生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 21 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-06 |
Protocols for dry DNA storage and shipment at room temperature
2013-Sep, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.12134
PMID:23789643
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研究论文 | 本研究评估了三种干态DNA稳定化系统在常温和56°C下的效果 | 提出了不同的干燥DNA存储和运输方案，为DNA长时间保存提供了新的思路 | 研究时间跨度长达4年，但在常温下存储的DNA质量尚需更多数据支持 | 制定成本效益高、有效的DNA提取物和PCR产品的运输及存储协议 | 对比不同的DNA存储方案对昆虫DNA的保护效果 | 数字病理学 | NA | PCR，选择性测序 | NA | DNA样本 | 96孔板的昆虫DNA样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-08-06 |
BioCode: two biologically compatible Algorithms for embedding data in non-coding and coding regions of DNA
2013-Apr-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-14-121
PMID:23570444
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研究论文 | 本论文提出了两种新颖的DNA数据嵌入算法BioCode，分别在非编码DNA和编码DNA中操作。 | 提出的算法遵循更严格的生物学限制，提高了信息嵌入的生物相容性和稳健性。 | 目前的方法只考虑了基本的生物学约束，未能充分考虑存在的进一步生物学限制。 | 研究旨在开发可以在DNA中嵌入非遗传信息的鲁棒算法。 | 研究对象为DNA数据嵌入算法，特别关注在活体生物基因组中的信息嵌入。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Towards 3D in silico modeling of the sea urchin embryonic development
2013-Sep-13, Journal of chemical biology
DOI:10.1007/s12154-013-0101-x
PMID:24386014
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研究论文 | 本文讨论了通过时间推移成像技术重建三维数字胚胎，以模拟海胆胚胎发育的方法 | 提出了一种新的方法，通过时间推移成像技术重建三维数字胚胎，以模拟生物系统的内在特性 | 目前的方法如“组学”方法提供的信息是静态的，时间分辨率低，并且通常是群体平均的，掩盖了细胞尺度上的快速或可变特征 | 探索整合分子、遗传和细胞动力学，以更好地理解胚胎发育的动态过程 | 海胆胚胎发育过程 | 数字病理学 | NA | 时间推移成像技术 | 三维数字模型 | 图像 | 特定海胆物种 | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
A reliable and effective method of DNA isolation from old human blood paper cards
2013, SpringerPlus
DOI:10.1186/2193-1801-2-616
PMID:24307984
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研究论文 | 本研究使用三种DNA溶解试剂（Tris-EDTA [TE]缓冲液、Tris-HCl缓冲液和水）和一个商业化试剂盒（DN131）从105张存放长达10年的人类血液纸卡中提取DNA，并评估其用于单核苷酸多态性（SNP，C125T）区域扩增的效果。 | 研究表明，使用Tris-HCl缓冲液提取的DNA在产量和质量上优于商业化试剂盒DN131，且在PCR和Taqman基因分型检测中的成功率更高。 | NA | 评估不同方法从旧的人类血液纸卡中提取DNA的效果，并确定最可靠和有效的方法。 | 从旧的人类血液纸卡中提取的DNA，用于单核苷酸多态性（SNP，C125T）区域的扩增和基因分型。 | NA | NA | PCR, Taqman基因分型 | NA | DNA | 105张人类血液纸卡 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Sensitive detection of microRNA in complex biological samples via enzymatic signal amplification using DNA polymerase coupled with nicking endonuclease
2013-Dec-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/ac403302a
PMID:24195675
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研究论文 | 本研究开发了一种新型一步法通过酶信号放大检测复杂生物样本中的微小RNA（miRNA） | 提出了一种集成“生物电路”的信号放大策略，利用中温DNA聚合酶的链置换特性和限制性内切酶的切割活性，实现miRNA序列的检测、放大和测量 | NA | 开发一种敏感且特异的miRNA检测方法，用于癌症诊断、预后和治疗 | 微小RNA（miRNA），特别是miR-141 | 生物技术 | 前列腺癌 | 酶信号放大 | NA | 生物样本 | 从1 fM到100 nM的动态范围 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
DNA computing: Molecules reach consensus
2013-Oct, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2013.202
PMID:24091452
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
A novel constraint for thermodynamically designing DNA sequences
2013, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0072180
PMID:24015217
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研究论文 | 本文提出了一种基于热力学性质的新约束条件，用于设计DNA序列 | 本文引入了一种基于热力学性质的新约束条件，与基于汉明距离的传统约束不同，该方法能够更好地评估DNA序列的热力学质量 | NA | 研究如何通过热力学性质优化DNA序列设计 | DNA序列设计 | 生物技术 | NA | 遗传算法 | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Two- and three-input TALE-based AND logic computation in embryonic stem cells
2013-Nov, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkt758
PMID:23982518
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研究论文 | 本文展示了转录激活子样效应物（TALEs）在哺乳动物细胞中执行布尔逻辑计算的能力，并利用分割内蛋白剪接策略实现了两输入和三输入的AND逻辑计算。 | 首次展示了TALEs在哺乳动物细胞中进行布尔逻辑计算的能力，并成功实现了两输入和三输入的AND逻辑计算。 | NA | 探索生物计算电路在控制细胞功能方面的应用潜力，特别是在组织工程和医疗治疗领域。 | 转录激活子样效应物（TALEs）在哺乳动物细胞中的逻辑计算能力。 | 生物技术 | NA | 分割内蛋白剪接策略 | NA | 基因组数据 | 小鼠胚胎干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
RNA nanotechnology for computer design and in vivo computation
2013-Oct-13, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2012.0310
PMID:24000362
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研究论文 | 本文探讨了利用RNA纳米技术进行计算机设计和体内计算的可能性 | RNA纳米技术作为一种新兴的分子尺度计算方法，具有大规模并行处理、低能耗和体内工作能力等优势 | RNA计算技术仍处于初级阶段，存在许多挑战，需要RNA纳米技术专家和计算机科学家的合作 | 探索RNA纳米技术在计算机设计和体内计算中的应用 | RNA纳米技术及其在分子尺度计算中的应用 | 计算机科学 | NA | RNA纳米技术 | NA | RNA序列 | 90核苷酸RNA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
QPSO-based adaptive DNA computing algorithm
2013, TheScientificWorldJournal
DOI:10.1155/2013/160687
PMID:23935409
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研究论文 | 本文提出了一种基于量子行为粒子群优化（QPSO）的自适应DNA计算算法，旨在提高DNA计算的收敛速度、适应性和有效性 | 该算法通过同时调整种群大小、交叉率、最大操作次数、酶和病毒变异率以及适应度函数，实现了DNA计算算法的自适应过程 | NA | 改进DNA计算算法的性能 | DNA计算算法及其参数 | 计算模型 | NA | DNA计算 | QPSO | 系统识别 | 两个不同系统的实验 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Immunity-based optimal estimation approach for a new real time group elevator dynamic control application for energy and time saving
2013, TheScientificWorldJournal
DOI:10.1155/2013/805343
PMID:23935433
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研究论文 | 本文研究了一种基于免疫系统的最优估计方法，用于实时动态控制群电梯系统，以实现时间和能源的节约 | 该方法通过遗传算法、免疫系统和DNA计算算法优化所有呼叫，结合模糊系统进行评估，具有动态和自适应特性 | NA | 开发高性能算法以提高群电梯系统的时间和能源效率 | 群电梯系统的动态控制 | NA | NA | 遗传算法、免疫系统、DNA计算算法 | 模糊系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
High-throughput and long-term observation of compartmentalized biochemical oscillators
2013-Sep-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c3cc44323j
PMID:23912586
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研究论文 | 本文报道了将振荡DNA电路分割成约700个皮升体积的液滴，并在恒温下培养，液滴显示出可持续一天以上的稳定振荡 | 发现了两种新现象：液滴间的慢速去同步化和运动空间波，并探讨了其可能的起源 | NA | 研究小体积效应对生物学的影响，并为分隔分子程序控制复杂动态的技术应用铺平道路 | 振荡DNA电路在分隔液滴中的行为 | 生物技术 | NA | NA | NA | 液滴 | 约700个液滴 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Nanobiotechnology: synthetic biology meets materials science
2013-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2013.06.003
PMID:23856593
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研究论文 | 本文综述了纳米技术在生命科学和医学中的应用，特别是在生物电路设计、生物生产系统、合成生物学、疾病诊断和治疗以及药物递送方面的影响。 | 文章探讨了纳米技术与生命科学的结合，为生物聚合物和生物机器在分子和纳米尺度上的控制提供了新的视角。 | NA | 旨在概述纳米技术在生命科学和医学中的应用及其对基础科学研究的推动作用。 | 研究对象包括生物聚合物、生物机器以及纳米尺度材料的合成与设计。 | 纳米技术 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Non-linear molecular pattern classification using molecular beacons with multiple targets
2013-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2013.05.008
PMID:23743339
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研究论文 | 本文设计了一种能够与多个目标相互作用的分子信标，并通过实验展示了其荧光信号形成复杂的径向基函数，从而作为体外非线性分子分类的构建模块。 | 本文提出了一种新的分子信标设计，能够进行非线性分类，这是对以往线性分类方法的创新。 | NA | 探索体外模式分类在DNA计算中的应用，特别是非线性分类的可行性。 | 分子信标与多个目标的相互作用及其在非线性分子分类中的应用。 | DNA计算 | NA | 分子信标 | 径向基函数 | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Solving the 0/1 knapsack problem by a biomolecular DNA computer
2013, Advances in bioinformatics
DOI:10.1155/2013/341419
PMID:23509451
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研究论文 | 本文使用基于贴纸的DNA计算方法解决0/1背包问题 | 利用DNA计算的并行处理能力，快速解决NP完全问题 | NA | 探索使用DNA计算机解决复杂数学问题的方法 | 0/1背包问题 | 生物信息学 | NA | 基于贴纸的DNA计算 | NA | DNA分子 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Biomedical implementation of liquid metal ink as drawable ECG electrode and skin circuit
2013, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0058771
PMID:23472220
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研究论文 | 本文首次描述了使用基于镓的液态金属墨水作为可绘制的电生理图（ECG）电极的方法 | 液态金属墨水具有独特的液相适应性和高电导性，为在皮肤表面制作电路提供了灵活的方式，并可能替代传统的刚性印刷电路板（PCBs） | NA | 探索液态金属墨水作为生物电极和电路材料的可行性和性能 | 液态金属墨水的电阻和极化电压特性，以及其在兔子和人体上作为ECG电极的性能 | 生物医学工程 | NA | 液态金属墨水 | NA | ECG信号 | 兔子和人体实验 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Enzyme-free unlabeled DNA logic circuits based on toehold-mediated strand displacement and split G-quadruplex enhanced fluorescence
2013-May-07, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.201205360
PMID:23447454
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研究论文 | 本文通过采用分裂G四链体增强的PPIX荧光和脚跟介导的链置换反应，建立了一系列无标记荧光逻辑门，并将其中一些逻辑门级联成电路 | 利用分裂G四链体增强的PPIX荧光和脚跟介导的链置换反应，实现了无酶无标记的DNA逻辑电路 | NA | 开发无酶无标记的DNA逻辑电路，实现对PPIX的控制释放 | DNA逻辑电路及其在DNA计算中的应用 | 生物技术 | NA | 脚跟介导的链置换反应 | NA | 荧光 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
A brain-to-brain interface for real-time sharing of sensorimotor information
2013, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep01319
PMID:23448946
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研究论文 | 本文介绍了一种脑-脑接口（BTBI），实现了两只老鼠大脑间行为上有意义的体感运动信息的实时传输。 | 首次展示了通过脑-脑接口在两只老鼠之间实时传输体感运动信息，并使解码鼠能够仅依靠编码鼠的大脑信息做出相似的行为选择。 | NA | 探索脑-脑接口在动物大脑间交换、处理和存储信息的能力，以及其在新型社会互动和生物计算设备研究中的应用。 | 编码鼠和解码鼠的大脑活动及其行为选择。 | 神经科学 | NA | 皮层内微刺激（ICMS） | NA | 大脑皮质活动 | 两只老鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Engineering a cell-surface aptamer circuit for targeted and amplified photodynamic cancer therapy
2013-Mar-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/nn305484p
PMID:23397942
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research paper | 本文介绍了一种基于适配体的DNA纳米电路设计策略，用于选择性识别癌细胞、可控激活光敏剂及放大光动力治疗效果 | 该研究首次设计了一种适配体基的DNA纳米电路，能够在细胞膜上选择性识别并激活光敏剂，实现治疗效果的放大 | NA | 开发一种新型的光动力癌症治疗方法，通过DNA纳米电路实现靶向和放大治疗效果 | 癌细胞和健康细胞的区分及光动力治疗效果的放大 | biotechnology | malignant diseases | NA | DNA nanocircuit | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Enzyme-free strip biosensor for amplified detection of Pb2+ based on a catalytic DNA circuit
2013-Feb-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c2cc37598b
PMID:23254321
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研究论文 | 本文构建了一种基于催化DNA电路的无酶条带生物传感器，用于放大检测Pb2+ | 该生物传感器无需酶且操作简单，能够实现对Pb2+的超灵敏可视化检测 | NA | 开发一种新型的无酶生物传感器，用于高灵敏度检测Pb2+ | Pb2+的检测 | 生物传感器 | NA | 催化DNA电路 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |