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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Robust design of biological circuits: evolutionary systems biology approach
2011, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2011/304236
PMID:22187523
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研究论文 | 本研究提出了一种非线性随机系统模型,用于模拟宿主细胞中生物系统的内在参数波动和环境分子噪声,并通过进化系统生物学算法优化目标基因电路的设计参数,以实现对所需生物功能的稳健跟踪。 | 本研究采用进化系统生物学算法,使基因电路的设计参数能够进化到特定值,以稳健地跟踪所需的生物功能,即使在存在内在和环境噪声的情况下。 | NA | 构建更复杂的生物电路系统,提高生物电路设计的稳定性和确定性。 | 人工基因电路在微生物细胞中的功能实现,如开关、计时器、振荡器和布尔逻辑门。 | 合成生物学 | NA | 进化系统生物学算法 | 非线性随机系统 | 模拟数据 | NA |
2 | 2024-08-07 |
Ultrasensitive DNA detection by cycle isothermal amplification based on nicking endonuclease and its application to logic gates
2011-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2011.09.019
PMID:22000757
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研究论文 | 本文设计了一系列基于切割内切酶(NEase)的循环等温扩增技术的三输入DNA逻辑门,显著提高了检测限 | 通过设计一个简单灵活的生物电路,实现了对特定DNA序列的检测和扩增,从而在输出信号中实现了指数级扩增 | NA | 开发基于指数扩增的DNA逻辑系统,以提高其灵敏度和简化逻辑操作 | DNA逻辑门及其在超灵敏DNA检测中的应用 | 生物技术 | NA | 循环等温扩增 | DNA逻辑门 | DNA序列 | NA |
3 | 2024-08-07 |
Neural network computation with DNA strand displacement cascades
2011-Jul-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature10262
PMID:21776082
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研究论文 | 本文展示了如何利用DNA计算和链置换电路构建分子系统,使其表现出类似大脑的自主行为 | 首次实现了将任意线性阈值电路(一种人工神经网络模型)系统地转化为DNA链置换级联,这些级联可以作为小型神经网络运行 | 目前仅实现了包含四个完全连接的人工神经元的Hopfield联想记忆模型 | 探索分子系统如何模拟大脑的认知功能,如模式识别、决策和环境响应 | DNA链置换级联及其在人工神经网络中的应用 | 生物技术 | NA | DNA计算,链置换电路 | 人工神经网络 | DNA序列 | 四个完全连接的人工神经元 |
4 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Jun, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.38844717
PMID:21770097
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合,通过DNA实现信息的存储和基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据,展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的实际应用 | DNA信息存储和基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 |
5 | 2024-08-07 |
An unenumerative DNA computing model for vertex coloring problem
2011-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2011.2160996
PMID:21742570
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研究论文 | 本文提出了一种新的非枚举DNA计算模型,用于解决图的顶点着色问题 | 通过排序顶点序列和减少颜色编码数量,有效减少了候选解的枚举,从而避免了解决方案空间的指数爆炸 | NA | 解决DNA计算中由于候选解枚举导致的解决方案空间指数爆炸问题 | 图的顶点着色问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | 非枚举DNA计算模型 | 图 | 12个顶点的图,初始解决方案空间包含283个DNA链 |
6 | 2024-08-07 |
[DNA computing]
2011, Postepy biochemii
PMID:21735816
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算作为一种替代传统硅基计算机的可能性,并介绍了其在不同领域的应用前景 | 首次实现了使用DNA寡聚物和DNA连接酶解决哈密顿路径问题,并提出了基于限制酶FokI的分子两态有限自动机模型 | DNA计算的研究仍处于进展中,尚未实现大规模应用 | 探索DNA计算在计算机科学中的突破潜力 | DNA计算的模型和应用 | NA | 癌症 | DNA计算 | 分子两态有限自动机 | DNA寡聚物 | NA |
7 | 2024-08-07 |
Rational, modular adaptation of enzyme-free DNA circuits to multiple detection methods
2011-Sep-01, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkr504
PMID:21693555
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于催化发夹组装机制的简化DNA电路,并将其应用于多种不同的分析格式 | 通过优化先前基于发夹的催化组装设计,实现了几乎零背景和高催化效率,并展示了电路的固有模块性,可轻松适应检测RNA和小分子分析物 | NA | 探索酶免信号放大在低成本即时诊断中的应用 | 酶免DNA电路的效率和模块性是否适用于多种分析应用 | 分子检测 | NA | 催化发夹组装 | NA | DNA电路 | NA |
8 | 2024-08-07 |
Padlock probe-mediated qRT-PCR for DNA computing answer determination
2011-Jun, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-010-9227-8
PMID:21691417
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研究论文 | 本文介绍了基于Padlock探针的qRT-PCR技术在DNA计算中用于确定旅行商问题最优解的方法 | 首次将Padlock探针介导的qRT-PCR技术应用于DNA计算中,实现了对短序列DNA的高效定量 | NA | 开发一种高灵敏度和高效的qRT-PCR方法,用于同时定量多个短核酸序列 | Padlock探针介导的qRT-PCR技术在DNA计算中的应用 | 生物技术 | NA | qRT-PCR | NA | DNA序列 | NA |
9 | 2024-08-07 |
A CLIQUE algorithm using DNA computing techniques based on closed-circle DNA sequences
2011-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2011.03.004
PMID:21511001
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研究论文 | 本文利用闭环DNA序列的DNA计算技术实现CLIQUE算法,用于二维数据的聚类 | 本文提出了一种新的DNA计算应用策略,将聚类过程转化为并行的生物化学反应,并利用闭环DNA序列表示标记单元 | 该策略目前仅适用于二维数据 | 探索DNA计算技术在图论和组合问题中的应用 | CLIQUE算法及二维数据的聚类 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 二维数据 | NA |
10 | 2024-08-07 |
An improved colony PCR procedure for genetic screening of Chlorella and related microalgae
2011-Aug, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-011-0596-6
PMID:21431847
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的菌落PCR技术,用于绿藻Chlorella及相关微藻的基因筛选 | 使用Chelex-100作为优选的裂解缓冲液,不仅提高了DNA提取、PCR和DNA存储的效率,而且对细胞密度的变化不敏感 | NA | 建立适用于基因工程转化体筛选和天然微藻分离株生物勘探的改进PCR条件 | Chlorella及相关微藻的基因筛选 | NA | NA | PCR | NA | DNA | 涉及多种微藻菌株,包括Chlorella、Chlamydomonas reinhardtii、Dunaliella salina、Nannochloropsis sp.、Coccomyxa sp.和Thalassiosira pseudonana |
11 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Mar, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.3422
PMID:21449321
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合,通过DNA存储信息并进行基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据,展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的潜力及其应用 | DNA计算中的信息存储与基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 |
12 | 2024-08-07 |
Evaluation of novel forensic DNA storage methodologies
2011-Nov, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2010.08.007
PMID:20837408
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研究论文 | 本研究评估了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术在法医学中的应用 | 开发了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术,如Gentegra产品 | 该技术似乎依赖于DNA提取方法,磁珠提取的DNA无法安全存储超过6个月 | 比较Gentegra产品与-20°C和Qiasafe存储的DNA数量和质量 | 法医学中DNA的安全存储 | 法医学 | NA | 脱水生物学技术 | NA | DNA | 未具体说明样本数量 |