生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 25 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-06 |
Structural DNA nanotechnology: state of the art and future perspective
2014-Aug-13, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja505101a
PMID:25029570
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评论 | 文章讨论了结构性DNA纳米技术的最新进展和未来前景 | 提出了DNA作为纳米构建模块的创新应用以及基于DNA的分子设计和编程中的挑战和机会 | 没有详细说明具体的实验数据或案例研究 | 探讨结构性DNA纳米技术领域的现状及未来发展方向 | 研究DNA纳米结构及其在各个领域的应用 | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-08-06 |
Engineering self-contained DNA circuit for proximity recognition and localized signal amplification of target biomolecules
2014-Aug, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gku655
PMID:25056307
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研究论文 | 设计了一种动态DNA电路，用于识别近距离的目标生物分子并实现局部信号增强 | 构建了自包含的DNA电路，能够自主组装并在目标分子附近产生局部信号，具有较低的交叉干扰 | 本研究仅基于α-thrombin作为模型蛋白，未探讨其他生物分子的适用性 | 开发一种简单的方法来感测生物分子的近距离相互作用 | 主要针对α-thrombin蛋白进行性能评估 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | 单次混合步骤检测50 nM-5 μM浓度的α-thrombin |
| 3 | 2024-08-07 |
DNA storage under high temperature conditions does not affect performance in human leukocyte antigen genotyping via next-generation sequencing (DNA integrity maintained in extreme conditions)
2014-Dec, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2014.0036
PMID:25496152
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研究论文 | 本研究测试了在极端条件下长期存储于GenTegra DNA稳定化矩阵中的基因组DNA的完整性，并通过下一代测序（NGS）进行人类白细胞抗原（HLA）基因分型。 | 本研究展示了GenTegra产品在高温和温度波动条件下作为基因组DNA保存工具的有效性。 | NA | 测试在极端条件下长期存储的基因组DNA的完整性，并评估其在下游分子应用中的性能。 | 基因组DNA的完整性和性能。 | 分子生物学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | DNA | 多个基因组DNA样本 |
| 4 | 2024-08-07 |
How MAP kinase modules function as robust, yet adaptable, circuits
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/cc.29349
PMID:25483189
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研究论文 | 本文通过计算模拟研究了MAP激酶模块的3层拓扑结构及其在生物电路中的稳健性和适应性 | 提出了一个基本的2层电路拓扑结构，该结构可以通过反馈回路和支架重新配置，生成多样化的信号输出，从而形成既稳健又适应的3层模块化配置 | NA | 理解稳健且适应性强的模块如何影响真核生物的进化，并为进化生物学和合成生物学提供信息 | MAP激酶模块及其在生物电路中的功能 | 生物学 | NA | 计算模拟 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Parts & pools: a framework for modular design of synthetic gene circuits
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00042
PMID:25340051
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研究论文 | 本文介绍了Parts & Pools框架，该框架用于模块化设计细菌和真核细胞的合成基因电路 | Parts & Pools框架首次实现了对真核生物电路组件的适当形式化描述，并采用了基于规则的建模技术 | NA | 开发一个用于自动设计和可视化模块化合成基因电路的框架 | 细菌和真核细胞的合成基因电路 | 生物工程 | NA | 基于规则的建模 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Freezing and storage at -20 °C provides adequate preservation of Toxoplasma gondii DNA for retrospective molecular analysis
2014-Nov, Diagnostic microbiology and infectious disease
IF:2.1Q3
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研究论文 | 本文研究了在-20°C和-80°C条件下储存的弓形虫DNA对实时PCR检测的影响 | 本文首次比较了不同储存温度对弓形虫DNA检测的影响 | NA | 探讨弓形虫DNA在不同储存条件下的长期保存效果 | 弓形虫DNA的储存条件 | NA | 弓形虫病 | 实时PCR | NA | DNA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Neural networks and neuroscience-inspired computer vision
2014-Sep-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2014.08.026
PMID:25247371
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综述 | 本文回顾了神经科学和计算机科学之间的历史联系，并展望了基于生物启发计算机视觉和实验神经科学方法的快速发展，可能带来的新合作时代。 | 探讨了神经科学启发算法在计算机视觉中的成功应用和现有局限，并指出了未来可能取得进展的领域。 | 文章主要为综述性质，未提供具体的研究数据或实验结果。 | 探讨神经科学与计算机科学之间的交叉合作，特别是在生物启发计算机视觉领域的应用。 | 神经科学启发算法在计算机视觉中的应用及其效果。 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Cross-kingdom chemical communication drives a heritable, mutually beneficial prion-based transformation of metabolism
2014-Aug-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2014.07.025
PMID:25171409
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研究论文 | 研究报告了一种跨界的化学通讯系统，通过该系统细菌可以遗传性地改变酵母的代谢 | 首次报道了细菌通过分泌化学因子诱导酵母中的[GAR(+)]元素，从而改变酵母的代谢，使其在葡萄糖存在下利用多种碳源 | NA | 探索生物界间的化学通讯及其对代谢的遗传性影响 | 细菌与酵母的相互作用及其对酵母代谢的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
A Cerebellar Neuroprosthetic System: Computational Architecture and in vivo Test
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00014
PMID:25152887
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研究论文 | 本文展示了通过计算模型替换小脑电路以实现神经假体系统的可行性，并进行了活体测试 | 开发了一种小脑神经假体系统，通过计算模型模拟小脑微电路的学习功能，并在活体动物中验证了其有效性 | 生物信号的非平稳性限制了小脑模型的性能 | 验证通过神经假体系统替换受损神经回路的可行性，并实现对小脑学习功能的恢复 | 小脑电路及其在条件反射学习中的作用 | NA | NA | 计算模型 | 小脑微电路模型 | 生理记录数据 | 实验涉及多只麻醉大鼠 |
| 10 | 2024-08-07 |
Strip biosensor for amplified detection of nerve growth factor-beta based on a molecular translator and catalytic DNA circuit
2014-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/c4an00908h
PMID:25068151
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研究论文 | 本文展示了一种基于分子翻译器和催化DNA电路的新型视觉检测方法，用于检测神经生长因子-β（NGF-β） | 该方法利用基于结合诱导的DNA链置换反应的分子翻译器将输入蛋白转换为输出DNA信号，并通过催化DNA电路进行信号放大，实现了高灵敏度和选择性的检测 | NA | 开发一种新型的生物传感器，用于高灵敏度和选择性地检测神经生长因子-β | 神经生长因子-β（NGF-β） | 生物传感器 | NA | DNA链置换反应 | 催化DNA电路 | DNA | 动态响应范围从10 fM到10 pM，检测限为10 fM的NGF-β |
| 11 | 2024-08-07 |
Intelligent layered nanoflare: "lab-on-a-nanoparticle" for multiple DNA logic gate operations and efficient intracellular delivery
2014-Aug-07, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c4nr01676a
PMID:24969570
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研究论文 | 本研究开发了一种新型DNA纳米装置——智能分层纳米闪光，它通过在单个金纳米颗粒上自组装DNA闪光，实现了纳米尺度的DNA计算 | 智能分层纳米闪光能够执行多种布尔逻辑门操作，并能作为单个实体进行细胞内DNA逻辑门传递，无需商业转染剂或其他辅助载体 | NA | 解决裸DNA结构细胞内化不足及多组分分离的问题，扩展DNA电路在生物系统中的应用 | DNA纳米装置的开发及其在细胞内传递和逻辑门操作中的应用 | 纳米技术 | NA | DNA自组装 | NA | 纳米颗粒 | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Assessment of DNA encapsulation, a new room-temperature DNA storage method
2014-Jun, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2013.0082
PMID:24955733
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研究论文 | 评估一种新的常温DNA存储方法，即在无氧和无水的环境中，将来自人体组织、细菌和植物的DNA样本存储在激光密封的不锈钢胶囊（DNAshells®）中的小玻璃瓶内 | 首次展示了DNAshells®在常温下存储DNA的长期稳定性和保护性能，即使在极端条件下也能保持DNA的完整性 | 在76°C存储30小时后，需要调整过程以避免DNA损失 | 评估一种新的常温DNA存储方法的稳定性和保护性能 | 人体组织、细菌和植物的DNA样本 | 分子生物学 | NA | 聚合酶链反应、脉冲场凝胶电泳、扩增片段长度多态性分析 | NA | DNA | 多个来自人体组织、细菌和植物的DNA样本 |
| 13 | 2024-08-07 |
Label-free logic modules and two-layer cascade based on stem-loop probes containing a G-quadruplex domain
2014-Sep, Chemistry, an Asian journal
DOI:10.1002/asia.201402199
PMID:24909844
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研究论文 | 设计了一种基于脚跟介导的链置换和茎环探针的无标记DNA计算策略，构建了完整的逻辑门和双层逻辑级联 | 利用含有G四链体域的茎环探针，通过链置换实现逻辑门的构建，并使用G四链体/NMM复合物的荧光信号作为输出读出 | NA | 开发一种多目标诊断的通用计算系统 | 疾病特异性核苷酸序列 | 生物技术 | NA | 脚跟介导的链置换 | 逻辑门 | DNA序列 | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Diagnostic applications of nucleic acid circuits
2014-Jun-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/ar500059c
PMID:24828239
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研究论文 | 本文讨论了核酸电路在分析应用中的重要性，特别是其在诊断应用中的潜在用途 | 介绍了核酸电路的模块化特性，以及其在信号放大和分析模式转换中的应用 | NA | 探讨核酸电路在诊断应用中的潜力 | 核酸电路及其在诊断中的应用 | 分子编程 | NA | 核酸放大反应，如催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR） | 核酸电路 | 核酸 | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
The neural basis of human tool use
2014, Frontiers in psychology
IF:2.6Q2
DOI:10.3389/fpsyg.2014.00310
PMID:24782809
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综述 | 本文综述提出，人类自发多样化工具使用的神经基础是位于左前顶上小叶（aSMG）的一个区域，该区域负责执行和观察工具动作 | 提出aSMG可能是通过猴子AIP的复制和来自PPC的传入神经入侵而产生的，这一复制可能发生在Homo Habilis或Homo Erectus时期，从而产生了Oldowan或Acheulean工业复合体 | NA | 探讨人类工具使用的神经基础及其在进化中的起源 | 人类工具使用的神经机制 | 神经科学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
The value of DNA storage and pedigree analysis in rare diseases: a 17-year-old boy with X-linked lymphoproliferative disease (XLP) caused by a de novo SH2D1A mutation
2014-Dec, European journal of pediatrics
IF:3.0Q1
DOI:10.1007/s00431-014-2313-7
PMID:24723092
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病例报告 | 本文报告了一例因X连锁淋巴组织增生性疾病（XLP）导致的17岁男性患者致命的Epstein-Barr病毒感染，通过存储的患者DNA和家系分析确认了SH2D1A基因的新发突变。 | 强调了DNA存储、家系分析和多学科护理在罕见疾病患者及其家庭中的重要性。 | NA | 探讨DNA存储和家系分析在罕见疾病诊断中的应用价值。 | 一例X连锁淋巴组织增生性疾病患者及其家系。 | NA | X连锁淋巴组织增生性疾病 | DNA诊断 | NA | DNA | 单个病例 |
| 17 | 2024-08-07 |
Design and implementation of a microfluidic half adder chip based on double-stranded DNA
2014-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2014.2311792
PMID:24691162
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研究论文 | 本文设计并实现了一种基于双链DNA的微流控半加器芯片 | 该研究采用生物反应方法在微流控芯片上实现了半加器，结合生物芯片技术，使用玻璃和聚二甲基硅氧烷制作微型混合芯片，通过控制双链DNA的退火和变性来实现半加器的功能 | NA | 开发一种基于DNA计算的生物芯片，作为DNA分子计算机发展的关键领域 | 半加器作为各种算术单元的基本单元，其复杂结构直接影响计算机的整体结构复杂性 | 生物技术 | NA | DNA计算 | 微流控芯片 | DNA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Nucleocytoplasmic shuttling of a GATA transcription factor functions as a development timer
2014-Mar-21, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1249531
PMID:24653039
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研究论文 | 本文报道了在Dictyostelium discoideum中，GtaC转录因子通过核质穿梭响应cAMP波，调控细胞发育 | 首次揭示了GtaC转录因子通过核质穿梭响应cAMP波的机制，以及这种行为如何影响发育基因表达 | NA | 探究GtaC转录因子在Dictyostelium discoideum中的核质穿梭行为及其对细胞发育的调控作用 | GtaC转录因子及其在Dictyostelium discoideum中的功能 | NA | NA | 核质穿梭分析，磷酸化检测 | NA | 生物信号 | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Parallel molecular computation of modular-multiplication with two same inputs over finite field GF(2(n)) using self-assembly of DNA tiles
2014-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种利用DNA瓦片自组装模型在有限域GF(2(n))上进行并行模平方和模乘运算的方法 | 该系统通过同时执行平方和约简操作，比先前的分子计算系统在步骤上更少 | NA | 探索DNA计算在大型并行计算、海量数据存储和密码学中的应用 | 利用DNA瓦片自组装模型在有限域GF(2(n))上进行基本运算 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | DNA瓦片自组装模型 | DNA序列 | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Efficiency of a novel forensic room-temperature DNA storage medium
2014-Mar, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2013.11.009
PMID:24528585
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研究论文 | 本研究评估了一种新型法医室温DNA存储介质在长时间内保存混合人类DNA样本的能力 | 开发了一种基于脱水生物学原理的新技术，允许DNA在室温下存储 | 研究显示，经过两年室温老化后，观察到的等位基因数量和峰值高度有所下降 | 评估新型室温DNA存储技术在长时间内保存法医样本的能力 | 混合人类DNA样本 | NA | NA | Short Tandem Repeat (STR) genotyping | NA | DNA | 混合人类DNA样本，来自2或3人，浓度较低，存储时间为6个月至2年 |