES）的1,261名60岁以上的个体 | NA | NA | 随机效应回归模型 | 随机效应回归模型 | 面板数据 | 1,261名60岁以上的个体 |
| 10 | 2024-08-07 |
Simulating the Monty Hall problem in a DNA sequencing machine
2019-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究在高通量DNA测序机中模拟并证明了蒙提霍尔问题，通过简单的编码方式，所有可能的情景由DNA寡核苷酸表示，游戏决策通过从特定位置测序这些寡核苷酸实现 | 本研究首次在高通量DNA测序机中模拟蒙提霍尔问题，展示了DNA测序技术在DNA计算问题中的新应用 | NA | 探索并证明蒙提霍尔问题在DNA测序机中的模拟 | 蒙提霍尔问题的模拟与证明 | NA | NA | DNA测序 | NA | DNA寡核苷酸 | 超过12,000,000次独立游戏模拟 |
| 11 | 2024-08-07 |
Nicking-Assisted Reactant Recycle To Implement Entropy-Driven DNA Circuit
2019-10-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b07521
PMID:31539231
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于切割辅助的反应物回收策略，用于在熵驱动的DNA电路中实现反应物的回收 | 提出了一种新的切割辅助回收策略，使双链DNA废物能够转化为活性成分，参与下一轮反应 | NA | 开发新的反应物回收方法，提高熵驱动DNA电路反应的可回收性 | 单层电路和多层双层电路的设计与分析 | 分子编程 | NA | DNA电路 | NA | DNA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Coupling of DNA Circuit and Templated Reactions for Quadratic Amplification and Release of Functional Molecules
2019-10-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b05688
PMID:31538784
|
研究论文 | 本文展示了将DNA电路与模板反应耦合，以实现小分子输出的高级别放大 | 首次实现了DNA电路与模板反应的耦合，使得小分子输出的放大成为可能 | NA | 探索DNA电路与模板反应耦合的可能性，以实现小分子的高级别放大 | DNA电路与模板反应的耦合机制 | NA | NA | DNA电路，模板反应 | NA | 核酸 | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
A catalytic DNA circuit-programmed and enzyme-powered autonomous DNA machine for nucleic acid detection
2019-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/c9an01568j
PMID:31528926
|
研究论文 | 本文设计了一种催化DNA电路，利用切割内切酶在三链DNA探针上的作用，自主驱动酶动力DNA机器进行一步、等温且自催化的核酸分析 | 创新性地设计了催化DNA电路，实现了自主驱动的酶动力DNA机器 | 未提及 | 开发一种新型的核酸检测方法 | 催化DNA电路和酶动力DNA机器 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 未提及 |
| 14 | 2024-08-07 |
An enzyme-free DNA circuit for the amplified detection of Cd2+ based on hairpin probe-mediated toehold binding and branch migration
2019-Oct-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c9cc06311k
PMID:31531427
|
研究论文 | 设计了一种基于发夹探针介导的脚趾结合和分支迁移的无酶DNA电路，用于放大检测Cd2+ | 利用Cd2+特异性适配体识别Cd2+，并通过G-四链体报告检测信号，实现了无酶的放大检测方法 | NA | 开发一种新型的无酶DNA电路，用于高灵敏度检测Cd2+ | Cd2+的检测 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | 检测限为5 pM |
| 15 | 2024-08-07 |
Data storage in DNA with fewer synthesis cycles using composite DNA letters
2019-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0240-x
PMID:31501560
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用复合DNA字母减少合成周期的DNA数据存储编码和解码方法 | 开发了利用复合DNA字母的编码和解码方法，减少了数据存储所需的合成周期 | NA | 探索DNA作为长期数据存档介质的可行性，并减少合成周期 | DNA数据存储技术及其编码解码方法 | NA | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | 6.4 MB数据 |
| 16 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted waste-to-reactant transformation to engineer renewable DNA circuits
2019-Sep-24, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c9cc05941e
PMID:31501837
|
研究论文 | 本文通过使用切割酶辅助的废物到反应物的转化方法，解决了可再生DNA电路中反应物耗尽和废物积累的问题 | 本文创新性地使用了切割酶辅助的废物到反应物的转化方法，同时解决了反应物耗尽和废物积累的问题 | NA | 实现可再生的DNA电路 | 可再生DNA电路 | NA | NA | 切割酶辅助的废物到反应物的转化 | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
A novel bio-heuristic computing algorithm to solve the capacitated vehicle routing problem based on Adleman-Lipton model
2019-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2019.103997
PMID:31369836
|
研究论文 | 本文提出了一种基于Adleman-Lipton模型的生物启发式计算算法，用于解决容量约束的车辆路径问题 | 利用DNA分子操作和生物启发式计算模型，提出了一种并行生物计算算法，以O(n)时间复杂度搜索问题解决方案 | NA | 解决容量约束的车辆路径问题，并验证DNA并行算法的实用性 | 容量约束的车辆路径问题 | 计算数学 | NA | DNA计算 | 生物启发式计算模型 | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Monitoring long-term DNA storage via absolute copy number quantification by ddPCR
2019-10-15, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2019.113363
PMID:31310737
|
研究论文 | 本文通过测试最先进的液滴数字PCR（ddPCR）技术，实现了无需标准曲线的绝对DNA拷贝数定量，用于监测DNA的长期存储。 | ddPCR技术能够准确确定质粒DNA标准的水平，并对由于降解或吸附导致的DNA损失敏感。此外，发现了低结合管中DNA吸附的渐进过程，这一现象之前未被注意到。 | 尽管ddPCR技术在监测DNA存储方面表现出色，但对于高度稀释的DNA（<0.2 μg/mL）的回收率影响显著，需要添加载体DNA来改善。 | 验证ddPCR技术作为监测DNA长期存储的理想方法，并提供改善高度稀释DNA回收率的有效途径。 | 研究对象包括质粒DNA标准和几种低结合管中的DNA吸附过程。 | 生物医学研究 | NA | 液滴数字PCR（ddPCR） | NA | DNA | 涉及质粒DNA标准和几种低结合管中的DNA样本 |
| 19 | 2024-08-07 |
Telomere Shortening in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative Cohort
2019, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-190010
PMID:31322561
|
研究论文 | 研究阿尔茨海默病神经影像学倡议队列中端粒缩短与阿尔茨海默病诊断和进展的关系 | 本研究首次探讨了端粒长度随时间变化与阿尔茨海默病进展的关联 | 研究结果显示端粒缩短与阿尔茨海默病进展的关联不显著，可能需要更大样本和特定亚组进一步研究 | 探讨端粒长度变化与阿尔茨海默病诊断和进展的关联 | 阿尔茨海默病神经影像学倡议队列中的653名个体 | NA | 阿尔茨海默病 | 定量PCR | 混合效应模型 | T/S比率 | 1918个样本（经过质量控制） |
| 20 | 2024-08-07 |
A dandelion-like liposomes-encoded magnetic bead probe-based toehold-mediated DNA circuit for the amplification detection of MiRNA
2019-Aug-07, The Analyst
DOI:10.1039/c9an00887j
PMID:31268436
|
research paper | 本文提出了一种基于脂质体编码磁珠探针和脚手架介导的DNA电路的miRNA检测方法 | 该方法利用脚手架介导的环状链置换反应和脂质体多标签放大，实现了miRNA-21的低至0.7 fM的定量检测，无需酶放大或精密仪器 | NA | 开发简便且灵敏的miRNA定量检测方法，用于miRNA相关疾病的早期诊断 | miRNA-21的检测 | 生物技术 | miRNA相关疾病 | 脚手架介导的环状链置换反应 | NA | miRNA | NA |