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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-06 |
DNA Media Storage
2007-Sep, International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications : [proceedings]. International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications
PMID:20622994
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研究论文 | 本研究提出了一种将DNA用作文件存储的新方法 | 该文章创新性地结合多序列比对和智能启发式方法来确定最有可能的文件内容 | 由于发现时间、资源需求和序列不匹配的限制,DNA计算尚未普遍接受 | 研究DNA作为文件存储的可行性 | DNA存储文件的潜在应用 | 计算机视觉 | NA | 多序列比对 | 智能启发式 | 文件内容 | NA |
2 | 2024-08-07 |
SELF-RECOGNITION OF DNA FROM LIFE PROCESSES TO DNA COMPUTATION
2007-Apr, Biophysical reviews and letters
DOI:10.1142/S1793048007000490
PMID:20640192
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研究论文 | 本文探讨了DNA结构如何编码生命过程,并利用其微小尺寸、自我识别和自组装机制进行自下而上的纳米技术 | 利用DNA的并行性和沃森-克里克互补性进行DNA计算,以实现现有计算技术的小型化 | NA | 研究DNA结构如何编码生命过程,并探索其在纳米技术中的应用 | DNA的结构及其在生命过程和纳米技术中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Enzymatic ligation assisted by nucleases: simultaneous ligation and digestion promote the ordered assembly of DNA
2007, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2007.325
PMID:17853876
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研究论文 | 本文介绍了一种酶联辅助核酸酶技术(ELAN),用于在单管中大规模制备特定DNA分子的有序组装 | ELAN方法通过明智选择限制酶位点并结合同时进行的消化和连接反应,将非目标产物转化为底物,从而产生单一产物 | NA | 开发一种高效的方法用于DNA分子的有序组装 | DNA分子的有序组装 | 分子克隆 | NA | 酶联辅助核酸酶技术(ELAN) | NA | DNA | 四个DNA片段,八种限制酶 |
4 | 2024-08-07 |
Physarum machines: encapsulating reaction-diffusion to compute spanning tree
2007-Dec, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-007-0276-5
PMID:17603779
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研究论文 | 本文介绍了一种使用Physarum polycephalum的plasmodium作为计算基质的生物计算设备——Physarum机器,并展示了其在构建生成树方面的应用 | 本文通过在反应扩散系统中封装具有少数‘生长点’的膜,解决了反应扩散计算机无法独立构建某些邻近图的问题 | NA | 探索和验证Physarum机器在计算生成树方面的可行性 | Physarum polycephalum的plasmodium和反应扩散系统 | 生物计算 | NA | 反应扩散计算 | NA | 生物模式 | NA |
5 | 2024-08-07 |
Modeling molecular computing systems by an artificial chemistry - its expressive power and application
2007, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl.2007.13.3.223
PMID:17567243
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研究论文 | 本文探讨了使用人工化学模型来模拟分子计算系统的可能性,并展示了其在分子计算建模中的应用 | 提出了一种基于字符串模式匹配和重组的人工化学模型,并证明了其在计算上的通用性 | NA | 探索人工化学在模拟分子计算系统中的应用 | 分子计算系统 | NA | NA | 人工化学 | 人工化学模型 | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Directed assembly of DNA molecules via simultaneous ligation and digestion
2007-Jan, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/000112283
PMID:17269489
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research paper | 本文介绍了一种通过同时连接和消化DNA分子的定向组装技术 | 提出了一种名为ELAN的新策略,通过酶辅助核酸酶将非目标连接产物转化为底物,显著提高了目标产物的产量 | NA | 开发一种高产量的DNA连接技术,以支持从标准分子克隆到生物物理学和DNA计算等多种下游应用 | DNA分子的定向组装 | NA | NA | ELAN (enzymatic ligation assisted by nucleases) | NA | DNA | 四个DNA片段,八种限制酶 |
7 | 2024-08-07 |
Differential dependence on DNA ligase of type II restriction enzymes: a practical way toward ligase-free DNA automaton
2007-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.082
PMID:17196173
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research paper | 本文研究了不同类型的II型限制酶对DNA连接酶的依赖性,并探讨了无连接酶DNA自动机的实际应用 | 发现使用FokI等IIS型限制酶作为硬件时,DNA计算效率可能与DNA连接酶无关 | NA | 探讨无连接酶DNA自动机的可行性及其在基因组网络规模中处理基因关系的潜力 | 比较FokI与HgaI、BsmFI、BbsI和BseMII五种酶在自动机反应中对T4 DNA连接酶的依赖性差异 | 生物计算 | NA | DNA计算 | DNA自动机 | DNA分子 | 涉及五种不同的酶 |
8 | 2024-08-07 |
Solving satisfiability problems using a novel microarray-based DNA computer
2007 Jul-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.08.009
PMID:17029765
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进的贴纸模型和先进MEMS微阵列技术的算法,用于解决SAT问题 | 该方法通过分步构建解决方案,每一步满足一个子句,最终解决整个布尔公式,无需耗时的样本准备程序和精细的样本应用设备 | NA | 解决SAT问题 | DNA计算机算法 | 生物计算 | NA | MEMS微阵列技术 | 贴纸模型 | DNA序列 | NA |
9 | 2024-08-07 |
DNA computing of solutions to knapsack problems
2007-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.06.001
PMID:16860927
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研究论文 | 本文研究了使用DNA计算解决背包问题的方法,通过分子生物技术在巨大的分子库中进行并行搜索 | 本文展示了如何通过体内翻译DNA库为蛋白质来扩展计算,结合DNA和蛋白质实现多准则优化 | NA | 研究使用DNA计算解决优化问题的方法 | 背包问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |