生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 12 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Rational, modular adaptation of enzyme-free DNA circuits to multiple detection methods
2011-Sep-01, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkr504
PMID:21693555
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研究论文 | 本文设计并验证了一种基于催化发夹组装的简化DNA电路，可适配多种检测方法实现信号放大 | 通过优化发夹结构设计实现接近零背景的高效催化（k(cat) > 1 min⁻¹），并首次证明该电路可模块化应用于荧光、比色、电化学等多种检测平台 | 未明确说明在实际临床样本中的检测性能及与现有方法的对比验证 | 开发适用于即时诊断的酶免DNA信号放大电路 | RNA和小分子分析物 | 分子计算 | NA | 催化发夹组装 | DNA电路 | 分子信号数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 催化效率k(cat)>1 min⁻¹，模块化适配多检测平台 |
| 2 | 2025-10-05 |
Padlock probe-mediated qRT-PCR for DNA computing answer determination
2011-Jun, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-010-9227-8
PMID:21691417
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研究论文 | 开发基于Padlock探针的qRT-PCR方法用于DNA计算中旅行商问题最优解的序列定量检测 | 首次将Padlock探针介导的qRT-PCR技术应用于DNA计算领域，实现多组短DNA序列的同时高效定量 | 未明确说明该方法在更复杂计算问题中的扩展性及最大并行检测目标数 | 建立DNA计算中答案判定的高效定量检测方法 | 10聚体DNA序列 | DNA计算 | NA | Padlock探针,qRT-PCR,酶连接 | NA | DNA序列数据 | 三组目标序列的验证实验 | DNA | 序列特异性杂交 | DNA计算 | 线性检测范围0.2 pg-20 ng，扩增效率98.7%，支持多重检测 |
| 3 | 2024-08-07 |
Robust design of biological circuits: evolutionary systems biology approach
2011, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2011/304236
PMID:22187523
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研究论文 | 本研究提出了一种非线性随机系统模型，用于模拟宿主细胞中生物系统的内在参数波动和环境分子噪声，并通过进化系统生物学算法优化目标基因电路的设计参数，以实现对所需生物功能的稳健跟踪。 | 本研究采用进化系统生物学算法，使基因电路的设计参数能够进化到特定值，以稳健地跟踪所需的生物功能，即使在存在内在和环境噪声的情况下。 | NA | 构建更复杂的生物电路系统，提高生物电路设计的稳定性和确定性。 | 人工基因电路在微生物细胞中的功能实现，如开关、计时器、振荡器和布尔逻辑门。 | 合成生物学 | NA | 进化系统生物学算法 | 非线性随机系统 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Ultrasensitive DNA detection by cycle isothermal amplification based on nicking endonuclease and its application to logic gates
2011-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2011.09.019
PMID:22000757
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研究论文 | 本文设计了一系列基于切割内切酶（NEase）的循环等温扩增技术的三输入DNA逻辑门，显著提高了检测限 | 通过设计一个简单灵活的生物电路，实现了对特定DNA序列的检测和扩增，从而在输出信号中实现了指数级扩增 | NA | 开发基于指数扩增的DNA逻辑系统，以提高其灵敏度和简化逻辑操作 | DNA逻辑门及其在超灵敏DNA检测中的应用 | 生物技术 | NA | 循环等温扩增 | DNA逻辑门 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Neural network computation with DNA strand displacement cascades
2011-Jul-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature10262
PMID:21776082
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研究论文 | 本文展示了如何利用DNA计算和链置换电路构建分子系统，使其表现出类似大脑的自主行为 | 首次实现了将任意线性阈值电路（一种人工神经网络模型）系统地转化为DNA链置换级联，这些级联可以作为小型神经网络运行 | 目前仅实现了包含四个完全连接的人工神经元的Hopfield联想记忆模型 | 探索分子系统如何模拟大脑的认知功能，如模式识别、决策和环境响应 | DNA链置换级联及其在人工神经网络中的应用 | 生物技术 | NA | DNA计算，链置换电路 | 人工神经网络 | DNA序列 | 四个完全连接的人工神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Jun, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.38844717
PMID:21770097
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合，通过DNA实现信息的存储和基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据，展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的实际应用 | DNA信息存储和基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
An unenumerative DNA computing model for vertex coloring problem
2011-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2011.2160996
PMID:21742570
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研究论文 | 本文提出了一种新的非枚举DNA计算模型，用于解决图的顶点着色问题 | 通过排序顶点序列和减少颜色编码数量，有效减少了候选解的枚举，从而避免了解决方案空间的指数爆炸 | NA | 解决DNA计算中由于候选解枚举导致的解决方案空间指数爆炸问题 | 图的顶点着色问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | 非枚举DNA计算模型 | 图 | 12个顶点的图，初始解决方案空间包含283个DNA链 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
[DNA computing]
2011, Postepy biochemii
PMID:21735816
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算作为一种替代传统硅基计算机的可能性，并介绍了其在不同领域的应用前景 | 首次实现了使用DNA寡聚物和DNA连接酶解决哈密顿路径问题，并提出了基于限制酶FokI的分子两态有限自动机模型 | DNA计算的研究仍处于进展中，尚未实现大规模应用 | 探索DNA计算在计算机科学中的突破潜力 | DNA计算的模型和应用 | NA | 癌症 | DNA计算 | 分子两态有限自动机 | DNA寡聚物 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
A CLIQUE algorithm using DNA computing techniques based on closed-circle DNA sequences
2011-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2011.03.004
PMID:21511001
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研究论文 | 本文利用闭环DNA序列的DNA计算技术实现CLIQUE算法，用于二维数据的聚类 | 本文提出了一种新的DNA计算应用策略，将聚类过程转化为并行的生物化学反应，并利用闭环DNA序列表示标记单元 | 该策略目前仅适用于二维数据 | 探索DNA计算技术在图论和组合问题中的应用 | CLIQUE算法及二维数据的聚类 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 二维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
An improved colony PCR procedure for genetic screening of Chlorella and related microalgae
2011-Aug, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-011-0596-6
PMID:21431847
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的菌落PCR技术，用于绿藻Chlorella及相关微藻的基因筛选 | 使用Chelex-100作为优选的裂解缓冲液，不仅提高了DNA提取、PCR和DNA存储的效率，而且对细胞密度的变化不敏感 | NA | 建立适用于基因工程转化体筛选和天然微藻分离株生物勘探的改进PCR条件 | Chlorella及相关微藻的基因筛选 | NA | NA | PCR | NA | DNA | 涉及多种微藻菌株，包括Chlorella、Chlamydomonas reinhardtii、Dunaliella salina、Nannochloropsis sp.、Coccomyxa sp.和Thalassiosira pseudonana | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Mar, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.3422
PMID:21449321
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合，通过DNA存储信息并进行基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据，展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的潜力及其应用 | DNA计算中的信息存储与基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Evaluation of novel forensic DNA storage methodologies
2011-Nov, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2010.08.007
PMID:20837408
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研究论文 | 本研究评估了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术在法医学中的应用 | 开发了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术，如Gentegra产品 | 该技术似乎依赖于DNA提取方法，磁珠提取的DNA无法安全存储超过6个月 | 比较Gentegra产品与-20°C和Qiasafe存储的DNA数量和质量 | 法医学中DNA的安全存储 | 法医学 | NA | 脱水生物学技术 | NA | DNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |