生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 9 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Hairpin formation in DNA computation presents limits for large NP-complete problems
2003-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00145-x
PMID:14643488
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算中发夹结构的形成对解决大型NP完全问题的限制 | NA | 本文指出当前DNA计算范式无法解决大型NP完全问题，因为发夹结构的稳定性限制了问题规模 | 研究DNA计算中发夹结构的稳定性及其对解决NP完全问题规模的影响 | 发夹结构的稳定性和其在DNA计算中的概率 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-08-07 |
Solving the 3-SAT problem based on DNA computing
2003 Nov-Dec, Journal of chemical information and computer sciences
DOI:10.1021/ci034113o
PMID:14632435
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的新算法来解决3-SAT问题，该算法基于Sakamoto等人提出的文字串策略，并通过仿真结果展示了计算过程中产生的最大文字串数量大幅减少，且文字串长度也最多从m减少到n。 | 本文提出的新算法基于Sakamoto等人的文字串策略，有效减少了计算过程中产生的最大文字串数量和长度。 | NA | 解决3-SAT问题 | 3-SAT问题 | 计算理论 | NA | DNA计算 | NA | 文字串 | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
[Progress in molecular biology study of DNA computer]
2003-Sep, Yi chuan xue bao = Acta genetica Sinica
PMID:14577383
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研究论文 | 本文介绍了DNA计算机的基本原理、应用及其与基因组研究的重要关系 | DNA计算机具有大规模并行计算能力和潜在的巨大数据存储容量，被视为计算领域的革命性进展 | NA | 探讨DNA计算机的研究进展及其在分子生物学和计算科学中的应用 | DNA计算机及其相关技术 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
A multi-investigator/institutional DNA bank for AIDS-related human genetic studies: AACTG Protocol A5128
2003 Sep-Oct, HIV clinical trials
DOI:10.1310/MUQC-QXBC-8118-BPM5
PMID:14583845
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研究论文 | 本文介绍了AACTG协议A5128，一个多调查者/机构用于艾滋病相关人类遗传研究的DNA库的开发和实施 | 该研究通过建立一个多学科团队，解决了DNA库在保密性、伦理和监管问题上的挑战，并允许未来分析基因型-表型关系 | NA | 旨在通过分析HIV感染者中的等位基因变异与临床结果之间的关系，以促进人类基因组学知识的应用 | HIV感染者的DNA样本及其临床数据 | 人类遗传学 | 艾滋病 | DNA提取 | NA | DNA | 已招募4,247名参与者，其中82%为男性，56%为白人，26%为非裔美国人，15%为西班牙裔，代表324个不同AACTG研究和子研究的11,424个案例 |
| 5 | 2024-08-07 |
Beyond input-output computings: error-driven emergence with parallel non-distributed slime mold computer
2003-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00085-6
PMID:14563567
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研究论文 | 本文提出了一种可实现的生物计算实验方案，以激发复杂系统的涌现特性，使用真正的黏菌Physarum polycephalum作为黏菌计算机 | 文章通过修改基本细胞自动机来解决并行计算中的全局同步问题，并讨论了通过不提供所有可能结果或明确解决方案寻求来解决问题的可能性 | NA | 探索从错误中衍生的涌现现象在新型计算和计算机新用途中的关键重要性 | 真正的黏菌Physarum polycephalum及其在计算中的应用 | 计算机科学 | NA | 基本细胞自动机 | NA | NA | 单个黏菌个体 |
| 6 | 2024-08-07 |
Photochemical ligation of DNA "words" for DNA computing
2003, Nucleic acids research. Supplement (2001)
DOI:10.1093/nass/3.1.183
PMID:14510441
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研究论文 | 本文展示了含有5-乙烯尿嘧啶（(V)U）的寡脱氧核苷酸（ODNs）的光化学DNA计算，通过(V)U介导的可逆DNA光连接实现了多“DNA词”的计算。 | 开发了一种基于(V)U介导的可逆DNA光连接的新MARK和UNMARK操作，用于多词DNA计算。 | NA | 展示光化学DNA计算在解决小规模满足性问题（SAT问题）中的应用。 | 含有5-乙烯尿嘧啶的寡脱氧核苷酸及其在DNA计算中的应用。 | NA | NA | 光化学DNA连接 | NA | DNA序列 | 涉及三个串联的DNA词 |
| 7 | 2024-08-07 |
DNA library design for molecular computation
2003, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/106652703321825973
PMID:12804092
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研究论文 | 提出了一种用于分子计算的DNA库设计的新方法 | 该方法考虑了DNA链在复杂结构中如发夹、内部环或凸环的杂交能力，并基于热力学数据计算杂交体的稳定性 | NA | 实现DNA分子中二进制信息的编码，并在大量不同分子中实现完美匹配的DNA寡聚体与错配之间的实际区分 | DNA库的设计及其在分子计算中的应用 | 分子生物学 | NA | 分子生物学工具 | 动态规划算法 | DNA序列 | 十二位DNA库 |
| 8 | 2024-08-07 |
The general form of 0-1 programming problem based on DNA computing
2003-Jun, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00053-4
PMID:12753938
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研究论文 | 本文利用基于表面化学的荧光标记技术，通过将DNA计算应用于编程问题，解决了0-1规划问题的一般形式 | 本文首次尝试将DNA计算应用于0-1规划问题，并提出了一种基于荧光标记技术的新方法 | NA | 解决0-1规划问题的一般形式 | 0-1规划问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Measurement of the number of molecules of a single mRNA species in a complex mRNA preparation
2003-Apr-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1006/jtbi.2003.3211
PMID:12713944
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研究论文 | 本文设计了一种方法来计算复杂mRNA制备中单一mRNA种类的分子数量 | 将定量问题转化为定性问题，通过将相同分子种类的单个分子转化为新的不同分子种类并进行放大 | 第二种策略受限于只能处理几百个单个分子 | 解决使用DNA芯片进行杂交实验以确定mRNA表达和浓度（基因表达谱）时数据标准化的未解决问题 | 单一mRNA种类的分子数量 | NA | NA | DNA计算中常用的多聚连接器方法 | NA | mRNA | 第一种方法可处理多达10^6个单个分子，第二种方法可处理几百个单个分子 |