生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 9 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
SELF-RECOGNITION OF DNA FROM LIFE PROCESSES TO DNA COMPUTATION
2007-Apr, Biophysical reviews and letters
DOI:10.1142/S1793048007000490
PMID:20640192
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研究论文 | 探讨DNA结构如何编码生命过程及其在自下而上纳米技术和DNA计算中的应用 | 利用DNA的自识别和自组装特性开发纳米技术，并基于DNA链的大规模并行性和沃森-克里克互补性实现计算技术微型化 | NA | 研究DNA结构对生命过程的编码机制及其在纳米技术和计算领域的应用潜力 | DNA分子及其核苷酸组成（腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤） | DNA计算 | NA | DNA纳米技术 | NA | 分子结构数据 | NA | DNA | 沃森-克里克互补性编码 | DNA计算 | 利用DNA链的大规模并行性实现高性能计算 |
| 2 | 2025-10-05 |
DNA Media Storage
2007-Sep, International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications : [proceedings]. International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications
PMID:20622994
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研究论文 | 提出一种使用DNA作为文件存储介质的新方法，通过多序列比对和智能启发式算法实现低错误率的内容恢复 | 将DNA应用于数据存储领域，结合多序列比对和智能启发式算法来确定最可能的文件内容 | 发现时间限制、资源需求高和序列不匹配等问题尚未完全解决 | 探索DNA作为数据存储介质的可行性 | DNA存储技术 | DNA计算 | NA | 多序列比对、智能启发式算法 | NA | 文件数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 最小化错误率 |
| 3 | 2024-08-07 |
Enzymatic ligation assisted by nucleases: simultaneous ligation and digestion promote the ordered assembly of DNA
2007, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2007.325
PMID:17853876
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研究论文 | 本文介绍了一种酶联辅助核酸酶技术（ELAN），用于在单管中大规模制备特定DNA分子的有序组装 | ELAN方法通过明智选择限制酶位点并结合同时进行的消化和连接反应，将非目标产物转化为底物，从而产生单一产物 | NA | 开发一种高效的方法用于DNA分子的有序组装 | DNA分子的有序组装 | 分子克隆 | NA | 酶联辅助核酸酶技术（ELAN） | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Physarum machines: encapsulating reaction-diffusion to compute spanning tree
2007-Dec, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-007-0276-5
PMID:17603779
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研究论文 | 本文介绍了一种使用Physarum polycephalum的plasmodium作为计算基质的生物计算设备——Physarum机器，并展示了其在构建生成树方面的应用 | 本文通过在反应扩散系统中封装具有少数‘生长点’的膜，解决了反应扩散计算机无法独立构建某些邻近图的问题 | NA | 探索和验证Physarum机器在计算生成树方面的可行性 | Physarum polycephalum的plasmodium和反应扩散系统 | 生物计算 | NA | 反应扩散计算 | NA | 生物模式 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Modeling molecular computing systems by an artificial chemistry - its expressive power and application
2007, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl.2007.13.3.223
PMID:17567243
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研究论文 | 本文探讨了使用人工化学模型来模拟分子计算系统的可能性，并展示了其在分子计算建模中的应用 | 提出了一种基于字符串模式匹配和重组的人工化学模型，并证明了其在计算上的通用性 | NA | 探索人工化学在模拟分子计算系统中的应用 | 分子计算系统 | NA | NA | 人工化学 | 人工化学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Directed assembly of DNA molecules via simultaneous ligation and digestion
2007-Jan, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/000112283
PMID:17269489
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research paper | 本文介绍了一种通过同时连接和消化DNA分子的定向组装技术 | 提出了一种名为ELAN的新策略，通过酶辅助核酸酶将非目标连接产物转化为底物，显著提高了目标产物的产量 | NA | 开发一种高产量的DNA连接技术，以支持从标准分子克隆到生物物理学和DNA计算等多种下游应用 | DNA分子的定向组装 | NA | NA | ELAN (enzymatic ligation assisted by nucleases) | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Differential dependence on DNA ligase of type II restriction enzymes: a practical way toward ligase-free DNA automaton
2007-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.082
PMID:17196173
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research paper | 本文研究了不同类型的II型限制酶对DNA连接酶的依赖性，并探讨了无连接酶DNA自动机的实际应用 | 发现使用FokI等IIS型限制酶作为硬件时，DNA计算效率可能与DNA连接酶无关 | NA | 探讨无连接酶DNA自动机的可行性及其在基因组网络规模中处理基因关系的潜力 | 比较FokI与HgaI、BsmFI、BbsI和BseMII五种酶在自动机反应中对T4 DNA连接酶的依赖性差异 | 生物计算 | NA | DNA计算 | DNA自动机 | DNA分子 | 涉及五种不同的酶 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Solving satisfiability problems using a novel microarray-based DNA computer
2007 Jul-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.08.009
PMID:17029765
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进的贴纸模型和先进MEMS微阵列技术的算法，用于解决SAT问题 | 该方法通过分步构建解决方案，每一步满足一个子句，最终解决整个布尔公式，无需耗时的样本准备程序和精细的样本应用设备 | NA | 解决SAT问题 | DNA计算机算法 | 生物计算 | NA | MEMS微阵列技术 | 贴纸模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
DNA computing of solutions to knapsack problems
2007-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.06.001
PMID:16860927
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研究论文 | 本文研究了使用DNA计算解决背包问题的方法，通过分子生物技术在巨大的分子库中进行并行搜索 | 本文展示了如何通过体内翻译DNA库为蛋白质来扩展计算，结合DNA和蛋白质实现多准则优化 | NA | 研究使用DNA计算解决优化问题的方法 | 背包问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |