生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 11 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Groove binding mechanism of ionic liquids: a key factor in long-term stability of DNA in hydrated ionic liquids?
2012-Dec-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja304519d
PMID:23181803
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研究论文 | 本文通过分子动力学模拟和光谱实验研究了水合离子液体（ILs）中DNA的稳定机制 | 揭示了离子液体通过疏水和极性相互作用在DNA小沟中的结合机制，以及这种机制如何帮助稳定DNA | NA | 理解离子液体与DNA的结合特性和分子机制，以指导新型离子液体的发展，用于核酸溶质 | DNA在水合离子液体中的稳定性 | 生物技术 | NA | 分子动力学模拟，光谱实验 | NA | DNA | NA |
| 2 | 2024-08-07 |
Catalytic deoxyribozyme-modified nanoparticles for RNAi-independent gene regulation
2012-Oct-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/nn3034265
PMID:22966955
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研究论文 | 研究通过合成多价脱氧核酶“10-23”金纳米粒子（DzNP）偶联物，探讨了立体环境和金表面化学对催化作用的影响，并展示了其在细胞内对GDF15基因表达的调控能力 | 首次展示了脱氧核酶金纳米粒子在细胞内对基因表达的调控能力，并利用金表面的不对称敏感性调节催化活性 | NA | 研究脱氧核酶在细胞内的非毒性递送及其功能维持，以及其在基因调控中的应用 | 脱氧核酶“10-23”金纳米粒子偶联物及其在细胞内的催化活性和基因表达调控 | 生物技术 | 乳腺癌 | 金纳米粒子合成 | NA | DNA | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Highly-efficient gating of solid-state nanochannels by DNA supersandwich structure containing ATP aptamers: a nanofluidic IMPLICATION logic device
2012-Sep-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja3053333
PMID:22954022
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研究论文 | 本文展示了一种基于DNA超级三明治结构和ATP门控的纳米流体器件，具有高ON-OFF比率（高达10^6）和在关闭状态下达到吉欧姆级别的完美电密封 | 该器件的ON-OFF比率明显高于现有的化学修饰纳米流体门控系统，并且其吉欧姆密封性能可与离子通道电生理记录和某些脂质双层涂层的纳米孔传感器相媲美 | NA | 开发模拟生物离子通道门控功能的生物混合纳米系统，并提高人工系统的门控效率 | DNA超级三明治结构和ATP门控的纳米流体器件 | 纳米技术 | NA | 自组装DNA超级三明治结构 | NA | 电信号 | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
EGNAS: an exhaustive DNA sequence design algorithm
2012-Jun-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-13-138
PMID:22716030
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研究论文 | 本文介绍了一种全面的DNA序列设计算法EGNAS，该算法能够生成具有定义属性的序列集合，并控制序列间的相互作用和内部结构。 | EGNAS算法能够生成比以往软件更大规模的序列集合，并保持相同的约束条件。 | NA | 开发一种新的软件工具，用于设计独特的核酸序列。 | DNA序列的设计及其在分子识别、DNA纳米技术和DNA计算中的应用。 | DNA计算 | NA | DNA序列设计算法 | NA | DNA序列 | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Biomolecular computing systems: principles, progress and potential
2012-Jun-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3197
PMID:22688678
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综述 | 本文综述了生物分子计算系统的原理、进展和潜在应用 | 探讨了通过合理设计和工程化生物计算系统来增强研究和控制生物系统的能力 | NA | 介绍生物分子计算系统的关键概念并讨论最新进展 | 生物分子计算系统及其在组织工程、再生医学和医疗治疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
DNA extraction, preservation, and amplification
2012, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-61779-591-6_14
PMID:22684962
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研究论文 | 本文详细描述了样品准备、DNA分离、DNA储存、PCR扩增、PCR产物质量控制和PCR产物清理的标准协议和流程方案 | 介绍了硅胶膜方法在核酸分离中的应用，该方法易于操作、适用于高样本通量、成本相对较低，并能提供高质量、高数量和高纯度的DNA | NA | 探讨DNA条形码在生物多样性研究中的有效性，特别是DNA提取方法和PCR条件的优化 | DNA提取、保存和扩增的方法及其在生物多样性研究中的应用 | 生物技术 | NA | PCR | NA | DNA | 高样本通量 |
| 7 | 2024-08-07 |
Chromatin computation
2012, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0035703
PMID:22567109
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research paper | 本文定义了一种新的计算模型，其中染色质修饰作为信息单元，可以写入核小体的一维串中，类似于图灵机磁带上的符号，而染色质修饰复合体被建模为对有限相邻核小体进行操作的读写规则 | 提出了名为“染色质计算机”的新计算模型，证明其计算上具有通用性，比用于模拟转录因子调控基因表达的逻辑电路更强大 | NA | 探索染色质作为计算机的功能，并提出新的医学干预方法和生物计算机器的工程基础 | 染色质修饰及其在计算模型中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Synthetic in vitro transcription circuits
2012 Mar-Apr, Transcription
DOI:10.4161/trns.19734
PMID:22414749
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research paper | 本文通过使用RNA聚合酶和核糖核酸酶这两种酶，实现了体外简化版的转录调控电路 | 能够在体外模拟自然发生的生化网络，探索生物电路设计原理，并实现强大的计算模型 | NA | 探索生物电路设计原理及其实现 | 转录调控电路 | NA | NA | RNA聚合酶，核糖核酸酶 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
A molecular cryptosystem for images by DNA computing
2012-Mar-19, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201107156
PMID:22308004
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Abstractions for DNA circuit design
2012-Mar-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2011.0343
PMID:21775321
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计DNA链置换装置的编程语言，支持不同级别的分子细节分析 | 提出了一种新的编程语言，允许在不同细节级别上分析DNA链置换装置设计，无需修改程序 | 未提及 | 开发一种编程语言，用于设计能够维持精确反应动力学的DNA链置换装置 | DNA链置换装置的设计和分析 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Assessing a novel room temperature DNA storage medium for forensic biological samples
2012-Jan, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2011.01.008
PMID:21324769
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研究论文 | 评估一种新型室温DNA存储介质SampleMatrix™在法医生物样本中的稳定性和保护效果 | 介绍了一种新型室温DNA存储介质SampleMatrix™，能够在室温下稳定和保护DNA样本，无需冷冻存储 | NA | 评估SampleMatrix™在法医生物样本中的稳定性和保护效果 | 人类基因组DNA样本在不同条件下的存储效果 | NA | NA | 定量PCR，琼脂糖凝胶电泳，多重短串联重复序列（STR）分析 | NA | DNA | 不同量的DNA样本（0.0625-200 ng）在SampleMatrix™中存储1天至1年 |