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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Biological computing with diffusion and excitable calcium stores
2004-Jun, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2004.1.147
PMID:20369965
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研究论文 | 研究细胞内信号传递中通过扩散和兴奋性钙储存的几何配置生成完整逻辑门的能力,以及如何利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建生物信号的符合检测器 | 探讨了不同几何配置的兴奋性钙储存生成逻辑门的能力,并描述了利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建符合检测器的方法 | NA | 研究细胞内信号传递中的计算能力 | 细胞内兴奋性钙储存的几何配置及钙诱导的钙释放机制 | 生物计算 | NA | 兴奋性钙诱导的钙释放 | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Collaborative design for automated DNA storage that allows for rapid, accurate, large-scale studies
2004-Dec, Assay and drug development technologies
IF:1.6Q3
DOI:10.1089/adt.2004.2.683
PMID:15674026
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研究论文 | 本文介绍了Genomics Collaborative公司如何自动化其DNA处理、存储和检索的方法 | 本文首次展示了商业实体如何通过其大型全球样本库在工业规模上支持遗传研究 | NA | 支持药物发现的持续需求,制定样本存储和收集的战略方向 | DNA样本的自动化处理、存储和检索 | 基因组学 | NA | 自动化DNA处理 | NA | DNA样本 | 大型全球样本库中的大量人类样本 |
3 | 2024-08-07 |
Solving traveling salesman problems with DNA molecules encoding numerical values
2004-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2004.06.005
PMID:15555757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA热力学性质的DNA编码方法和偏向分子算法,用于解决旅行商问题 | 该方法利用DNA的热力学性质进行有效的局部搜索,扩展了DNA计算在解决数值优化问题上的能力 | NA | 探索DNA计算在解决数值优化问题上的应用 | 旅行商问题 | 生物信息学 | NA | 温度梯度聚合酶链反应和温度梯度凝胶电泳 | NA | DNA | NA |
4 | 2024-08-07 |
A new DNA computing model for the NAND gate based on induced hairpin formation
2004-Nov, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2004.04.005
PMID:15527948
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研究论文 | 本文提出了一种基于诱导发夹形成的DNA计算模型,用于实现NAND逻辑门 | 利用序列特异性结合的小分子配体诱导发夹形成,提供了控制发夹形成的灵活性,并保持了高度的特异性杂交敏感性 | NA | 开发一种新的DNA计算模型,用于实现逻辑NAND门 | DNA分子的发夹结构及其在逻辑门中的应用 | 生物技术 | NA | 诱导发夹形成 | 理论模型 | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
Strong coupling of nonlinear electronic and biological oscillators: reaching the "amplitude death" regime
2004-Oct-08, Physical review letters
IF:8.1Q1
DOI:10.1103/PhysRevLett.93.158102
PMID:15524944
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研究论文 | 研究了电子和生物电路之间的相互作用,使用自发振荡的橄榄核神经元作为单细胞生物元素,通过改变振荡器之间的耦合强度,观察到一系列由模型计算预测的行为,包括可逆的低能量耗散“幅度死亡”状态。 | 首次实现了非线性电子和生物振荡器之间的强耦合,并观察到“幅度死亡”状态。 | 仅限于单细胞生物元素的实验,未涉及更复杂的生物系统。 | 探索电子和生物振荡器之间的相互作用及其对系统行为的影响。 | 电子振荡器和自发振荡的橄榄核神经元。 | NA | NA | NA | NA | NA | 一对振荡器 |
6 | 2024-08-07 |
DNA computing using single-molecule hybridization detection
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh817
PMID:15388798
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研究论文 | 本文探讨了使用单分子杂交检测技术进行DNA计算的方法 | 结合DNA计算与单分子检测,实现了计算的小型化并显著减少了所需的DNA量 | 目前实现的并行度远低于使用的DNA分子数量 | 旨在利用核酸进行计算,解决需要大量搜索空间的优化问题 | DNA计算的并行性和单分子检测技术 | NA | NA | 荧光交叉相关光谱学 | NA | DNA分子 | 使用了单个DNA分子进行检测 |
7 | 2024-08-07 |
DNA display I. Sequence-encoded routing of DNA populations
2004-Jul, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.0020173
PMID:15221027
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研究论文 | 本文介绍了一种用于DNA路由基因的模块化设计,以及由寡核苷酸和商业化色谱树脂制成的路由机械,用于将纳摩尔量的DNA基于序列分配到物理上不同的子池中。 | 提出了一种新的模块化设计方法和路由机械,用于DNA序列编码的路由,提高了DNA编程化学合成的效率。 | 文章未明确提及具体的局限性。 | 旨在开发实用的实验工具,以实现DNA导向的有机合成和DNA计算中的DNA路由技术。 | 研究对象包括DNA路由基因的设计和路由机械的构建。 | 生物技术 | NA | DNA路由技术 | NA | DNA序列 | 纳摩尔量的DNA |
8 | 2024-08-07 |
Demonstration of a universal surface DNA computer
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh635
PMID:15181177
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研究论文 | 本文展示了能够模拟布尔逻辑电路的表面DNA计算机 | 首次展示了表面DNA计算机能够模拟布尔逻辑电路,并通过DNA操作实现了NOR和OR门的构建 | NA | 验证表面DNA计算机模拟布尔逻辑电路的能力 | 表面DNA计算机及其在布尔逻辑电路中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 表面DNA计算机 | DNA | NA |
9 | 2024-08-07 |
Microarray-based in vitro evaluation of DNA oligomer libraries designed in silico
2004-Mar-19, Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/cphc.200300978
PMID:15067873
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研究论文 | 本文报道了基于微阵列的体外评估,针对在计算机设计用于超分子自组装应用的两个DNA寡核苷酸序列库 | 首次将理论预测的序列基序特性与实际性能进行比较,并展示了微阵列方法在快速评估其他DNA序列库中的应用潜力 | NA | 比较理论预测的序列基序特性与实际性能 | 两个DNA寡核苷酸序列库 | 生物技术 | NA | 微阵列技术 | NA | DNA序列 | 两个DNA寡核苷酸序列库 |
10 | 2024-08-07 |
Animal-free production of ccc-supercoiled plasmids for research and clinical applications
2004-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.511
PMID:14978750
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研究论文 | 本文开发了一种大规模制造工艺,用于生产不含动物源性物质的ccc超螺旋质粒DNA,并使用毛细管凝胶电泳(CGE)进行质量控制和稳定性评估 | 首次实现了符合良好制造规范(GMP)的制药级质粒生产,并首次在DNA存储实验中评估了不同质粒形式的物理稳定性 | NA | 开发一种新的大规模制造工艺,用于生产高质量的ccc超螺旋质粒DNA,适用于研究和临床应用 | ccc超螺旋质粒DNA的生产工艺及其质量控制 | NA | NA | 毛细管凝胶电泳(CGE) | NA | DNA | NA |
11 | 2024-08-07 |
Controlled assembly of dendrimer-like DNA
2004-Jan, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/nmat1045
PMID:14704783
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research paper | 本文展示了从Y形DNA(Y-DNA)控制组装成树枝状DNA(DL-DNA)的过程 | 首次展示了从Y形DNA控制组装成树枝状DNA的过程,并证明了其稳定性和几乎单分散的特性 | NA | 探索DNA作为通用材料而非仅限于遗传材料的潜力 | 树枝状DNA(DL-DNA)的合成与控制组装 | DNA nanotechnology | NA | NA | NA | NA | NA |