生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 16 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Kinetics of DNA and RNA Hybridization in Serum and Serum-SDS
2010-Sep-01, IEEE transactions on nanotechnology
IF:2.1Q3
DOI:10.1109/TNANO.2010.2053380
PMID:20967137
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA的交叉催化网络，用于放大血清中与癌症相关的特定miRNA | 利用DNA计算技术构建核酸化学网络，无需PCR即可实现miRNA的扩增检测 | 目前仅报告了初步进展，DNA网络的子组件测试和初步模拟结果 | 开发基于DNA纳米技术的癌症早期检测方法 | 血清中的microRNA（miRNA）生物标志物 | DNA计算 | 癌症 | DNA纳米技术，DNA计算，核酸杂交 | DNA-based cross-catalytic network | 生物分子数据 | NA | DNA, RNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 能够检测血液中低丰度的miRNA分子 |
| 2 | 2025-10-05 |
Robustness from flexibility in the fungal circadian clock
2010-Jun-24, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-88
PMID:20576110
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研究论文 | 通过数学模型研究真菌生物钟电路中灵活性与鲁棒性的关系 | 揭示了生物钟电路中互锁反馈环结构通过增加灵活性来提升鲁棒性的新机制 | 研究基于数学模型和真菌Neurospora crassa，在其他生物系统中的普适性需要验证 | 探索生物电路中灵活性与鲁棒性的相互关系 | 真菌Neurospora crassa的生物钟电路及其分生孢子形成调控 | 系统生物学 | NA | 数学建模、计算机模拟、敏感性分析 | 转录翻译反馈模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Optimizing Storage and Handling of DNA Extracts
2010-Jul, Forensic science review
PMID:26242592
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综述 | 本文综述了核酸样本存储在法医学、流行病学、临床和遗传实验室中的重要性，并探讨了优化DNA提取物存储和处理的方法 | NA | NA | 探讨和优化DNA提取物的存储和放大方法，以确保从各种类型的样本中成功恢复基因型 | DNA/RNA样本的存储和处理方法 | 法医学 | NA | PCR | NA | DNA/RNA | 数百万生物样本，包括细胞、病毒和DNA/RNA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
An evolution based biosensor receptor DNA sequence generation algorithm
2010, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s100100330
PMID:22315543
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研究论文 | 本研究探讨了作为生物受体的DNA特性，并提出了一种基于DNA计算的混合进化DNA序列生成算法，用于识别适合与真实目标物质稳定杂交的DNA生物受体识别分子 | 本研究提出了一种基于DNA计算的混合进化DNA序列生成算法，并应用旅行商问题（TSP）方法评估生成DNA序列的安全性和适应性，提高了DNA序列生成的效率和稳定性 | NA | 旨在进一步开发DNA生物传感器，识别适合真实目标分析物样本的识别分子 | DNA生物受体及其与真实目标物质的杂交稳定性 | 生物传感器 | NA | DNA计算 | 混合进化算法 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Companies hope to bring DNA storage in from the cold
2010-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm1010-1056b
PMID:20930728
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
DNA word set design based on minimum free energy
2010-Dec, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2010.2069570
PMID:20840907
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研究论文 | 本文开发了一种基于最小自由能（MFE）标准的算法，用于设计DNA短词集 | 该算法直接生成实际的DNA词集，不同于其他学术和统计数字，能够减少错误杂交反应的出现，提高DNA计算的可靠性和规模 | NA | 开发一种新的算法，用于设计基于最小自由能的DNA短词集 | DNA短词集的设计 | 生物分子计算 | NA | 最小自由能（MFE） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Mathematical modeling: bridging the gap between concept and realization in synthetic biology
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/541609
PMID:20589069
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review | 本文综述了数学建模在合成生物学中的重要性和方法，包括模型假设、建模框架类型（确定性和随机性）以及参数估计和优化的重要性 | NA | NA | 探讨数学建模在合成生物学中连接概念与实现的作用 | 合成生物学中的数学建模概念、方法及其应用 | synthetic biology | NA | 数学建模 | 确定性模型和随机性模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Applying DNA computation to intractable problems in social network analysis
2010-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2010.05.006
PMID:20566337
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研究论文 | 本文提出基于DNA计算的方法来解决社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 利用DNA计算的高信息密度和大规模并行性来解决传统计算机架构难以处理的NP完全问题 | NA | 探索DNA计算在社交网络分析中的应用，以解决复杂的社会网络问题 | 社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 社交网络数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
DNA computing circuits using libraries of DNAzyme subunits
2010-Jun, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2010.88
PMID:20512129
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研究论文 | 本文报道了一种基于催化核酸（DNAzymes）库的DNA计算平台，用于动态组装通用逻辑门和半加器/半减法器系统 | 首次展示了多层门级联、扇出门和并行逻辑门操作，并能根据输入标记调控反义分子或适配体的表达，作为酶的抑制剂 | NA | 开发适用于生物工程和纳米医学的生物计算系统 | DNA计算电路及其模块化耦合和可扩展性 | 生物工程 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Networks and circuits in cell regulation
2010-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2010.05.015
PMID:20457126
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研究论文 | 本文研究了酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路，通过广泛的数值模拟分析探讨了网络表示和相应的数学模型 | 提出了一种结合组件连接和功能任务的建模策略，以更好地理解细胞功能的动态过程 | 研究仅限于酵母细胞周期的G1到S阶段，可能不适用于其他生物过程 | 探索细胞调控中的网络和电路模型，以实现对复杂细胞功能动态的更真实描述 | 酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路 | NA | NA | 数值模拟分析 | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Free energy estimation of short DNA duplex hybridizations
2010-Feb-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-11-105
PMID:20181279
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研究论文 | 本文比较了四种已发表的DNA/DNA双链自由能计算方法与基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，并提出了一种改进模型 | 提出了基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，该模型在标准和非标准实验条件下都能准确估计完美匹配双链的自由能 | 文章未明确提及具体的局限性 | 比较不同DNA双链自由能计算方法的相似性与差异，并提出改进模型 | 695对短寡核苷酸序列 | 生物信息学 | NA | 最近邻模型 | 最近邻模型 | 序列 | 695对短寡核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Nanoinformatics and DNA-based computing: catalyzing nanomedicine
2010-May, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1203/PDR.0b013e3181d6245e
PMID:20118825
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综述 | 本文综述了纳米信息学和基于DNA的计算在纳米医学和再生医学中的应用，分析了其科学基础、当前研究和项目、预期应用及可能出现的问题 | 纳米信息学和基于DNA的计算为纳米医学和再生医学提供了新的催化剂，可能彻底改变生物医学中的信息建模和处理方式 | 纳米医学在成本效益研究、临床试验、毒性测试、药物递送方法和新个性化疗法的实施方面仍面临挑战 | 探讨纳米信息学和基于DNA的计算如何促进纳米医学的发展，并分析其潜在的应用和问题 | 纳米信息学和基于DNA的计算在纳米医学和再生医学中的应用 | 纳米医学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Algorithm for thermodynamically based prediction of DNA/DNA cross-hybridisation
2010, International journal of bioinformatics research and applications
DOI:10.1504/IJBRA.2010.031294
PMID:20110211
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研究论文 | 本文介绍了一种基于热力学模型的算法HYBGRAPH，用于预测DNA/DNA交叉杂交的二级结构 | 开发了一种新的算法HYBGRAPH，用于预测DNA/DNA交叉杂交复合物的二级结构 | NA | 设计DNA链以优化生物应用中的杂交能量 | DNA/DNA交叉杂交的二级结构 | 生物信息学 | NA | 热力学模型 | 动态规划 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Forecast calls for clouds over biological computing
2010-Jan, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm0110-6a
PMID:20057394
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Green technologies for room temperature nucleic acid storage
2010, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
PMID:19801719
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研究论文 | 本研究评估了两种新型技术在室温下存储DNA的完整性和质量，并与-20°C冷冻存储进行了比较 | 介绍了两种新型核酸稳定技术，能够在室温下以成本效益高、环境友好的方式存储DNA和RNA | NA | 评估新型核酸稳定技术在室温下存储DNA和RNA的效果 | DNA和RNA的存储完整性和质量 | NA | NA | PCR, DNA测序, SNP微阵列, 定量逆转录PCR | NA | 核酸 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
CANADA: designing nucleic acid sequences for nanobiotechnology applications
2010-Feb, Journal of computational chemistry
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jcc.21353
PMID:19530109
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研究论文 | 本文介绍了CANADA软件包，用于设计满足特定和高效杂交要求的核酸序列，适用于DNA计算和基于DNA的纳米技术应用 | CANADA软件包提供了设计、分析和处理核酸序列的工具，这些工具对于DNA计算和纳米技术应用至关重要 | NA | 开发用于设计核酸序列的软件工具，以支持DNA计算和纳米技术应用 | 核酸序列的设计和优化 | NA | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |