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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-06 |
Bridging the Two Worlds: A Universal Interface between Enzymatic and DNA Computing Systems
2015-May-26, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201411148
PMID:25864379
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研究论文 | 本文开发了一种通用接口,连接了酶计算和DNA计算系统 | 提出了一种能够实现不兼容的核酸和酶计算系统之间通信的接口 | NA | 探索如何将酶计算系统与DNA计算系统结合以提升功能 | 酶计算系统和DNA计算系统 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Ternary DNA computing using 3 × 3 multiplication matrices
2015-Feb-01, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c4sc02930e
PMID:29560214
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研究论文 | 本文介绍了一种使用三值寡核苷酸输入构建3×3乘法表的DNA计算方法 | 首次将DNA作为功能材料用于三进制计算,并展示了如何使用三值输入构建乘法表 | NA | 探索非布尔计算在多值变量操作上的应用,特别是使用DNA进行三进制计算 | 三值寡核苷酸输入和荧光/淬灭功能发夹结构 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA序列 | 系统包含两个三值输入(-1; 0; +1)和九种纳米结构 |
3 | 2024-08-07 |
Polarizability of Six-Helix Bundle and Triangle DNA Origami and Their Escape Characteristics from a Dielectrophoretic Trap
2015-Dec-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5b02524
PMID:26570981
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研究论文 | 本文通过实验测定了六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率,并研究了它们在介电电泳陷阱中的逃逸特性 | 首次实验测定了六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率,并利用改进的Kramer速率模型分析了它们的逃逸特性 | NA | 研究DNA折纸在介电电泳中的迁移和定位方法 | 六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率和逃逸特性 | 纳米技术 | NA | 介电电泳(iDEP) | NA | 实验数据 | 六螺旋束和三角形DNA折纸 |
4 | 2024-08-07 |
Coupling a universal DNA circuit with graphene sheets/polyaniline/AuNPs nanocomposites for the detection of BCR/ABL fusion gene
2015-Aug-19, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.06.050
PMID:26343430
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研究论文 | 本文介绍了一种新型方法,通过将通用DNA电路与石墨烯片/聚苯胺/金纳米粒子纳米复合材料(GS/PANI/AuNPs)结合,用于高灵敏度和特异性地检测慢性髓性白血病(CML)中的BCR/ABL融合基因(bcr/abl)。 | 设计了一种转换器发夹(HP)以获得具有良好信噪比的通用DNA电路,并引入了具有优异导电性和扩大有效区域的GS/PANI/AuNPs,进一步提高了信号放大。 | NA | 开发一种高灵敏度和特异性的方法,用于检测慢性髓性白血病中的BCR/ABL融合基因。 | BCR/ABL融合基因(bcr/abl) | 生物传感 | 慢性髓性白血病 | 催化发夹组装(CHA) | NA | DNA | 检测范围从10 pM到20 nM,检测限为1.05 pM |
5 | 2024-08-07 |
Universal strategy to engineer catalytic DNA hairpin assemblies for protein analysis
2015-Aug-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5b02504
PMID:26237634
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研究论文 | 本文展示了一种合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为有效催化剂,加速催化发夹组装(CHA)反应,从而扩展CHA在蛋白质分析中的应用 | 提出了一种通用策略,通过使用合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为催化剂,来构建蛋白质响应的CHA | NA | 开发针对多种重要蛋白质生物标志物的特定CHA,并探索其在人类血清样本和癌细胞中检测特定蛋白质生物标志物的应用潜力 | 人α-凝血酶、人前列腺特异性抗原和人表皮生长因子受体2等蛋白质生物标志物 | 生物传感 | NA | 催化发夹组装(CHA) | NA | DNA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Design of a DNA-based reversible arithmetic and logic unit
2015-Aug, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2014.0056
PMID:26224353
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研究论文 | 本研究利用脱氧核糖核酸(DNA)实现了一个算术逻辑单元(ALU),该ALU在计算过程中保持逻辑可逆性,并能执行四种逻辑(与、或、异或和非)和三种算术(加、减和乘)操作 | 相较于硅基计算,提出的ALU由于并行性、复制特性、紧凑性和DNA链的形成,速度更快且所需空间和功率更少。此外,与现有的DNA基系统相比,每个步骤所需的信号更少,且所需的生物步骤也更少 | NA | 实现基于DNA的算术逻辑单元 | 基于DNA的算术逻辑单元及其在逻辑和算术操作中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Signal-to-Noise Ratio Measures Efficacy of Biological Computing Devices and Circuits
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00093
PMID:26177070
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研究论文 | 本文通过定量信号-噪声比分析,探讨了生物计算设备和电路的效能提升方法 | 提出了一种基于信号-噪声比分析的方法,用于评估和改进生物计算设备的性能 | 目前没有足够的库能满足通用电路工程的需求 | 提高生物计算设备和电路的可预测性和有效性 | 生物计算设备及其在复杂环境中的性能 | 生物工程 | NA | 信号-噪声比分析 | NA | 输入/输出曲线和表达噪声数据 | 涉及当前抑制剂库的分析 |
8 | 2024-08-07 |
An analytical approach to bistable biological circuit discrimination using real algebraic geometry
2015-Jul-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.0288
PMID:26109633
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研究论文 | 本文探讨了利用19世纪的实代数几何工具——斯图姆定理,来比较功能等效的双稳态生物电路的可行性,无需数值模拟 | 首次将斯图姆定理应用于生物分子电路的分析,提供了一种新的方法来比较不同电路设计的参数空间 | NA | 研究不同双稳态生物电路之间的差异,特别是为合成生物学家选择最佳电路设计提供理论支持 | 双稳态生物分子电路及其在参数空间中的行为 | 生物技术 | NA | 实代数几何 | NA | 电路拓扑结构 | NA |
9 | 2024-08-07 |
Chemical computing with reaction-diffusion processes
2015-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2014.0219
PMID:26078345
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研究论文 | 本文探讨了化学反应扩散过程在信息处理中的应用,特别是通过Belousov-Zhabotinsky(BZ)反应及其光敏变体来展示化学信息处理的思路 | 展示了信息处理的计算普遍性,并描述了不同信息编码方法下最简单的信号处理设备的构建 | NA | 探讨化学反应扩散过程是否能被用于生成化学信息处理设备 | 化学反应扩散过程及其在信息处理中的应用 | NA | NA | Belousov-Zhabotinsky(BZ)反应 | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
A parallel algorithm for solving the n-queens problem based on inspired computational model
2015-May, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2015.03.004
PMID:25817410
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研究论文 | 本文提出了一种基于生物启发计算模型的并行DNA算法,用于解决n皇后问题 | 利用DNA分子操作解决n皇后问题,简化了计算复杂度并验证了DNA算法的可行性 | NA | 开发一种新的并行算法来解决计算难题 | n皇后问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | DNA分子 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Enzyme-regulated the changes of pH values for assembling a colorimetric and multistage interconnection logic network with multiple readouts
2015-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.02.026
PMID:25819791
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研究论文 | 本文开发了一种基于酶反应触发pH值变化和生物计算的新型多级互联生物网络,具有多个易于检测的信号输出 | 与传统的化学计算相比,基于酶的生物系统能够克服反应间的干扰或单个计算门的不兼容性,为组装多组分/多功能逻辑电路提供了独特的机会 | NA | 开发一种新型的多级互联生物网络,用于实现成本效益高、无需标记且可通过肉眼进行颜色逻辑操作的方法 | 酶输入(β-半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶、酯酶和脲酶)以及信号转导器(金纳米颗粒和酸碱指示剂)或pH计 | 生物计算 | NA | 酶反应 | 多级互联生物网络 | 信号输出 | 包括四种酶输入 |
12 | 2024-08-07 |
Versatile G-quadruplex-mediated strategies in label-free biosensors and logic systems
2015-Apr-21, The Analyst
DOI:10.1039/c4an02282c
PMID:25705973
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研究论文 | 本文探讨了G-四链体(G4)在无标记生物传感器和逻辑系统中的应用 | 利用G4的过氧化物酶样活性和G4增强的发光特性,结合G4与其他功能性核酸的耦合,扩展了其应用范围 | 存在抗干扰能力低和多重分析能力有限的问题 | 研究G-四链体在生物分析和复杂DNA计算中的应用潜力 | G-四链体及其复合物在生物传感器和逻辑系统中的应用 | 生物传感器 | NA | NA | NA | NA | NA |
13 | 2024-08-07 |
Comparison of eleven methods for genomic DNA extraction suitable for large-scale whole-genome genotyping and long-term DNA banking using blood samples
2015, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0115960
PMID:25635817
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研究论文 | 本研究比较了十一种从绵羊血液样本中提取基因组DNA的方法,以确定它们在大规模全基因组基因分型和长期DNA存储中的相对有效性 | 本研究首次系统比较了多种DNA提取方法,并确定了四种最适合大规模微阵列基因分型和长期DNA存储的方法 | 研究仅限于绵羊血液样本,可能不适用于其他物种或其他类型的样本 | 评估不同DNA提取方法在大规模基因分型和长期DNA存储中的有效性 | 绵羊血液样本中的基因组DNA | 基因组学 | NA | 下一代测序技术,微阵列技术 | NA | 基因组DNA | 600个个体 |
14 | 2024-08-07 |
Evolving Transport Networks With Cellular Automata Models Inspired by Slime Mould
2015-Sep, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2014.2361731
PMID:25438333
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞自动机的网络设计模型,灵感来源于黏菌的传播策略和计算能力 | 该模型通过模拟黏菌的传播策略和网络形成能力,提供了一种高效的生物启发计算设备设计方法 | 使用活体黏菌构建的计算设备速度极慢,需要数天时间执行计算 | 旨在开发一种高效的生物启发计算设备,用于解决难以通过传统算法解决的计算智能问题 | 研究对象为黏菌Physarum polycephalum及其在网络设计中的应用 | 计算智能 | NA | 细胞自动机(CA) | 细胞自动机(CA) | 网络数据 | NA |